人間と同じように、クジラも哺乳類です。 したがって、肺を持ち、水面で空気を呼吸します。 魚のようにエラで水中の酸素を取り出すことはできません。 鯨の呼吸は「意識的」であり、その機能は中枢神経系（CNS）の随意的な制御下にある。 クジラは、私たちが飢えないように意識的に食事をするのと同じように、呼吸のために水面に上がることを選択します！
深い眠りの中にいても呼吸を続ける人間と違い、鯨類は呼吸を制御するために覚醒状態を維持するために、部分的に起きていなければなりません。 イルカを対象に行われた研究により、脳の半分だけが「休息」し、残りの半分がこの覚醒状態を確保していることが実証されました。 また、この技術によって、脳は周囲の捕食者や障害物、他の動物に注意を払い続けることができるのです。 また、鯨の頭頂部にある鼻孔は、人間の鼻孔に相当する部分であるが、この孔も制御している。 鯨は呼吸をするたびに、鼻孔の周りの筋肉を収縮させ、自発的にこのヒダを開いているのだ。
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