Vaterova papila, jakkoli je zmenšená, tvoří nidus pro řadu klinických poruch. Vzhledem k jejímu klíčovému umístění na soutoku žlučovodů a pankreatických vývodů vede mnoho těchto klinických poruch k znemožnění odtoku sekretu z jater a slinivky. Většina symptomatických papilárních poruch se tak projevuje poměrně předvídatelným a monotónním konglomerátem příznaků. Mezi běžné klinické projevy papilárních poruch patří bolesti břicha, žloutenka, horečka, pruritus a pankreatitida. Vzácně se může vyskytnout i krvácení do zažívacího traktu vedoucí k anémii a úbytku hmotnosti. Nástup ERCP oživil zájem o onemocnění papily. Hlavní duodenální papila je nyní přístupnější než kdykoli předtím. Endoskopista může papilu zobrazit během několika minut a odebrat vhodný vzorek tkáně pomocí různých technik biopsie. Definitivní diagnóza je tak možná u většiny pacientů s papilárními nádory. Spolu s ERCP nám miniaturizace perfuzního systému s minimální poddajností umožnila přesně vyhodnotit dynamiku Oddiho svěrače (SO). To nám následně poskytlo řadu informací o fyziologii Oddiho svěrače. ERCP manometrie navíc vedla k obnovení zájmu o dysfunkci SO, zejména o papilární stenózu. V poslední době bylo identifikováno několik charakteristických manometrických abnormalit. A konečně zavedení endoskopické sfinkterotomie (ES) před téměř deseti lety otevřelo novou kapitolu v terapeutickém přístupu k papilárním poruchám. Zatímco zpočátku se tato technika uplatňovala při léčbě kamenů ve společných žlučových cestách u pacientů po cholecystektomii, kteří představovali vysoké operační riziko, indikací k ES v posledním desetiletí neustále přibývalo. Zkušenosti získané v průběhu let nás vedly k přesvědčení, že ES je stejně účinná při léčbě různých papilárních poruch, včetně choledochoduodenální píštěle, choledochokély, papilárních tumorů a dysfunkce SO. V poslední době se jako další užitečná terapeutická modalita objevily další pomocné postupy, jako je zavedení endoprotézy. Ukázalo se, že tyto vnitřní biliární stenty jsou vhodné pro zavedení biliární drenáže u ampulárních nádorů, pokud je operační přístup považován za rizikový.