În martie 2004, patru subspecii de vulpe insulară au fost clasificate ca specii pe cale de dispariție protejate la nivel federal: vulpea insulară Santa Cruz, vulpea insulară Santa Rosa, vulpea insulară San Miguel și vulpea insulară Santa Catalina. Începând din 2013, IUCN clasifică întreaga specie ca fiind aproape amenințată, o îmbunătățire față de statutul anterior de „în pericol critic de dispariție”. Un declin al populațiilor de vulpi insulare a fost identificat în anii 1990. Pe insula San Miguel, declinul a început în 1994, iar populația a scăzut de la 450 de adulți la 15 până în 1999. Scăderi similare ale populației au fost descoperite și pe insula Santa Cruz. Pe insula Santa Cruz, populația a scăzut de la 2.000 de adulți în 1994 la mai puțin de 135 în 2000, iar pe insula Santa Rosa, unde este posibil ca vulpile să fi numărat mai mult de 1.500 de exemplare în 1994, dar s-au redus la 14 animale în 2000. În 2004, existau 38 de vulpi pe insula San Miguel, toate în captivitate; 46 de vulpi în captivitate pe insula Santa Rosa și șapte în sălbăticie (prădarea vulturului auriu a împiedicat eliberarea vulpilor captive în sălbăticie); insula Santa Cruz avea 25 de vulpi în captivitate și o populație sălbatică stabilă de aproximativ 100 de vulpi.
Prădarea vulturului auriu, descoperită atunci când vulpile au fost monitorizate cu radiocollar și monitorizate, s-a dovedit a fi cauza ratelor ridicate de mortalitate. Vulturul auriu era un vizitator neobișnuit în Channel Islands înainte de anii 1990, conform datelor colectate de Dr. Lyndal Laughrin de la University of California Santa Cruz Island Reserve, iar primul cuib de vultur auriu a fost înregistrat pe insula Santa Cruz în 1999. Biologii propun că este posibil ca vulturul să fi fost atras pe insule în anii 1960, după declinul vulturului pleșuv. Vulturul auriu a înlocuit vulturul pleșuv și a început să se hrănească cu porci sălbatici în urma devastării populației locale de vulturi pleșuvi din cauza expunerii la DDT în anii 1950 – vulturul pleșuv ar fi descurajat vulturul auriu să se stabilească pe insule în timp ce acesta se hrănea cu pește.
Porcii sălbatici din Santa Rosa au fost exterminați de către Serviciul Parcurilor Naționale la începutul anilor 1990, ceea ce a eliminat una dintre sursele de hrană ale vulturului auriu. Vulturul auriu a început apoi să se hrănească cu populația de vulpi de pe insulă. Porcii sălbatici de pe insula Santa Cruz și căprioarele și elanii de pe insula Santa Rosa au fost introduși cu aproape 70 de ani înainte de declinul vulpilor de pe insulă, prin urmare, este foarte probabil ca vulturul auriu să nu fi căutat aceste animale ca pradă alternativă. Acest lucru s-a întâmplat cel mai probabil ca urmare a unui proces cunoscut sub numele de concurență aparentă: în acest proces, un prădător, cum ar fi vulturul auriu, se hrănește cu cel puțin două prăzi, de exemplu, vulpea insulară și porcii sălbatici. O pradă este adaptată la o presiune ridicată a prădătorilor și susține populația de prădători (de exemplu, porcii), în timp ce cealaltă pradă (de exemplu, vulpea insulară) este slab adaptată la prădători și scade ca urmare a presiunii prădătorilor. S-a propus, de asemenea, că eliminarea completă a vulturilor aurii ar putea fi singura acțiune care ar putea salva trei subspecii de vulpi insulare de la dispariție. Cu toate acestea, porcii de pe insula Santa Cruz au fost uciși de către Nature Conservancy în ideea că aceștia atrăgeau vulturii spre vulpi.
Boli sau paraziți introduși pot devasta populațiile de vulpi insulare. Deoarece vulpea insulară este izolată, nu are imunitate la paraziții și bolile aduse de pe continent și sunt deosebit de vulnerabile la cele pe care le poate purta câinele domestic. O epidemie de bolii de Carré în 1998 a ucis aproximativ 90% din vulpile din insula Santa Catalina, reducând populația de la 1.300 la 103 în 2000. A fost inițiat un program de vaccinare pentru a proteja vulpile din Insula Catalina împotriva bolii de carii canine. După mai mulți ani de capturare atentă a vulpilor și de vaccinare a acestora împotriva bolii de Carré și a rabiei, populația lor a ajuns la 1.717 în 2015, depășind populația de dinaintea bolii de aproximativ 1.300 de exemplare. Oamenii de știință cred că virusul bolii de Carré a fost introdus de un câine de companie sau de un raton de pe continent, care a făcut autostopul pe o barcă sau pe un șlep. Pentru a elimina riscul de îmbolnăvire, animalele de companie nu sunt permise în Parcul Național Channel Islands.
Diminuarea ofertei de hrană și degradarea generală a habitatului din cauza speciilor de mamifere introduse, inclusiv pisici sălbatice, porci, oi, capre și bizoni americani, ultimul fiind introdus pe insula Catalina în anii 1920 de către o echipă de filmare de la Hollywood care filma un western, a avut, de asemenea, un efect negativ asupra populațiilor de vulpi.
Vulpilele amenință o populație de zburătoare de pe Insula San Clemente, grav amenințată cu dispariția, care locuiește pe Insula San Clemente. Populația de vulpi de pe insulă a fost afectată în mod negativ de capturarea și eliminarea sau eutanasierea vulpilor de către Marina Statelor Unite. Începând cu anul 2000, Marina a utilizat diferite strategii de gestionare: prinderea cu capcane și reținerea vulpilor în timpul sezonului de reproducere a greierilor, instalarea unui sistem de garduri electrice în jurul habitatului greierilor și utilizarea de sisteme de coliere cu electroșocuri. Odată cu refacerea treptată a populației de stârci pe insula San Clemente, Marina nu mai controlează vulpile.
Populațiile de vulpi de pe insula Santa Cruz, de pe insula San Miguel și de pe insula Santa Rosa și-au revenit în mod dramatic de la minimele înregistrate în 2000, de 70 de exemplare pentru vulpile de pe insula Santa Cruz și de 15 exemplare pe insulele San Miguel și Santa Rosa. Catalina Island Conservancy conduce un program de reproducere în captivitate pe insula Catalina. La 14 septembrie 2012, US Fish and Wildlife Service a publicat un proiect de plan de redresare pentru vulpea de pe insula San Miguel, vulpea de pe insula Santa Rosa, vulpea de pe insula Santa Cruz și vulpea de pe insula Santa Catalina. Până în 2012, Catalina Island Conservancy a stabilit că existau 1.500 de vulpi din insula Santa Catalina și că populația era stabilă. În 2015, existau 520 de vulpi indigene pe insula San Miguel și 874 pe insula Santa Rosa, potrivit grupului Friends of the Island Fox. Numărul vulpilor de pe insula Santa Cruz crescuse la 1.750. US Fish and Wildlife Service a recomandat scoaterea de pe listă a vulpilor de pe insulele Santa Cruz, San Miguel și Santa Rosa, în cadrul unui succes major al Endangered Species Act. Cu toate acestea, ei recomandă ca insula Santa Catalina să fie reclasificată de la „pe cale de dispariție” la „amenințată”, din cauza amenințării bolilor pe această insulă foarte vizitată.
Alte două subspecii de pe San Nicolas și San Clemente nu sunt pe cale de dispariție. Existau 263 de vulpi pe San Nicolas și 1.230 de vulpi pe San Clemente.
Pentru că Insulele Channel sunt aproape în întregime deținute și controlate fie de Catalina Island Conservancy, The Nature Conservancy, fie de guvernul federal, vulpea are șansa de a primi protecția de care are nevoie, inclusiv supravegherea constantă de către oficialii interesați, fără amenințarea continuă a invadării habitatului său de către oameni.
Vulpea nu a persistat pe Insula Anacapa deoarece nu are o sursă sigură de apă dulce; Insula Santa Barbara este prea mică pentru a susține nevoile de hrană ale unei populații viabile de vulpi.
Rene Vellanoweth, un arheolog, crede că depresia de consangvinizare poate fi gestionată prin amestecarea populațiilor diferitelor subspecii de vulpi de pe insulă, la fel cum făceau popoarele indigene, mutându-le de pe o insulă pe alta, creând o diversitate genetică mai mare și ajutându-le în procesul de recuperare.
.