În zonele în care nu se practică irigarea, diferitele zone de viață vegetală pot fi împărțite aproximativ în funcție de cantitatea de precipitații.
Pădurea tropicală se găsește de-a lungul diviziunii Nil-Congo, în părți din platoul lacurilor și în sud-vestul Etiopiei. Căldura și precipitațiile abundente produc păduri dese, cu o mare varietate de arbori și plante tropicale, printre care arborele de abanos, bananierul, cauciucul, bambusul și arbustul de cafea. Pădurile mixte de pădure și pășuni (savană), caracterizate printr-o creștere rară de arbori cu frunziș subțire de înălțime medie și o acoperire a solului cu iarbă și ierburi perene, se întâlnesc în părți mari din Platoul Lacurilor, în părți din Platoul Etiopiei, în zona care mărginește Nilul Albastru în apropiere de Al-Ruṣayriṣ și în sudul regiunii râului Al-Ghazāl.
În câmpiile sudaneze, predomină un amestec de tufișuri subțiri, arbori spinoși și pășuni deschise. Această zonă este mlăștinoasă în timpul sezonului ploios, în special în regiunea Al-Sudd din centrul Sudanului de Sud, care are o suprafață de aproape 160.000 de kilometri pătrați. Vegetația de acolo include papirusul, ierburi înalte asemănătoare bambusului, ambuteiajul de stuf sau turor, salata de apă, o specie de convolvulus și jacintul de apă sud-american.
La nord de 10° latitudine nordică se găsește o centură de savană spinoasă sau un ținut de arbuști de livadă, caracterizată de mici arbori împrăștiați, tufișuri spinoase și – după ploaie – ierburi și ierburi. La nord de aceasta, însă, precipitațiile scad, iar vegetația se subțiază, astfel încât peisajul este presărat cu mici arbuști spinoși, majoritatea acacias. De la Khartoum spre nord există un adevărat deșert, cu precipitații rare și neregulate și fără nicio vegetație permanentă, cu excepția câtorva arbuști butucănoși. După ploaie, pot fi împrăștiate ierburi și ierburi mici de-a lungul liniilor de drenaj, dar acestea dispar în câteva săptămâni. În Egipt, vegetația din apropierea Nilului este aproape în întregime rezultatul irigațiilor și al cultivării.
În sistemul Nilului se găsesc numeroase varietăți de pești. Printre cei notabili dintre cei care se găsesc în sistemul inferior al Nilului se numără bibanul de Nil (care poate atinge o greutate de peste 175 de lire sterline), bolti (o specie de Tilapia), barbul, mai multe specii de pește pisică, peștele-elefant și peștele-tigru sau leopardul de apă. Cele mai multe dintre aceste specii, precum și Haplochromis, asemănător cu sardinelul, peștele plămân și peștele noroi se găsesc până în amonte, în Lacul Victoria. Anghila comună pătrunde până în sud, la Khartoum, iar anghila spinoasă se găsește în Lacul Victoria.
Pictat special pentru Encyclopædia Britannica de Tom Dolan, sub supravegherea lui Loren P. Woods, Muzeul de Istorie Naturală din Chicago
Crocodilul de Nil, care se găsește în cele mai multe părți ale fluviului, nu a pătruns încă în lacurile din bazinul superior al Nilului. Alte reptile găsite în bazinul Nilului includ broasca țestoasă cu carapace moale, trei specii de șopârle monitor și aproximativ 30 de specii de șerpi, dintre care mai mult de jumătate sunt veninoase. Hipopopotamul, odinioară comun în tot sistemul Nilului, se găsește acum doar în regiunea Al-Sudd și în sud.
© Digital Vision/Getty Images
Multe bancuri de pești care se hrăneau în apele Nilului în Egipt în timpul sezonului de inundații au fost reduse sau au dispărut de la construcția Marelui Baraj Aswan. Majoritatea speciilor de pești de pe Nil erau migratoare, iar barajul i-a împiedicat pe mulți dintre ei să migreze spre lacul Nasser. Diminuarea numărului de hamsii din estul Mediteranei a fost, de asemenea, atribuită reducerii serioase a fluxului de nutrienți din apă din cauza barajului. Lacul Nasser, cu toate acestea, a fost transformat într-o zonă de pescuit comercial, unde bibanul de Nil și alte specii prosperă.
.