Fondată la 31 martie 1782, Misiunea San Buenaventura este a noua în lanțul de misiuni, ultima care a fost fondată în timpul vieții părintelui Serra și una dintre cele șase pe care acesta le-a dedicat personal. Misiunea a fost construită ca parte a secțiunii din Canalul Santa Barbara, care includea misiunile din Santa Barbara și La Purísima, și El Presidio din Santa Barbara.
Părinții, care aveau deja trei misiuni în nordul și trei în partea de sud a Californiei, se temeau de o revoltă indiană în secțiunea centrală a statului. Ei au crezut că o revoltă indiană ar putea fi devastatoare, din cauza terenului din zonă. Munții din zona Canalului Santa Barbara coboară grațios spre ocean, lăsând puțin loc de trecere. Misionarii se temeau că indienii furioși ar putea diviza cu ușurință statul, limitându-i pe spanioli la comunicarea pe mare. Revolta nu a avut loc niciodată, iar Misiunea San Buenaventura a continuat ca un mare producător agricol.
Indienii din zonă erau Chumash, care acopereau zona de la Ventura spre nord până la San Luis Obispo. Chumash au fost cei mai avansați dintre toate triburile misiunii. Folosind canoe, cum ar fi această replică a canoei din scândură, Chumash călătoreau adesea spre Insulele Canalului Santa Barbara, la o distanță de până la 65 de mile de continent. Chumash au excelat în confecționarea coșurilor, o măsură folosită frecvent de spanioli pentru a judeca inteligența unui trib indian. Indienii foloseau coșurile pentru a găti, a prinde pește și a transporta apă.
Sub conducerea lui Padre Cambon, băștinașii au construit un apeduct de șapte mile care a adus apa din râul Ventura la această clădire de filtrare a apei. Acesta a fost numit în mod corespunzător el caballo, care înseamnă „cal” în spaniolă, deoarece se spune că gura de scurgere semăna cu un cap de cal. El caballo a inspirat mai târziu teroare și dispreț atunci când a fost transformat în închisoare.
Unice pentru Misiunea San Buenaventura sunt aceste clopote din lemn. Ele erau folosite în timpul Săptămânii Sfinte, între Duminica Floriilor și Paște, în timp ce clopotele de metal erau tăcute. Deși sunt cu siguranță originale, originile lor sunt un mister.
După o serie de cutremure și un val de maree care le-a însoțit în 1812, biserica a fost frumos restaurată; ea conține un crucifix vechi de 400 de ani din Filipine. În centru, deasupra tabernacolului, se află Sfântul Bonaventura, patronul misiunii. Biserica evidențiază, de asemenea, un sanctuar al Nuestra Señora de Guadalupe.
.