Stocarea țesuturilor FFPE

Eșantioanele FFPE pot fi stocate în spitale, biobănci și centre de cercetare. Unitățile de depozitare păstrează adesea înregistrări cu privire la modul în care a fost colectat țesutul, la procedurile de conservare și la informațiile demografice (cum ar fi, dar fără a se limita la: originea, durata, vârsta, etnia, sexul și stadiul bolii) ale donatorului. Informațiile demografice reprezintă un factor important în cercetare și în studiile clinice. Eșantioanele FFPE care sunt conservate în mod corespunzător sunt foarte valoroase și pot fi păstrate la temperatura camerei pentru o perioadă lungă de timp.

Aplicații

Eșantioanele FFPE sunt importante, deoarece sunt adesea folosite în:

a) Imunohistochimie

Eșantioanele FFPE secționate sunt montate pe o lamă, scăldate într-o soluție care conține anticorpi și apoi colorate astfel încât să poată fi văzute mai clar. Această metodă este importantă pentru medicii și cercetătorii care caută patologii în țesuturi, cum ar fi Alzheimer sau cancer.

b) Oncologie

Eșantioanele FFPE sunt vitale în domeniul oncologiei, deoarece țesuturile tumorale au morfologii caracteristice care permit cercetătorilor să caute anumite proteine. Aceste proteine sunt apoi folosite pentru a ajuta la evaluarea tratamentului și a diagnosticului.

c) Hematologie

În studiul sângelui și al tulburărilor acestuia, probele FFPE sunt importante pentru determinarea anomaliilor și descoperirea de leacuri. Eșantioanele pot fi utilizate în studii legate de regenerarea țesuturilor, genetică și toxicologie.

d) Imunologie

Eșantioanele FFPE de la un donator cu boală autoimună ajută la determinarea cauzei și la dezvoltarea unei terapii pentru această afecțiune.

Complicații sau limitări

Una dintre posibilele limitări ale procesului de fixare cu ajutorul formalinei este potențiala denaturare a proteinelor prezente în țesut, ceea ce le face nedetectabile pentru anticorpi. Pentru a compensa această problemă, au fost dezvoltate tehnici de recuperare a antigenului. Tehnica de recuperare a antigenului recuperează în mod specific ADN, ARN și proteine din probele FFPE. Pentru ca această metodă să funcționeze, calitatea probelor FFPE este esențială. Există, de asemenea, problema că nu există o procedură standard care să fie utilizată în prelucrarea preanalitică, cum ar fi fixarea și izolarea ADN-ului. Acest lucru înseamnă că diferențele minore, cum ar fi utilizarea diferită a instrumentelor, manipularea probelor și metodologia, pot duce la variații care afectează calitatea ADN-ului și rezultatele studiului. Unii dintre factorii care s-au dovedit a afecta rezultatele studiilor din probele FFPE sunt:

  1. Înregistrarea incorectă a protocolului de fixare

  2. Variație în timpul de fixare

  3. Temperatura în timpul fixare

  4. Condiții de păstrare a probelor FFPE

Controlul calității

Pentru a asigura cea mai bună calitate a probelor FFPE, cei care colectează și depozitează aceste probe ar trebui să:

  1. Să respecte standardele etice și legale.

  2. Să țină o evidență clară și exactă a donatorilor.

  3. Furnizează informații cu privire la procesul de prelevare și colectare a probelor

  4. Să fie supravegheat de un patolog autorizat în timpul colectării probelor

  5. Să aibă un lanț de custodie complet

  6. Lucrează numai cu o rețea de distribuitori atent selecționați care furnizează în mod constant eșantioane de înaltă calitate și precizie

Tesuturi proaspete congelate

Tesuturile proaspete congelate sunt eșantioane care sunt conservate cu ajutorul azotului lichid printr-o metodă cunoscută sub numele de „congelare rapidă”. Aceste specimene sunt apoi depozitate într-un congelator care este setat la o temperatură mai mică de -80 grade Celsius. Țesutul proaspăt congelat are aplicații diferite față de eșantioanele FFPE, deoarece acestea pot fi utilizate și în studii de morfologie nativă sau în analize moleculare.

Eșantioane FFPE vs. țesut proaspăt congelat

Tesutul FFPE și țesutul proaspăt congelat au avantajele și dezavantajele lor. Acestea sunt două tipuri diferite de probe care au utilizări diferite în funcție de cerințele cercetării sau ale studiului clinic.

  1. Blocurile FFPE sunt foarte dure și pot fi ușor depozitate la temperatura camerei timp de zeci de ani, fără a fi nevoie de echipamente speciale, ceea ce face ca acest tip de eșantion de țesut să fie foarte eficient din punct de vedere al costurilor.

  2. Există o arhivă mare de eșantioane FFPE disponibile pentru cercetători datorită ușurinței asociate cu depozitarea acestora.

  3. Eșantioanele FFPE au fost folosite timp de zeci de ani, ceea ce le face incredibil de familiare pentru patologi.

  4. Tesutul proaspăt congelat este mult mai potrivit pentru analiza proteinelor native, reacția în lanț a polimerazei și secvențierea ADN de generație următoare.

  5. Tesutul proaspăt congelat asigură conservarea ADN-ului, ARN-ului și a proteinelor native.

  6. Tesuturile proaspete congelate necesită echipamente specializate pentru depozitare. Aceasta înseamnă că defecțiunile mecanice, întreruperile de curent și neglijența pot afecta calitatea probelor.

1) Ward T. The importance of proper formalin fixation of FFPE samples. Personalis. Accesat la 19/6/2018. https://www.personalis.com/importance-proper-formalin-fixation-ffpe-specimens/

2) Doiron L. 5 reguli de control al calității pentru băncile de țesuturi oncologice. Folio Conversant. Accesat 6/19/2018. http://www.conversantbio.com/blog/bid/339034/5-Quality-Control-Rules-for-Cancer-Tissue-Banks

3) FFPE vs mostre de țesut congelate. BioChain. Accesat 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/ffpe-vs-frozen-tissue-samples/

4) Ce este țesutul FFPE și care sunt utilizările sale. BioChain. Accesat 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/what-is-ffpe-tissue/

By: adminPosted on

Lasă un răspuns

Adresa ta de email nu va fi publicată.