Foraminifera – The World Foraminifera Database

Numero attuale di specie valide recenti registrate: 8 887
Numero attuale di specie fossili valide registrate: 40 130
Numero attuale di specie totali valide (fossili + recenti) registrate: 48 271

The World Foraminifera Database

Questo database mondiale di tutte le specie di Foraminifera mai descritte (recenti e fossili), è parte del World Register of Marine Species (WoRMS), un’iniziativa globale per fornire un registro di tutti gli organismi marini.

Ricerca nel database (fossile e/o recente)

L’impostazione predefinita è la ricerca nell’intero database delle specie fossili e recenti. Se vuoi cercare solo i taxa recenti (viventi) allora spunta la casella ‘extant’ nella finestra Taxon Search.

Cosa sono i Foraminifera?

I Foraminifera (‘hole bearers’), foraminiferi o forami in breve, sono un grande phylum di protozoi ameboidi (monocellulari) con pseudopodi reticolati, sottili filamenti di citoplasma che si ramificano e si fondono per formare una rete dinamica. Di solito producono un test (o guscio) che può avere una o più camere, e sono fatti di carbonato di calcio (CaCO3) o grani minerali o altre particelle incollate insieme. Le prove sono di solito di dimensioni inferiori a 0,5 mm, ma le più grandi possono essere fino a 20 cm di diametro. I foraminiferi sono tra i gruppi di organismi più abbondanti e scientificamente importanti. I test dei foraminiferi planctonici morti di recente sono così abbondanti che formano una spessa coperta su un terzo della superficie della Terra (come Globigerina ooze sul fondo dell’oceano). I foraminiferi sono essenzialmente protozoi marini e di estuario che vivono in tutti gli ambienti dalle maggiori profondità fino al più alto livello di marea astronomica e dall’equatore ai poli.

L’importanza dei foraminiferi deriva dall’uso delle loro prove fossili nella biostratigrafia, negli studi di paleoambiente e nella geochimica isotopica. La loro ubiquità nella maggior parte delle rocce sedimentarie marine, spesso come grandi, ben conservati, diversi assemblaggi, ha fatto sì che siano il gruppo di fossili più studiato in tutto il mondo. Poiché i foraminiferi recenti hanno attirato poco interesse da parte dei biologi, i paleontologi sono stati costretti a intraprendere la maggior parte degli studi, compresa la ricerca genetica, sulla fauna vivente.

Questo sito ha i seguenti obiettivi:

• fornire un catalogo delle specie mondiali di foraminiferi
• promuovere la stabilità nella nomenclatura dei foraminiferi
• fare da strumento per revisioni tassonomiche superiori e monografie regionali

Classificazione superiore

La lista delle specie attualmente accettateè completa almeno al 90% per le specie recenti, ma la tassonomia di molti taxa ha ancora bisogno di una revisione e le nuove specie descritte saranno aggiunte il più presto possibile dopo la pubblicazione, un compito che sarà intrapreso continuamente dai redattori. I generi fossili e i taxa superiori sono per lo più completi, ma le specie fossili richiederanno molti anni per essere aggiunte. Attualmente non c’è un ampio consenso disponibile per la classificazione superiore dei Foraminifera. Qui, la classificazione data in Loeblich e Tappan (1987 e 1992) è per lo più utilizzata per i taxa calcarei e Kaminski (2004) è seguita per i taxa agglutinati, ma la classificazione di livello superiore dei Foraminifera è in uno stato di revisione ed è stata aggiornata per conformarsi ai risultati basati sulla sequenza genetica fino ad oggi di Pawlowski et al. (2013) e Holzmann e Pawlowski (2017). Ulteriori risultati delle indagini filogenetiche molecolari in corso si spera contribuiranno a stabilizzare il sistema tassonomico in futuro.

• Holzmann, M. and Pawlowski, J. (2017). Una classificazione aggiornata dei foraminiferi rotaliidi basata sulla filogenesi del DNA ribosomiale. Marine Micropaleontology 132, 18-34.
• Kaminski, M. A. (2004). La classificazione dell’anno 2000 dei foraminiferi agglutinati. In: M. K. Bubik, Ma. (ed). Atti del sesto workshop internazionale sui Foraminiferi Agglutinati. Pubblicazione speciale della Fondazione Grzybowski. Pp. 237-255.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1987). “Generi di foraminiferi e loro classificazione”. Van Nostrand Reinhold, New York.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1992). Stato attuale della classificazione dei foraminiferi. In “Studi sui foraminiferi bentonici. Atti del quarto simposio sui foraminiferi bentonici, Sendai, 1990”. (Y. Takayanagi, e T. Saito, Eds.), pp. 93-102. Tokai University Press, Tokyo.
• Pawlowski, J., Holzmann, M., Tyszka, J. (2013). Nuova classificazione sovraordinata dei Foraminifera: le molecole incontrano la morfologia. Marine Micropaleontology 100, 1-10

Steering Committee

Un comitato direttivo fornisce la supervisione internazionale e favorisce la compilazione e la razionalizzazione del Banca dati mondiale dei foraminiferi.

I membri dello steering committee sono:

• Tomas Cedhagen, Danimarca
• Peter Frenzel, Germania
• Bruce W. Hayward, Nuova Zelanda (convenor)
• Martin Langer, Germania
• François Le Coze, Francia
• Briony Mamo, Hong Kong, Cina
• Willem Renema, Paesi Bassi
• Daniel Vachard, Francia

Editori

Inseriscono dati e prendono decisioni tassonomiche nei gruppi di cui sono responsabili:

• Hayward, Bruce: Foraminifera

• Encarnação, Sarita Camacho da: Foraminifera
• Le Coze, François: Foraminifera
• Mamo, Briony: Foraminifera
• Vachard, Daniel: Foraminifera

Gli editori sono responsabili delle voci, della decisione sulla validità dei nomi. Correzioni e omissioni possono essere indirizzate a uno dei due editori.

L’accettazione di una specie nel database è una decisione editoriale, ma riconosciamo che tali decisioni devono essere riesaminate frequentemente alla luce di nuove informazioni. Se non siete d’accordo con le decisioni di sinonimia o le assegnazioni dei generi, per favore fateci avere la vostra assegnazione ben argomentata e corretta. Solo i redattori possono aggiungere o modificare i dati, ma chiunque può caricare immagini con identificazioni e informazioni sulla posizione, anche se queste saranno controllate e possono essere modificate dai redattori

Storia del World Foraminifera Database

Il World Foraminifera Database iniziò come lista di specie recenti europee compilata da Tomas Cedhagen e Onno Gross. Nel 2010 sono state aggiunte la lista delle specie recenti del Golfo del Messico compilata da Barun Sen Gupta e colleghi e la lista delle specie moderne della Nuova Zelanda compilata da Bruce Hayward e colleghi.

• Gross, O. (2001). Foraminifera, in: Costello, M.J. et al. (Ed.) (2001). Registro europeo delle specie marine: una check-list delle specie marine in Europa e una bibliografia di guide alla loro identificazione. Collection Patrimoines Naturels, 50: 60-75.
• Hayward, B.W., Tendal, O.S., Carter, R., Grenfell, H.R., Morgans, H.E.G., Scott, G.H., Strong, C.P., Hayward, J.J. (2012). Phylum Foraminifera. Foraminiferi e xenofori. In: Gordon, D.P. (ed.). Nuova Zelanda Inventario della biodiversità: A Species 2000 Symposium Review. Canterbury University Press,. Christchurch. Pp. 242-287
• Sen Gupta, B.K., Smith, L.E., Machain-Castillo, M.L. (2009). Foraminiferi del Golfo del Messico, Pp. 87-129 in Felder, D.L. e D.K. Camp (eds.), Gulf of Mexico-Origins, Waters, and Biota. Biodiversità. Texas A&M Press, College Station, Texas.

Da allora sono stati aggiunti record dal catalogo di Johannes Pignatti dei foraminiferi recenti, da molti importanti atlanti di foraminiferi recenti e da Ellis e Messina Catalogue of Foraminifera. Siamo consapevoli che molti taxa descritti dal 1980 devono ancora essere trovati e aggiunti

Chi ha descritto il maggior numero di specie di Foraminiferi recenti?

• McCulloch – 2429
• Cushman – 1134
• D’Orbigny – 691
• Brady – 398
• Saidova – 394
• Earland – 306

Biblioteca letteraria

La biblioteca letteraria contiene attualmente ~9000 riferimenti, molte delle opere più vecchie sono disponibili come PDF scannerizzati.

Fotogallery

La Photogallery contiene attualmente ~6000 immagini collegate ai record delle specie, per lo più inserite da Tomas Cedhagen dal volume Challenger di Brady e dalle monografie di Cushman, ma anche alcune altre monografie.

Compiti da fare

Il comitato direttivo ha identificato i seguenti compiti che potrebbero essere intrapresi per migliorare l’utilità e il valore del database Forams in WoRMS. I compiti sono stati assegnati a una delle tre liste di priorità percepite. Invitiamo qualsiasi lavoratore che voglia rendere questo database più utile contribuendo a uno qualsiasi dei compiti qui sotto su base volontaria, a contattare il presidente del comitato direttivo, Bruce Hayward via e-mail.

1. Prima priorità

• Raggiungere il 100% dei nomi tassonomici dei foraminiferi formalmente proposti. .
• Aggiungere tutti i nuovi taxa man mano che vengono proposti.
• Aggiornare la tassonomia superiore man mano che viene rivista sulla base delle prove molecolari.
• Aggiornare la tassonomia e le sinonimie dei taxa quando vengono pubblicati nuovi studi molecolari e morfologici completi.
• Raggiungere il 100% di copertura per le immagini dei tipi o degli esemplari verificati di tutti i taxa esistenti accettati

2. Seconda priorità

• Controllare tutte le voci precedenti al 2010 per assicurarsi che non contengano più errori.
• Negoziare i link a immagini/descrizioni tassonomiche affidabili disponibili su siti web istituzionali (di lunga durata).
• Raggiungere il 100% di copertura per le immagini dei tipi o degli esemplari verificati di tutti i taxa fossili accettati
• Assegnare tutti i taxa fossili ad almeno uno o più dei seguenti periodi di tempo: Paleozoico, Triassico, Giurassico, Cretaceo, Paleogene, Neogene.
• Fornire un link sul web o caricare su WoRMS una copia di tutte le pubblicazioni che descrivono nuovi taxa di foraminiferi.
• Utilizzare il database Forams in WoRMS literature sources (attualmente 11.000 voci) come punto di partenza per sviluppare una bibliografia completa delle pubblicazioni mondiali sui foraminiferi.

3. Terza priorità

• Dare intervalli temporali noti (più precisi dei periodi) a tutti i taxa fossili.
• Raggiungere dati di distribuzione geografica globale per tutte le specie esistenti.
• Raggiungere una copertura di distribuzione geografica globale per tutte le specie fossili.

Links ad altri siti di Foriminiferal

Per aiutare il principiante o il non specialista forniamo qui una selezione di links a siti web di foraminiferi per ulteriori informazioni.

• Glossario illustrato dei termini usati nella ricerca sui foraminiferi http://paleopolis.rediris.es/cg/CG2006_M02/index.html
• Tecniche per la preparazione di campioni per lo studio dei foraminiferi in classe http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Snyder&Huber.html
• Fatti dei foraminiferi http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Wetmore.html
• Wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Foraminifera
• Riferimenti sui foraminiferi http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/foramrefs.htm
• Fondazione Cushman per la ricerca sui foraminiferi http://www.cushmanfoundation.org/
• Fondazione Grzybowski http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/
• The Micropalaeontological Society http://www.tmsoc.org/
• University of California Museum of Paleontology – Introduction to foraminifera http://www.ucmp.berkeley.edu/foram/foramintro.html
• University College, London – Foraminifera http://www.ucl.ac.uk/GeolSci/micropal/foram.html
• Cronos foram on-line atlases http://portal.chronos.org/gridsphere/gridsphere?cid=resources
• The Foraminifera.eu Project http://www.foraminifera.eu/
• E-formas http://www.eforams.org
• Molecular Database of Foraminifera http://forambarcoding.unige.ch/
• Biografia di Joseph Cushman http://paleobiology.si.edu/cushman

Citazione

L’uso dei dati del World Foraminifera Database in pubblicazioni scientifiche dovrebbe essere riconosciuto citando come segue:

• Hayward, B.W.; Le Coze, F.; Vachard, D.; Gross, O. (2021). World Foraminifera Database. Accessed at http://www.marinespecies.org/foraminifera on 2021-03-25. doi:10.14284/305

Se i dati del World Foraminifera Database costituiscono una parte sostanziale dei record utilizzati nelle analisi, è necessario contattare l’editore o gli editori principali del database. Ci possono essere dati aggiuntivi che possono rivelarsi preziosi per tali analisi.
Le singole pagine sono autorizzate e datate individualmente. Queste possono essere citate separatamente: la citazione corretta è fornita in fondo ad ogni pagina.

A proposito di

La World List è un catalogo ricercabile di nomi di specie e taxa superiori.

La navigazione in questo catalogo inizia cliccando su una delle scelte del menu, che si trova all’inizio di ogni pagina

• Introduzione porta a questa sezione introduttiva
• Cerca taxa porta a una pagina di interrogazione attraverso la quale si può accedere a tutte le pagine dei taxon
• Sfoglia taxa porta a un albero tassonomico
• Checklist porta a una pagina di interrogazione in cui si può scegliere direttamente un geounit se il nome esatto dell’unità è già noto. In questo modo una lista di taxa per una data area può essere trovata rapidamente.
• Attributi porterà a una pagina per interrogare (principalmente) gli intervalli di fossili
• Statistiche alcune statistiche sul World Foraminifera Database
• Fonti porterà a una pagina di interrogazione per i riferimenti della letteratura sui Foraminiferi.
• Immagini porterà a una fotogallery con immagini
• Accesso disponibile solo per gli editori.

Per ogni specie di foraminifero o taxon infraspecifico, accettato o meno, ci possono essere le seguenti voci:

1. nome del genere
2. il nome del sottogenere, se applicabile,
   N.B. i nomi dei sottogeneri non devono essere sempre citati secondo l’ICZN; l’accettazione di combinazioni senza nomi di sottogenere è considerata “rappresentazione alternativa” nel database.
3. il nome della specie
4. il nome infraspecifico, se applicabile
5. l’autore e l’anno del nome della specie, senza o con parentesi a seconda che si tratti della combinazione originale o meno
6. L’AphiaID (un identificatore numerico unico del database)
7. La classificazione superiore (secondo Loeblich e Tappan, 1990, 1992)
8. Lo stato come ‘accettato’ o ‘non accettato’ (se applicabile; La sinonimia junior è di solito basata sulla revisione pubblicata)
9. Stato del record (indica chi ha controllato il record)
10. Rango del taxon, ad es.
11. Parent: taxon immediatamente superiore, ad esempio il genere, a cui appartiene il taxon attuale
12. Taxi sinonimizzati: la lista dei sinonimi minori collegati al nome attuale
13. Fonti: riferimento alla letteratura della descrizione originale e, se applicabile, a una revisione recente (come “base del record”).
14. Tassi figli: tutti i taxa immediatamente subordinati, per esempio le sottospecie
15. Ambiente: marino o salmastro
16. Ambito fossile: solo recente o conosciuto anche come fossile (presto saranno disponibili gli intervalli epocali)
17. Distribuzione: indicazione della distribuzione geografica recente del taxon, almeno in base all’origine dell’olotipo,
    Si possono indicare diverse geo-regioni, preferibilmente l’Ecoregione marina (vedi Spalding et al. 2007), ma spesso anche la Zona economica esclusiva del paese. Le aree di distribuzione dei sinonimi minori sono mostrate automaticamente con ogni ‘specie accettata’
18. Specimen: informazioni sull’esemplare tipo, o informazioni sugli esemplari pubblicati
19. Links: ad altre risorse di foraminiferi, a immagini e altre informazioni su server specifici. Gli attuali link generali sono: Genbank, ecc.
20. Note: qualsiasi ulteriore informazione rilevante, incluse descrizioni, commenti, spiegazioni, ecc.
21. Immagini: foto o altre immagini caricate sul sito
    Preferiamo immagini ‘oggettive’ dei taxa, come foto o illustrazioni di esemplari tipo. Non incoraggiamo foto di foraminiferi non identificati, ma sono benvenute immagini senza copyright identificate in modo affidabile.
22. NotazioneLSID: (simile all’ISBN nelle pubblicazioni)
23. Storia delle modifiche: data di inserimento e modifiche apportate, nome del redattore
24. Link a un albero tassonomico, Google, Google Scholar e Google images.

I record sui taxa superiori hanno generalmente la stessa struttura di quelli delle specie. Non tutte le voci di cui sopra esistono già per tutti i taxa inseriti nel database, ma saranno aggiunte man mano che il tempo lo permette.

Quello che si può fare con questo database in questo momento è scoprire quale sia la combinazione attualmente accettata del foraminifero in questione, quale sia la sua affiliazione al taxon superiore attualmente accettata, e da dove è stato originariamente descritto. Potete anche controllare quali specie accettate si trovano in un taxon superiore. Ciò che non si può (ancora) fare è trovare ogni combinazione pubblicata del nome del genere e della specie, poiché finora abbiamo dato priorità alle combinazioni originali e a quelle attualmente accettate (quindi le combinazioni non originali non accettate mancano spesso). Ciò che non è possibile fare in modo completo è tracciare le distribuzioni delle specie e dei taxa superiori o estrarre liste regionali di specie, perché non c’è ancora coerenza nei dati inseriti da tutto il mondo.