… et comment les cliniciens peuvent-ils tirer parti des progrès de la génomique pour mieux prédire comment leur patient réagira aux médicaments ?

La pharmacogénomique est l’étude de la façon dont le génome d’un patient peut influencer sa réaction aux médicaments. Les variantes dans le génome d’un individu peuvent augmenter le fonctionnement des médicaments ou les rendre inefficaces. Elles peuvent également aider à prédire quels patients souffriront d’effets secondaires, qu’ils soient simplement désagréables ou potentiellement mortels. La pharmacogénomique peut aider les cliniciens à décider quels médicaments donner à un patient, et à quelle dose.

Pourquoi est-ce important ? On pense que les interventions médicamenteuses ne sont efficaces que chez 30 à 60 % des patients, en raison de la différence de réaction des individus aux médicaments. Au Royaume-Uni, une admission à l’hôpital sur 15 est liée à des réactions indésirables aux médicaments, ce qui coûte au NHS plus de 600 millions de livres sterling chaque année.

Donc, à juste titre, la pharmacogénomique est l’un des trois principaux objectifs de la révolution génomique du NHS, avec l’amélioration des résultats en matière de cancer et de maladies rares. En utilisant les informations génomiques pour que davantage de patients reçoivent rapidement le bon traitement, le NHS espère que le coût des tests génomiques sera largement compensé par la réduction des prescriptions gaspillées, la minimisation des admissions hospitalières inutiles et le gain de temps des cliniciens.

Regardons deux façons clés dont la pharmacogénomique peut améliorer les soins de santé.

Éviter les effets indésirables

Un médicament peut présenter un faible risque d’effets secondaires dans la population générale, mais un risque élevé dans un groupe qui possède un certain allèle (une variation dans son génome). Un exemple de ce phénomène est l’abacavir, un médicament antiviral utilisé dans le cadre de thérapies combinées pour le VIH. L’abacavir est bien toléré par la plupart des patients, mais un petit nombre d’entre eux (environ 5 %) présentent une réaction d’hypersensibilité à ce médicament, qui peut être grave et parfois mortelle.

Le risque de réaction d’hypersensibilité est beaucoup plus élevé chez les patients qui présentent une variante génétique particulière appelée HLA-B*5701, et les directives du NICE stipulent que les patients doivent subir un test de dépistage avant de commencer le traitement. Ce test est disponible depuis plus de dix ans et les chercheurs ont constaté qu’il avait un impact majeur sur la fréquence des réactions d’hypersensibilité.

Décider de la posologie

Un patient pourrait métaboliser un médicament plus rapidement que la normale – il est donc éliminé plus rapidement de l’organisme et n’a pas un effet suffisant. Ou une personne peut métaboliser un médicament lentement, de sorte qu’il s’accumule dans son système et peut devenir toxique.

Un exemple de ceci est la classe de médicaments connus sous le nom de thiopurines, qui ont des applications dans la chimiothérapie, et aussi comme immunosuppression dans les maladies auto-immunes. Lorsqu’ils sont administrés à des doses excessives, ils peuvent provoquer des effets secondaires dangereux. Outre les dangers qu’ils représentent, ils peuvent entraîner la nécessité d’interrompre le traitement, ce qui pourrait réduire les chances de succès de la chimiothérapie.

Une enzyme appelée thiopurine méthyltransférase (TPMT) est impliquée dans le métabolisme des thiopurines. Environ 3 personnes sur 1 000 n’ont pas de copie fonctionnelle du gène de la TPMT, et plus près de 10 % ont une version du gène qui est moins active que celle du reste de la population. Chez ces personnes, un traitement standard pourrait les rendre extrêmement malades.

Le NICE ne recommande pas actuellement un test génétique, mais conseille aux cliniciens d' »envisager de mesurer l’activité TPMT avant de commencer un traitement à l’azathioprine, à la mercaptopurine ou à la tioguanine ». Les patients dont l’activité TPMT est absente ne doivent pas recevoir de médicaments à base de thiopurine ; ceux dont l’activité TPMT est réduite peuvent être traités sous la supervision d’un spécialiste. »

Au fil du temps, à mesure que le séquençage du génome entier devient accessible aux patients atteints de cancers difficiles à traiter et aux enfants gravement malades, les cliniciens qui traitent les patients atteints de leucémie auront, espérons-le, ces informations à portée de main.

Pharmacogénétique ou pharmacogénomique ?

Souvent utilisé de manière interchangeable, le terme pharmacogénétique fait référence à l’impact d’un seul gène sur les interactions entre un médicament spécifique (ou un groupe de médicaments) et le corps, tandis que la pharmacogénomique examine comment toutes les régions du génome (codantes et non codantes) peuvent réguler les réponses aux médicaments.

Par exemple, le test de l’abacavir porte sur un seul gène – cela peut avoir l’avantage de générer un résultat plus rapidement qu’une séquence du génome entier et peut nécessiter une interprétation moins complexe. Pour les patients qui sont susceptibles d’avoir besoin de plusieurs tests, cependant, une séquence du génome entier peut offrir une meilleure valeur que plusieurs tests uniques, en particulier si les coûts et les délais de traitement continuent de baisser.

A mesure que le service national de médecine génomique du NHS sera déployé au cours de l’année prochaine, nous ferons le point sur tous les nouveaux développements en matière de tests pharmacogénomiques qui émergeront à la suite des répertoires de tests actuels pour le cancer et les maladies rares.

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