Moisissures sur les champignons : Ce que chaque producteur de champignons doit savoir sur la contamination

Tout producteur de champignons connaît à un moment donné la déception des champignons moisis. Même dans les environnements professionnels, les producteurs de champignons auront occasionnellement des problèmes – par exemple, lorsque quelqu’un est négligent, travaille quand il est fatigué ou prend un raccourci et que deux semaines plus tard, le spawn, ou couche de boyau, est bleu-vert ! Ce qu’il faut savoir, c’est que cela arrive : Cela arrive ! Essayez d’identifier la source de la contamination si vous le pouvez, et essayez à nouveau.

Toutes les entreprises de champignons ont des stratégies pour atténuer la contamination, en sachant qu’elle est susceptible de se produire et en créant des étapes pour minimiser les épidémies lorsqu’elle se produit. Cela inclut d’avoir un plan pour contenir et contrôler la contamination avec des registres, de suivre quel inoculant a été utilisé pour quelle culture, et d’étiqueter de manière appropriée les seringues, les bocaux et les conteneurs.

Les champignons moisis ne sont pas seulement ennuyeux, et à plus grande échelle coûteux, mais ils peuvent aussi être un danger pour votre santé. Identifiez-les rapidement et éliminez-les en toute sécurité. Cet article apprendra aux cultivateurs débutants comment savoir ce qu’il faut rechercher, et comment minimiser le potentiel des champignons moisis.

La propreté est la clé du succès

La culture des champignons peut être un défi, et il est facile de faire des erreurs simples. Malheureusement parfois ces erreurs peuvent conduire à une contamination par une variété de moisissures. Les « contaminants » dans la culture des champignons sont des champignons, des bactéries ou des insectes indésirables. Si vous avez suivi correctement toutes les étapes de votre Tek (méthodologie), vous disposez d’un environnement stérile super propre destiné à un seul champignon, qu’il s’agisse de Psilocybe cubensis ou de pleurotes, ce qui en fait un endroit idéal pour les autres champignons ou bactéries indésirables. Lorsqu’ils commencent à se développer dans le substrat (la nourriture des champignons) dans lequel vous essayez de faire pousser vos champignons, ils se disputent les mêmes nutriments et, dans certains cas, utiliseront également les champignons et le mycélium comme nourriture.

Les contaminants peuvent être introduits par diverses sources, y compris, mais sans s’y limiter, les courants d’air, l’inoculant (c’est-à-dire l’impression de spores/la seringue), les outils, le substrat, l’environnement de culture (bocaux ou récipients non nettoyés), les parasites tels que les mouches, les acariens ou les insectes, ou le cultivateur lui-même. Pour réussir, il est essentiel de bien se préparer et d’être rapide et efficace. La pratique d’une bonne technique de laboratoire, le respect d’une liste de contrôle, l’exécution des tâches par étapes et le nettoyage entre chaque étape contribuent grandement à réduire la contamination. Identifiez rapidement les sources potentielles de contaminants si vous le pouvez.

Pour les cultivateurs débutants, il y a de fortes chances que vous travailliez dans votre cuisine ou votre salle de bain, alors minimisez les fruits ou légumes moisis dans votre cuisine, et donnez aux surfaces un bon coup de chiffon avec de l’alcool. Les spores sont partout, de minuscules particules transportées par les courants d’air et chaque fois que vous vous déplacez, que vous ouvrez un récipient ou qu’un colocataire ouvre une porte ou une fenêtre, il y a un mouvement d’air et donc un mouvement de spores. L’utilisation d’une Still Air Box (SAB), ou « boîte à gants », limitera le mouvement de l’air. Si vous utilisez un Tek à base de céréales, assurez-vous de suivre les instructions – et si vous avez des doutes, faites-les tremper pendant 24 à 48 heures minimum avec une petite pression de détergent pour tuer les endospores.

Utilisez de l’alcool pour tout nettoyer (soit de l’alcool isopropylique, de l’éthanol ou de l’alcool à brûler, et diluez à 70 %). Essuyez tout, gardez vos outils propres, et flambez vos outils entre chaque étape. Nettoyez la zone directement autour de l’endroit où vous avez l’intention de travailler, ainsi que les récipients, et étant donné que vous êtes un vecteur de contamination, portez un masque et utilisez toujours des gants. Les gants alimentaires sont les meilleurs (il en existe une grande variété, et prenez-en toujours qui s’étirent bien ou qui sont bien ajustés). Il n’y a rien de pire que de passer trois heures à porter des gants qui sont d’une taille trop petite (je suis passé par là, je l’ai fait !).

N’oubliez pas que des contaminants peuvent provenir de votre empreinte de spores ou de votre seringue. La technique stérile pratiquée par la personne qui a préparé l’empreinte de spores/seringue déterminera votre succès. Ceci est particulièrement vrai si les spores proviennent d’un spécimen sauvage.

Créer des conditions de croissance favorables

Quel que soit votre Tek (Spiderman Tek, PF Tek, ou des méthodes plus avancées) ou le stade auquel vous vous trouvez (colonisation, croissance en vrac), gardez un œil sur le développement – pas nécessairement tous les jours, mais à intervalles réguliers afin de voir le mycélium se développer et d’apprendre à identifier les changements. Gardez un œil sur les changements au sein du substrat : l’apparition de bave, de décoloration ou de textures poussiéreuses au sein de votre PF Tek ; la présence d’odeurs ; ou ces mêmes textures poussiéreuses ou décolorations dans votre culture en vrac, qui sont autant d’indicateurs clés que quelque chose ne va pas.

Les bactéries sont relativement faciles à repérer, étant d’apparence gluante. La plupart du mycélium est blanc, y compris le mycélium des contaminants, vous devez donc attendre que les spores se développent avant de pouvoir identifier les contaminants. Les différents contaminants sont plus susceptibles d’apparaître à différents stades. Les contaminants que vous obtenez dans vos pots vont être légèrement différents de ceux qui se développent sur la couche d’enveloppe de votre culture en vrac en raison des différentes conditions de culture.

La contamination est souvent le résultat de conditions de culture défavorables, peut-être trop d’humidité ou trop de dioxyde de carbone (CO2). Malheureusement, la meilleure façon de résoudre ces problèmes est d’acquérir de l’expérience et de suivre les instructions, alors n’utilisez pas de raccourcis et ne précipitez pas ce que vous faites (c’est-à-dire laissez le substrat s’égoutter correctement, extrayez suffisamment d’eau, etc.) Gardez vos bocaux à température ambiante pendant qu’ils incubent – trop froid et votre mycélium se développera lentement, mais trop chaud la chaleur favorisera la croissance des moisissures.

Si vous repérez des contaminants dans vos bocaux, le contenu du bocal ne peut pas être récupéré car les spores et le mycélium indésirable se sont probablement répandus dans le substrat restant. Si vous trouvez des contaminants sur votre culture en vrac, on vous suggère souvent de couper les parties contaminées. Si vous l’attrapez à temps, c’est possible, mais gardez à l’esprit que dans de nombreux cas, si vous pouvez identifier quelque chose comme étant un contaminant, il y a de fortes chances que les spores se soient déjà répandues et que toute la culture soit contaminée. Si on le trouve pendant que les champignons poussent, utiliser de l’eau contenant 1 pour cent d’une solution de peroxyde d’hydrogène à 3 pour cent pour vaporiser sur la zone contaminée peut aider à réduire quelque peu le problème en tuant les spores – cela ne tuera pas le mycélium, mais devrait permettre aux champignons de mûrir.

Lorsque vous voulez jeter tout le contenu du pot, du plateau, etc…, portez un masque, car la moisissure pourrait être nocive pour vous si vous en recevez une bonne bouffée pulmonaire. Votre compost extérieur est un excellent endroit pour jeter les substrats contaminés, mais quel que soit l’endroit, assurez-vous de le faire à l’extérieur – ne répandez pas les spores dans votre maison ! Le nettoyage après contamination se fait de préférence avec de l’alcool, ou au minimum avec du vinaigre, en portant un masque et des gants. N’utilisez pas d’eau de javel car les champignons peuvent vivre sur des substrats blanchis.

Une certaine décoloration est normale

Selon ce que vous cultivez, une certaine décoloration est normale. Certains mycéliums, comme le Shiitake ou le Ganoderma, prennent une couleur brune à mesure qu’ils mûrissent ; le mycélium de Psilocybe est parfois connu pour être bleuâtre. Selon ce que vous cultivez, vérifiez les notes sur le comportement de croissance pour voir si la décoloration est normale.

De nombreux champignons avec la maturité commencent à exsuder des liquides colorés. Ceci est parfaitement normal et fait partie intégrante de leur métabolisme. Essentiellement, ce liquide est du pipi de champignon. Ce « pipi » signifie souvent que le mycélium est prêt à fructifier. Une surproduction de ce liquide peut indiquer la présence de contaminants, le mycélium créant soit des antibiotiques, soit d’autres composés toxiques pour les champignons ou les bactéries concurrentes.

Les dépôts importants de spores sur certains champignons ne doivent pas non plus être confondus avec une contamination ; c’est un phénomène courant à la fois dans la nature et dans les environnements de culture confinés.

Contaminants courants

En tant que débutant, la liste suivante de moisissures est la plus facile à identifier, et la plus susceptible d’être rencontrée. La plupart sont très courantes et existent volontiers dans et autour de votre maison – il y a donc de fortes chances que vous les connaissiez bien pour les avoir trouvées en train de pousser dans votre bol à fruits, sur certains légumes, dans votre réfrigérateur (surtout les yaourts), sur du fromage ou sur du pain. D’autres peuvent provenir de spores aéroportées provenant du sol.

• Moisissure bleu-vert – Penicillium sp
• Moisissure noir-jaune-vert – Aspergillus sp.
• Moisissure verte – Trichoderma sp.
• Moisissure de la toile d’araignée, moisissure duveteuse – Hypomyces rosellus
• Moisissure brune – Botrytis sp.
• Moisissure du rouge à lèvres – Sporendonema purpurescens
• Moisissure rose – Trichothecium sp.
• Moisissure rouge du pain, ou moisissure rose – Neurospora sp.
• Moisissure noire du pain, ou moisissure noire des épingles – Rhizopus sp.
• Bulle sèche – Verticillium sp.
• Tache humide / Pourriture aigre – Bacillus sp.
• Tache bactérienne – Pseudomonas sp.

Les trois principales moisissures : Bleu-vert, vert foncé, noir

Moisissure bleu-vert : Penicillium sp.

Penicillium sp. est le genre qui comprend les espèces que l’on trouve souvent en train de pousser sur votre fromage ou votre pain. Certaines variétés de Penicillium sont également utilisées pour créer les veines colorées à travers votre fromage bleu. Le genre est également célèbre comme étant la source de la pénicilline.

Comme beaucoup de moisissures, Penicillium a un mycélium blanc, ce qui le rend difficile à distinguer du mycélium de champignon que vous essayez de cultiver. Le Penicillium commence sous la forme de petites colonies circulaires, mais heureusement, il sporule assez rapidement, apparaissant sous la forme d’une moisissure granuleuse ou poudreuse vert bleuté, souvent avec un large bord blanchâtre de nouvelle croissance. Lorsqu’elle sporule dans des pots, elle peut se propager rapidement et envahir tout le substrat. Elle a une odeur de terre moisie.

Penicillium peut se développer sur une variété de substrats, y compris la farine de riz, les grains, le coco-coir, les substrats en vrac et le bois. Il se développe sur les hydrates de carbone et n’est pas une moisissure parasite. On peut également la trouver dans une variété de teks (y compris PF Tek et ses variantes).

Moisissure noire : Aspergillus sp.

Les Aspergillus sp. ont souvent l’apparence d’une moisissure verte ou noire, mais certaines espèces peuvent être jaunes, brunes ou bleues. Le mycélium d’Aspergillus peut être de couleur gris clair avec un aspect similaire au mycélium de champignon. Parfois, les colonies d’Aspergillus peuvent former un anneau avec un mycélium dense sur le bord. Elles peuvent avoir une odeur de moisi, d’huile.

N’oubliez pas que certains Aspergillus sp. sont toxiques. Il existe une variété d’espèces ayant toutes des couleurs différentes, ce qui peut rendre l’identification difficile : Aspergillus niger est noir ; Aspergillus flavus est jaune ; Aspergillus clavatus est bleu-vert ; Aspergillus fumigatus est gris-vert et Aspergillus veriscolor présente une variété de couleurs (jaune à rose à vert).

Les Aspergillus préfèrent un pH neutre à basique. Certaines espèces sont thermophiles, d’où la nécessité de respecter les durées recommandées pour stériliser les grains, ou les mélanges de grains en vrac et de copeaux de bois.

Moisissure verte : Trichoderma sp.

Les Trichoderma sp. sont un groupe de champignons très agressifs. Les Trichoderma sont utilisés dans les paillis agricoles car ils contribuent à créer un environnement protecteur pour les plantes. Ils aiment les environnements chauds et humides avec peu de mouvement d’air, et si on leur en donne l’occasion, ils dépasseront rapidement les autres mycéliums. Les Trichoderma ont un mycélium aérien et cotonneux alors que les Penicillium ont un mycélium plus plat avec un aspect granuleux.

Le mycélium des Trichoderma est souvent gris clair, poussant en colonies circulaires, avec une croissance rapide produisant rapidement des spores vert forêt ou vert olive. Parfois, le mycélium peut être jaune ou vert, avec souvent un anneau distinct entourant la colonie. La sporulation peut se produire tardivement, ce qui rend difficile le repérage de la contamination ou du degré de contamination.

Trichoderma va parasiter les champignons, aussi bien le mycélium que les champignons. Les champignons parasités présenteront des taches brunâtres sèches ou des lésions enfoncées sur le chapeau ou le pied. Les champignons se couvriront d’un mildiou fin et duveteux qui peut éventuellement devenir verdâtre à cause de la production de spores.

On le trouve dans une variété de teks (PF Tek et variations de), sur les grains et sur les substrats en vrac.

Autres moisissures communes

Moisissure de la toile d’araignée, mildiou : Hypomyces rosellus (anciennement Dactylium dendroides)

La moisissure en toile d’araignée, Hypomyces rosellus, est un champignon à croissance rapide qui a l’apparence d’une toile d’araignée. Elle commence souvent par de petites taches éparses qui se répandent rapidement sur la surface du substrat. Elle est initialement grise et peut prendre un aspect blanchâtre, avec du mycélium aérien. La moisissure en toile d’araignée est pathogène pour de nombreux champignons, et on la trouve souvent sur les champignons sauvages. Elle se propage donc facilement dans les empreintes de spores et les seringues à spores lorsqu’on utilise des spécimens ramassés. Elle est particulièrement problématique lorsqu’on tente de faire des cultures de tissus de champignons sauvages sur gélose.

La moisissure en toile d’araignée favorise une humidité élevée. Elle envahit rapidement n’importe quel tek (PF Tek et ses variantes), en un jour ou deux, et si elle est introduite dans des cultures en vrac, elle envahira la couche d’enveloppe enveloppant tous les champignons présents. Les champignons se couvriront d’une masse duveteuse de mycélium délicat, ce qui entraînera une pourriture molle.

Moisissure brune : Botrytis sp.

Botrytis cinerea est bien connue comme la moisissure qui se développe sur les raisins et les fruits – encouragée sur certains raisins de cuve car elle confère un goût particulier. Le mycélium de Botrytis est blanc au début, puis devient gris. Il se développe rapidement, est aérien, puis prend une couleur brun doré terne à brun cannelle lorsque les spores arrivent à maturité.

Il peut se propager sur les couches de boyaux, préférant un mélange riche en tissus ligneux, et se développe dans une humidité élevée avec une température modérée.

Moisissure du rouge à lèvres : Sporendonema purpurescens (anciennement Geotrichum candidium)

La moisissure en bâton de lèvre est d’abord blanche, avec parfois un aspect « givré », puis forme des boules blanches de mycélium. Elle a tendance à coloniser les couches de boyaux, mais peut coloniser d’autres substrats. Au fur et à mesure de son développement, le mycélium devient rose, puis rouge avec la maturation des spores. En vieillissant, la couleur passe à un orange terne. Elle se développe lentement, et c’est un problème peu courant.

Moisissure rose : Trichothecium roseum

Trichothecium roseum provoque la pourriture rose des pommes et est un parasite des champignons charnus. Le mycélium est initialement blanc, ses colonies se développent rapidement et deviennent roses ou couleur pêche au fur et à mesure de la production de spores. Trichothecium ressemble à Penicillium par son aspect plat granuleux et poudreux.

Moisissure rouge du pain, ou moisissure rose : Neurospora sp.

La moisissure rouge du pain a une croissance rapide, avec un mycélium aérien rampant qui devient rose vif lorsque les spores mûrissent. Les cultures contaminées ou les cultures en vrac doivent être détruites immédiatement, en prenant soin de ne pas perturber les spores dans votre zone de culture : Elle peut se développer à travers le rembourrage de l’oreiller en polyester ou la prise de micropore.

Moisissure noire du pain, ou moisissure noire des épingles : Rhizopus sp.

Il y a de fortes chances que vous ayez vu la moisissure noire du pain, un champignon à croissance rapide avec un mycélium dense, blanc au début, produisant des hyphes aériens. Le mycélium devient gris puis prend globalement un aspect noir au fur et à mesure de la production de spores. Il apparaît comme une « forêt d’épingles à tête noire ».

La bulle sèche, ou tache brune : Verticillium sp.

La bulle sèche commence sous la forme d’un mycélium blanc présent sur la couche de revêtement, qui avec le temps prend une couleur gris jaune. Elle se caractérise par des broches de champignons déformées : Ceux-ci prennent une couleur grise/brune et deviennent de texture cuirée. Si les champignons sont infectés à un stade ultérieur, ils se traduiront par des champignons tordus avec des chapeaux inclinés, des tiges bombées surtout à la base avec de la chair qui pèle.

Contaminants bactériens courants

Taches humides, ou pourriture aigre : Bacillus sp.

La « tache humide » ou « pourriture aigre » est causée par la bactérie Bacillus. Il s’agit d’une bave semblable à du mucus, de couleur gris terne à brun. Elle se caractérise par un aspect gluant « humide » et dégage une forte odeur qui peut être décrite comme une odeur de pommes pourries ou de chaussettes sales. Le bacille se reproduit très rapidement et est appelé « tache humide », car il donne au grain non colonisé un aspect excessivement humide.

La tache bactérienne : Pseudomonas sp.

La tache bactérienne apparaît sur les chapeaux des champignons sous forme de taches ou de lésions jaunes, de forme circulaire ou irrégulière. Elles sont superficielles ; se reproduisant rapidement dans les environnements trop humides où les champignons peuvent être mouillés. Les chapeaux ont tendance à devenir brun chocolat et visqueux avec l’âge. Cette bactérie possède une bave semblable à du mucus, de couleur gris terne à brun. Elle a également une odeur désagréable.

Il est conseillé d’enlever les corps de fruits infectés et de minimiser l’humidité (moins de 92 pour cent).

Une note sur les mouches

Pendant la culture en vrac, c’est le moment où votre projet de culture est très sensible aux spores ou aux bactéries dans votre eau de brumisation, à un manque ou à un excès de circulation d’air, ainsi qu’aux insectes. Les mouches des champignons, les mouches du vinaigre et autres insectes ailés sont attirés par l’odeur du mycélium, des champignons, du substrat et des exsudats (sécrétion des champignons). Les mouches des champignons sont particulièrement attirées par le mycélium, tandis que les mouches du vinaigre sont attirées par les exsudats. Elles introduiront des spores et des bactéries dans votre culture en vrac.

Les mouches des champignons sont insidieuses ; elles se reproduisent rapidement et sont rusées. En plus de pondre leurs œufs dans la couche de boyau, avec leurs larves qui éclosent et se nourrissent du mycélium, ils servent de vecteurs de contamination. Les gens perdent des récoltes entières à cause de ces parasites. On dit qu’elles peuvent se faufiler à travers la bourre d’un oreiller en polyester ! Si vous utilisez une chambre shotgun, au lieu de la bourre d’oreiller pour remplir les trous, doublez le ruban adhésif microporeux sur les trous pour permettre la circulation de l’air et empêcher les insectes de pénétrer dans la chambre de culture.

Méthodes plus avancées

Dans des environnements plus formels, le processus de culture implique de commencer avec des boîtes de Pétri d’agar, dont les sections peuvent être transférées à la culture liquide. La culture liquide est utilisée pour inoculer le blanc, et enfin pour le substrat en vrac. La gélose permet d’isoler le mycélium sans contaminants, mais aussi de sélectionner le mycélium ayant les caractéristiques de croissance préférées. Utilisée en conjonction avec la culture liquide, la combinaison des deux techniques vous permettra de voir facilement les éventuels contaminants avant d’inoculer le blanc.

Travailler avec la gélose vous permet également de vous familiariser rapidement avec une variété de contaminants. Mais si vous travaillez directement à partir de seringues à spores, le bon déroulement de votre culture de champignons dépend de la propreté des champignons utilisés pour faire l’empreinte de spores, de la propreté du processus utilisé pour faire l’empreinte de spores, puis de la fabrication de la solution de spores dans la seringue.

Ne perdez pas de vue que la réussite de votre projet dépend de la propreté de chaque étape du processus, et de la rapidité et de l’efficacité dont vous faites preuve à chaque étape. Chaque cultivateur fait l’expérience de la contamination, alors quand cela arrive, revenez en arrière et identifiez où cela s’est produit, puis essayez à nouveau. Veillez simplement à ne pas perdre confiance.