« Métagénomique », ce sont les deux mots « méta » et « génomique ». Donc la génomique consiste à obtenir la séquence d’ADN, mais méta implique que nous le faisons de nombreux organismes ensemble. Et la métagénomique est généralement utilisée pour étudier les communautés microbiennes où il est impossible de séparer un microbe d’un autre. Par exemple, il peut y avoir deux bactéries qui se développent ensemble, et donc quand vous prenez la séquence d’ADN, vous obtenez la séquence d’ADN de deux bactéries ensemble. À titre d’exemple, vous pouvez imaginer que je puisse prélever la séquence d’ADN d’une personne vivant à New York. Mais si je prenais l’ADN de tous les habitants de New York et que je le séquençais ensemble, ce serait l’équivalent de ce que nous faisons lorsque nous séquençons ensemble l’ADN de toutes les bactéries qui vivent au même endroit sur votre peau ou votre intestin. Nous ne nous contentons donc pas d’examiner un seul organisme, nous examinons la séquence d’ADN de tous les organismes réunis. Nous pourrions imaginer de séquencer l’ADN d’un individu à New York, mais imaginez que notre technologie soit limitée et que nous ne puissions pas séparer ces personnes à New York. Si nous devons prendre la séquence d’ADN de chaque personne à New York ensemble, puis plus tard nous essayons de déterminer quel ADN appartenait à quelle personne, c’est souvent ce que nous faisons lorsque nous étudions les communautés bactériennes et fongiques ensemble.
Julie A. Segre, Ph.D.