Elle est aujourd’hui majoritairement réalisée comme une technique thérapeutique. Il existe des moyens moins invasifs d’imager l’arbre biliaire, notamment l’échographie transabdominale, la cholangiopancréatographie par résonance magnétique, la tomodensitométrie et l’échographie endoscopique. Si le système biliaire est obstrué, la CTP peut être utilisée pour effectuer un drainage biliaire jusqu’à ce qu’une solution plus permanente de l’obstruction soit mise en œuvre (par exemple, une intervention chirurgicale). De plus, des stents métalliques auto-extensibles peuvent être placés sur des sténoses biliaires malignes pour permettre un drainage palliatif. La mise en place percutanée d’endoprothèses métalliques peut être utilisée lorsque la CPRE thérapeutique a échoué, que l’anatomie est altérée empêchant l’accès endoscopique au duodénum, ou lorsqu’il y a eu une séparation du drainage biliaire segmentaire du foie, permettant une mise en place plus sélective des endoprothèses métalliques.
La cholangiographie pendant une intervention de drainage biliaire est appelée choloangiographie périopératoire ou primaire, et lorsqu’elle est réalisée ultérieurement dans le même drain, elle est appelée cholangiographie secondaire.