Le début de son culte remonte au moins au début de la période dynastique. Son nom faisait partie des noms de certains individus de haute naissance de la deuxième dynastie enterrés à Helwan et était mentionné sur une stèle de Wepemnofret et dans les Textes des Pyramides. Les premières statuettes de grenouilles sont souvent considérées comme des représentations d’elle.
Heqet était considérée comme l’épouse de Khnoum, qui formait les corps des nouveaux enfants sur son tour de potier.
Dans le mythe d’Osiris, c’est Heqet qui insufflait la vie dans le nouveau corps d’Horus à la naissance, car elle était une déesse des derniers moments de la naissance. La naissance d’Horus étant de plus en plus intimement liée à la résurrection d’Osiris, le rôle d’Heqet est devenu plus étroitement associé à la résurrection. Finalement, cette association a conduit à ce que ses amulettes gagnent la phrase Je suis la résurrection à l’ère chrétienne, ainsi que le symbolisme de la croix et de l’agneau.
Un temple dédié à Horus et Heqet datant de la période ptolémaïque a été trouvé à Qus.
En tant que déesse de la fertilité, associée explicitement aux dernières étapes de la crue du Nil, et donc à la germination du maïs, elle est devenue associée aux dernières étapes de l’accouchement. Cette association, qui semble être apparue au cours du Moyen Empire, lui a valu le titre de Celle qui hâte la naissance (cf. le rôle de Heqet dans l’histoire de La naissance des enfants royaux du papyrus Westcar). Certains disent que, bien qu’aucun terme égyptien ancien pour « sage-femme » ne soit connu avec certitude, les sages-femmes s’appelaient souvent les servantes de Heqet et que ses prêtresses étaient formées à la profession de sage-femme. Les femmes portaient souvent des amulettes d’elle pendant l’accouchement, qui représentaient Heqet sous la forme d’une grenouille, assise dans un lotus.