Sydlig viscacha går inte i dvala och är mest aktiv strax efter gryningen och igen på kvällen. Vid dessa tillfällen kommer den fram ur sitt underjordiska gömställe för att äta det växtmaterial som finns tillgängligt, vilket mestadels är gräs och mossa, och den äter även lavar. En del av dagen tillbringar den på en klippa för att sola, sköta sig eller vila. Södra viscachas är en kolonial art och vågar sig inte långt bort från klippor så att de kan dyka ner under jorden om fara hotar. De använder olika rop för att kommunicera med varandra. De är bytesdjur för den andinska bergskatten (Leopardus jacobitus) och de utgör en betydande del av dess föda.
Fruktningen börjar under årets sista kvartal då parningen äger rum. Dräktigheten är cirka 130 dagar och en enda precocial valp (eller ibland två) föds som har ögonen öppna och är helt klädd i päls vid födseln. Den diar i ungefär åtta veckor, men kan komplettera mjölken med fast föda inom några timmar efter födseln. Den genomsnittliga livslängden är okänd, men en individ överlevde i 19 år i fångenskap.