Människorna anlände först via Stillahavsöarna i flera vågor någon gång före 1300 e.Kr. och förde med sig den polynesiska råttan (kiore) och den domesticerade hunden. Européerna förde senare med sig grisar, illrar, hermeliner, möss, råttor, hundar, katter, får, nötkreatur och många andra däggdjur. Av dessa har råttor, illrar, katter, hermeliner och hundar allvarligt påverkat den nyzeeländska faunan och drivit många arter till utrotning. Pungråttor infördes från Australien för en pälsindustri och hjortar från Europa som vilddjur, vilka båda allvarligt skadade många fåglars livsmiljöer i skogen.
Under de senaste åren har framgångsrika försök gjorts för att få bort pungråttor, råttor, illrar och andra däggdjur från många stora och små öar utanför kusten, i ett försök att återföra dessa platser till något som mer liknar deras ursprungliga tillstånd. Uppskattningsvis 30 ton döda pungråttor har till exempel avlägsnats från Kapiti Island. På samma sätt görs ansträngningar för att kontrollera sådana arter på utvalda platser på fastlandet. Som ett ytterligare steg har man i vissa reservat på fastlandet helt eliminerat däggdjur inom rovdjurssäkra stängsel för att skapa ekologiska öar. Exempel på detta är Zealandia i staden Wellington, från vilken omkring ett ton döda pungråttor avlägsnades efter installationen av ett däggdjurssäkert stängsel, och Maungatautari Restoration Project.