”Metagenomik” består av de två orden ”meta” och ”genomik”. Genomik är alltså att få fram DNA-sekvensen, men meta innebär att vi gör det för många organismer tillsammans. Och metagenomik används vanligtvis när vi studerar mikrobiella samhällen där vi inte kan skilja en mikrob från en annan. Det kan till exempel finnas två bakterier som växer tillsammans, och när du tar DNA-sekvensen får du DNA-sekvensen från två bakterier tillsammans. Som exempel på detta kan du föreställa dig att jag kan gå in och ta DNA-sekvensen från en person som bor i New York City. Men om jag skulle komma in och ta DNA från alla som bor i New York och sekvensera det tillsammans, skulle det motsvara vad vi gör när vi sekvenserar DNA från alla bakterier som lever på ett ställe på din hud eller din tarm tillsammans. Vi tittar alltså inte bara på en organism, vi tittar på DNA-sekvensen för alla organismer tillsammans. Vi skulle kunna tänka oss att sekvensera DNA från en person i New York, men tänk om vår teknik var begränsad och vi inte kunde separera dessa personer i New York. Om vi måste ta DNA-sekvensen från varje person i New York tillsammans, och sedan senare försöka ta reda på vilket DNA som tillhörde vilken person, är det ofta vad vi gör när vi studerar bakterie- och svampsamhällen tillsammans.

Julie A. Segre, Ph.D.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.