Hjälpbiskop i DenverEdit
Den 23 januari 2001 utnämnde påven Johannes Paulus II Gómez till hjälpbiskop i ärkestiftet Denver och titulärbiskop i Belali. Han mottog sin biskopsvigning den 26 mars av ärkebiskop Charles J. Chaput, O.F.M. Cap. med biskoparna Joseph Fiorenza och Javier Echevarría Rodríguez som medkonsekratörer. Han valde som biskopsmotto ”Adeamus cum fiducia ad thronum gratiae”, vilket betyder ”Låt oss med tillförsikt närma oss nådens tron” (Hebreerbrevet 4:16). Han var den första numerära medlemmen av Opus Dei som vigdes till biskop i USA. Som biskop är han inte längre medlem av denna organisation eftersom han rapporterar till påven och därmed inte lyder under den prelat som ansvarar för Opus Dei. Gomez har sagt att han inte är ”medlem” av Opus Dei, utan snarare att han prästvigdes i Opus Dei och att hans andlighet återspeglar den bakgrunden.
Gómez tjänstgjorde som rektor för katedralen för den obefläckade avlelsen i Denver från 2001 till 2003. Därefter var han både moderator i curien och pastor i Mother of God Church.
Ärkebiskop i San AntonioRedigera
Gómez utnämndes till ärkebiskop i San Antonio den 29 december 2004. År 2005 utsågs han till en av Time’s 25 mest inflytelserika latinamerikaner i USA, och 2007 fanns han med på CNN:s lista över ”Notable Hispanics” i en webbspecial för att fira Hispanic Heritage Month. År 2006 introducerade ärkebiskop Gomez officiellt The Catholic Community Foundation för den romersk-katolska kyrkan i ärkestiftet San Antonio. År 2007 bidrog han till att samla latinamerikanska ledare och katolska biskopar för att skapa Catholic Association of Latino Leaders (CALL).
Under sin tid i San Antonio fick Gómez rykte om sig att vara en ortodox ledare som vände upp och ner på några av de mer liberala initiativen i stiftet. Han upplöste kansliets kommission för rättvisa och fred efter att dess medlemmar uttryckt sitt motstånd mot hans stöd för en konstitutionell ändring i delstaten som förbjöd samkönade äktenskap. Under presidentvalet 2008 uttryckte han offentligt sin oro när St Mary’s University, det äldsta katolska universitetet i Texas, tillät den abortvänliga kandidaten Hillary Clinton att hålla ett kampanjevenemang på campus. Han uttryckte också oro när ett annat katolskt universitet, Our Lady of the Lake University, lät en välkänd nunna som enligt vissa hävdar att hon stöder kvinnlig prästvigning vara huvudtalare vid ett evenemang. Han välkomnade Summorum Pontificum, som gav större frihet åt den tridentinska mässan, och sade att det skulle bevara ”kyrkans rika arv och arv”.
Han är medlem av den påvliga kommissionen för Latinamerika i den romerska kurian och av styrelsen för The Catholic University of America. Som medlem av Förenta staternas katolska biskopskonferens är han ordförande för underkommittén för kyrkan i Latinamerika. I denna egenskap ledde han en delegation med tre biskopar till Haiti för att bedöma situationen där efter jordbävningen 2010. Han är också vald ordförande för kommittén för migration, ordförande för arbetsgruppen för den spanskspråkiga bibeln och medlem av kommittén för doktrin.
Ärkebiskop i Los AngelesRedigera
Den 6 april 2010 utnämndes Gómez till koadjutorärkebiskop för ärkebiskopens ärkebiskopsdöme i Los Angeles av påven Benedikt XVI. Ärkestiftet Los Angeles är det största katolska stiftet i landet, med latinamerikaner som utgör mer än två tredjedelar av ärkestiftets fem miljoner katoliker. Gómez efterträdde kardinal Mahony den 1 mars 2011, med en övergångsceremoni som hölls den 27 februari 2011. Han är den första latinamerikanen att tjänstgöra som ärkebiskop i Los Angeles och den högst rankade latinamerikanska biskopen i USA. Han sade: ”Jag är mycket tacksam mot den Helige Fadern för att han har gett mig denna möjlighet att tjäna kyrkan tillsammans med en mentor och ledare som kardinal Roger Mahony. Jag är tacksam mot den apostoliska nuntien, ärkebiskop Pietro Sambi, för att han stöder den helige faderns förtroende för mig. Jag kommer att försöka med all min kraft att förtjäna det förtroendet.”
Gómez anses vara teologiskt konservativ, men betraktas också som ”en naturlig försonare som beundras för att han förenar rika och fattiga och anglo- och spansktalande katoliker”. Han anses vara mer konservativ än sin föregångare, kardinal Mahony. När Mahony tog upp denna uppfattning sade han dock att ”dessa etiketter ’konservativ’ och ’liberal’ är verkligen inte till någon hjälp i kyrkans liv” och ”jag kan intyga att vi båda delar ett gemensamt engagemang för Kristus och kyrkan, och att vi båda är intresserade av att främja kyrkans läror fullt ut samt att föra ut Kristi ord och exempel till dagens samhälle och värld”. Gomez sade också att det skulle vara fel av observatörer att dra slutsatsen att han var konservativ eftersom han var präst i Opus Dei.
Den 18 september 2012 utnämnde påven Benedictus XVI ärkebiskop Gómez till en av synodfäderna för den 13:e ordinarie generalförsamlingen för biskopssynoden om den nya evangelisationen i oktober 2012.
Den 24 november 2012 utsågs han till medlem av det påvliga rådet för social kommunikation.
Den 31 januari 2013 förklarade Gomez att kardinal Roger Mahony, ärkebiskop emeritus, ”inte längre skulle ha några administrativa eller offentliga uppgifter” för ärkestiftet Los Angeles. Meddelandet kom samtidigt som Gomez avslöjade sina handlingar om sexuella övergrepp från präster. Han sade: ”Jag tycker att dessa filer är brutal och smärtsam läsning. Det beteende som beskrivs i dessa handlingar är fruktansvärt sorgligt och ondskefullt. Det finns ingen ursäkt, ingen förklaring till vad som hände med dessa barn. De inblandade prästerna hade skyldighet att vara deras andliga fäder och de misslyckades. Vi måste erkänna detta fruktansvärda misslyckande i dag.”
Under Gómez ledning och med hans välsignelse har Queen of Angels Foundation, en offentlig sammanslutning av troende enligt kanonisk lag som grundades av Mark Anchor Albert, sedan 2011 återupplivat den förfallna sedvänjan att sponsra en marieprocession och en Votivmässa för att hedra minnet av grundandet av staden Los Angeles den 4 september 1781. Sedan 2012 har Gómez varit huvudfirare för denna årliga mässa till ära av Nuestra Señora de los Ángeles (Vår Fru av Änglarna), beskyddare och namne av staden och grevskapet Los Angeles.
Fredagen den 14 november 2014, under höstmötet för United States Conference of Catholic Bishops, valdes ärkebiskop Gomez till en av delegaterna till biskoparnas världssynod om familjen 2015, i avvaktan på Vatikanens godkännande.
Den 15 november 2016 valdes han till vice ordförande för USCCB, och den 12 november 2019 valdes han till president för USCCB. Han är den första latino-biskopen att någonsin inneha posten.