Foraminifera – The World Foraminifera Database

Nuvarande antal giltiga recenta arter som registrerats: 8 887
Nuvarande antal giltiga fossila arter som registrerats: 40 130
Nuvarande antal totala giltiga (fossila + recenta) arter som registrerats: 48 271

The World Foraminifera Database

Denna världsdatabas över alla arter av foraminifera som någonsin beskrivits (nya och fossila) är en del av World Register of Marine Species (WoRMS), ett globalt initiativ för att tillhandahålla ett register över alla marina organismer.

Sökning i databasen (fossil och/eller recent)

Standardinställningen är att söka i hela databasen med fossila och recenta arter. Om du bara vill söka i de senaste (levande) taxa kryssar du i rutan ”extant” i fönstret Taxon Search.

Vad är Foraminifera?

Foraminifera (”hålbärare”), foraminifera eller forams förkortat, är ett stort fylum av amöboida protozoer (encelliga) med nätformiga pseudopoder, fina strängar av cytoplasma som förgrenar sig och går ihop för att bilda ett dynamiskt nät. De producerar vanligtvis ett test (eller skal) som kan ha en eller flera kamrar och som består av kalciumkarbonat (CaCO3) eller mineralkorn eller andra partiklar som limmas ihop. Testerna är vanligtvis mindre än 0,5 mm stora, men de största kan vara upp till 20 cm i diameter. Foraminifera är bland de mest rikliga och vetenskapligt viktiga grupperna av organismer. Testerna från nyligen döda planktiska foraminiferer är så rikliga att de bildar ett tjockt täcke över en tredjedel av jordens yta (som Globigerina ooze på havsbotten). Foraminifera är i huvudsak marina och flodmynningslevande protozoer som lever i alla miljöer från de största djupen ända upp till högsta astronomiska tidvattennivå och från ekvatorn till polerna.

Foraminiferas betydelse beror på användningen av deras fossila tester i biostratigrafi, paleomiljöstudier och isotopgeokemi. Deras allestädes närvarande i de flesta marina sedimentära bergarter, ofta som stora, välbevarade, varierande sammansättningar, har lett till att de är den mest studerade fossilgruppen i hela världen. Eftersom de senaste foraminifera har rönt föga intresse från biologer har paleontologer tvingats genomföra de flesta studier, inklusive genetisk forskning, på den levande faunan.

Denna webbplats har följande mål:

• att tillhandahålla en katalog över världens foraminiferarter
• att främja stabilitet i foraminiferernas nomenklatur
• att fungera som ett verktyg för högre taxonomiska revideringar. och regionala monografier

Högre klassificering

Förteckningen över för närvarande accepterade arter-gruppnamn är minst 90 % komplett för nyare arter, Taxonomin för många taxa behöver fortfarande revideras och nybeskrivna arter kommer att läggas till så snart som möjligt efter publicering, en uppgift som redaktörerna kommer att utföra fortlöpande. Fossila släkten och högre taxa är i stort sett kompletta, men det kommer att ta många år att lägga till fossila arter. Det finns för närvarande ingen bred konsensus tillgänglig för den högre klassificeringen av foraminifera. Här används den klassificering som ges i Loeblich och Tappan (1987 och 1992) mestadels för kalkrika taxa och Kaminski (2004) följs för agglutinerade taxa, men den högre klassificeringen av Foraminifera är under revidering och har uppdaterats för att överensstämma med de hittillsvarande genetiska sekvensbaserade resultaten från Pawlowski et al. (2013) och Holzmann och Pawlowski (2017). Ytterligare resultat från pågående molekylärfylogenetiska undersökningar kommer förhoppningsvis att bidra till att stabilisera det taxonomiska systemet i framtiden.

• Holzmann, M. och Pawlowski, J. (2017). En uppdaterad klassificering av rotaliid foraminifera baserad på fylogeni av ribosomalt DNA. Marine Micropaleontology 132, 18-34.
• Kaminski, M. A. (2004). År 2000-klassificeringen av de agglutinerade foraminifera. In: M. K. Bubik, Ma. (red). Proceedings of the Sixth International Workshop on Agglutinated Foraminifera. Grzybowski Foundation Special Publication. Pp. 237-255.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1987). ”Foraminiferal genera and their classification”. Van Nostrand Reinhold, New York.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1992). Nuvarande status för klassificering av foraminiferer. I ”Studies in Benthic foraminifera. Proceedings of the Fourth Symposium on benthic foraminifera, Sendai, 1990”. (Y. Takayanagi och T. Saito, red.), s. 93-102. Tokai University Press, Tokyo.
• Pawlowski, J., Holzmann, M., Tyszka, J. (2013). Ny supraordinal klassificering av Foraminifera: Molekyler möter morfologi. Marine Micropaleontology 100, 1-10

Styrelsekommitté

En styrkommitté tillhandahåller internationell tillsyn och främjar sammanställningen och rationaliseringen av World Foraminifera Database.

Styrelsekommitténs medlemmar är:

• Tomas Cedhagen, Danmark
• Peter Frenzel, Tyskland
• Bruce W. Hayward, Nya Zeeland (sammankallande)
• Martin Langer, Tyskland
• François Le Coze, Frankrike
• Briony Mamo, Hongkong, Kina
• Willem Renema, Nederländerna
• Daniel Vachard, Frankrike

Redaktörer

Inför data och fattar taxonomiska beslut i de grupper de har ansvar för:

• Hayward, Bruce: Foraminifera

• Encarnação, Sarita Camacho da: Foraminifera
• Le Coze, François: Foraminifera
• Mamo, Briony: Foraminifera
• Vachard, Daniel: Foraminifera

Redaktörerna är ansvariga för inmatningar, beslut om namnens giltighet. Rättelser och utelämnanden kan riktas till någon av redaktörerna.

Att acceptera en art i databasen är ett redaktionellt beslut, men vi är medvetna om att sådana beslut ofta måste omprövas i ljuset av ny information. Om du inte håller med om seniora synonymiseringsbeslut eller genusuppdrag, vänligen meddela oss ditt välargumenterade-korrigerade uppdrag. Endast redaktörerna kan lägga till eller ändra uppgifterna, men vem som helst kan ladda upp bilder med identifikationer och platsinformation, även om detta kommer att kontrolleras och kan ändras av redaktörerna

Historia för World Foraminifera Database

World Foraminifera Database började som den europeiska nyligen upprättade artförteckningen som sammanställdes av Tomas Cedhagen och Onno Gross. År 2010 lades listan över nya arter i Mexikanska golfen till som sammanställdes av Barun Sen Gupta och kollegor och listan över moderna arter i Nya Zeeland som sammanställdes av Bruce Hayward och kollegor.

• Gross, O. (2001). Foraminifera, i: Costello, M.J. et al. (Ed.) (2001). European register of marine species: a check-list of the marine species in Europe and a bibliography of guides to their identification. Collection Patrimoines Naturels, 50: 60-75.
• Hayward, B.W., Tendal, O.S., Carter, R., Grenfell, H.R., Morgans, H.E.G., Scott, G.H., Strong, C.P., Hayward, J.J. (2012). Phylum Foraminifera. Foraminifera and Xenophyophores. In: Gordon, D.P. (red.). Nya Zeelands inventering av biologisk mångfald: A Species 2000 Symposium Review. Canterbury University Press,. Christchurch. Pp. 242-287
• Sen Gupta, B.K., Smith, L.E., Machain-Castillo, M.L. (2009). Foraminifera of the Gulf of Mexico, Pp. 87-129 i Felder, D.L. och D.K. Camp (red.), Gulf of Mexico-Origins, Waters, and Biota. Biologisk mångfald. Texas A&M Press, College Station, Texas.

Sedan dess har poster lagts till från Johannes Pignattis katalog över recenta foraminifera, många större atlaser över recenta foraminifera och utdata från Ellis and Messina Catalogue of Foraminifera. Vi är medvetna om att många taxa som beskrivits sedan 1980 ännu inte har hittats och lagts till

Vem beskrev det största antalet nyligen beskrivna foraminifera-arter?

• McCulloch – 2429
• Cushman – 1134
• D’Orbigny – 691
• Brady – 398
• Saidova – 394
• Earland – 394
• 306

Litteraturbibliotek

Litteraturbiblioteket innehåller för närvarande ~9000 referenser, Många av de äldre verken finns tillgängliga som skannade PDF-filer.

Fotogalleri

Fotogalleriet innehåller för närvarande ~6000 bilder som är kopplade till artposter, de flesta inmatade av Tomas Cedhagen från Bradys Challenger-volym och Cushman-monografier, men även en del andra monografier.

Tasks to be done

Styrgruppen har identifierat följande uppgifter som skulle kunna genomföras för att förbättra användbarheten och värdet av databasen Forams in WoRMS. Uppgifterna har tilldelats en av tre prioriteringslistor. Vi uppmanar alla arbetstagare som vill göra denna databas mer användbar genom att på frivillig basis bidra till någon av nedanstående uppgifter att kontakta styrkommitténs ordförande Bruce Hayward via e-post.

1. Första prioritet

• Att uppnå 100 % inmatning av alla taxonomiska namn på foraminiferer som formellt föreslagits. .
• Inför alla nya taxa allteftersom de föreslås.
• Uppdatera högre taxonomi allteftersom den revideras på grundval av molekylära bevis.
• Uppdatera taxonomi och synonymer för taxa allteftersom nya molekylära och omfattande morfologiska studier publiceras.
• Att uppnå 100 % täckning för bilder av typer eller verifierade exemplar av alla accepterade existerande taxa

2. Andra prioritet

• Kontrollera alla poster från före 2010 för att se till att de inte längre innehåller fel.
• Förhandla om länkar till välrenommerade bilder/taxonomiska beskrivningar som är tillgängliga på institutionella (långlivade) webbplatser.
• Att uppnå 100 % täckning för bilder av typer eller verifierade exemplar av alla accepterade fossila taxa
• Anslut alla fossila taxa till minst en eller flera av följande tidsperioder: Paleozoikum, trias, jura, krita, paleogen, neogen.
• Förmedla en länk på webben eller ladda WoRMS med en kopia av alla publikationer som beskriver nya foraminifera taxa.
• Använd databasen Forams in WoRMS literature sources database (för närvarande 11 000 poster) som utgångspunkt för att utveckla en omfattande bibliografi över publikationer om foraminifera i världen.

3. Tredje prioritet

• Giv alla fossila taxa kända tidsintervall (mer exakta än perioder).
• Att uppnå globala geografiska spridningsdata för alla existerande arter.
• Att uppnå global geografisk spridningstäckning för alla fossila arter.

Länkar till andra Foriminiferal-webbplatser

För att hjälpa nybörjaren eller icke-specialisten ger vi här ett urval av länkar till foraminiferal-webbplatser för ytterligare information.

• Illustrerad ordlista över termer som används inom forskningen om foraminiferer http://paleopolis.rediris.es/cg/CG2006_M02/index.html
• Tekniker för att förbereda prover för studier av foraminiferer i klassrummet
• Foram Facts http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Wetmore.html
• Wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Foraminifera
• Referenser om foraminiferer http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/foramrefs.htm
• Cushman Foundation for Foraminiferal Research http://www.cushmanfoundation.org/
• Grzybowski Foundation http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/
• The Micropalaeontological Society http://www.tmsoc.org/
• University of California Museum of Paleontology – Introduction to foraminifera http://www.ucmp.berkeley.edu/foram/foramintro.html
• University College, London – Foraminifera http://www.ucl.ac.uk/GeolSci/micropal/foram.html
• Chronos foram on-line atlases http://portal.chronos.org/gridsphere/gridsphere?cid=resources
• The Foraminifera.eu Project http://www.foraminifera.eu/
• E-formas http://www.eforams.org
• Molecular Database of Foraminifera http://forambarcoding.unige.ch/
• Biografi över Joseph Cushman http://paleobiology.si.edu/cushman

Citering

Användning av data från World Foraminifera Database i vetenskapliga publikationer bör bekräftas genom att citera på följande sätt:

• Hayward, B.W.; Le Coze, F.; Vachard, D.; Gross, O. (2021). World Foraminifera Database. Tillgänglig http://www.marinespecies.org/foraminifera den 2021-03-25. doi:10.14284/305

Om data från World Foraminifera Database utgör en väsentlig del av de poster som används i analyserna bör databasens chefredaktör(er) kontaktas. Det kan finnas ytterligare data som kan vara värdefulla för sådana analyser.
Enskilda sidor är individuellt författade och daterade. Dessa kan citeras separat: korrekt citat finns längst ner på varje sida.

Om

Världslistan är en sökbar katalog över namn på arter och högre taxa.

Navigering i denna katalog börjar med att klicka på ett av valen i menyn, som du hittar högst upp på varje sida

• Introduktion leder till detta inledande avsnitt
• Sök taxa leder till en frågesida genom vilken alla taxasidor kan nås
• Bläddra taxa leder till ett taxonomiskt träd
• Checklista leder till en frågesida där en geounit kan väljas direkt om det exakta namnet på enheten redan är känt. På så sätt kan man snabbt hitta en lista över taxa för ett visst område.
• Attribut leder till en sida där man kan söka efter (främst) fossilområden
• Statistik om World Foraminifera Database
• Källor leder till en sida där man kan söka efter referenser till Foraminifera-litteratur.
• Bilder leder till ett fotogalleri med bilder
• Inloggning endast tillgänglig för redaktörer.

För varje foraminiferisk art eller infraspecifikt taxon, accepterad eller inte, kan det finnas följande poster:

1. genusnamn
2. undergenusnamn, om tillämpligt,
   N.B. Undergenusnamn behöver inte alltid citeras enligt ICZN; acceptans av kombinationer utan undergenusnamn betraktas som ”alternativ representation” i databasen.
3. artnamnet
4. det infraspecifika namnet, om tillämpligt
5. författare och årtal för artnamnet, utan eller med parentes beroende på om det är den ursprungliga kombinationen eller inte
6. AphiaID (en unik numerisk databasidentifierare)
7. Högre klassificering (enligt Loeblich och Tappan, 1990, 1992)
8. Status som ”accepterad” eller ”icke accepterad” (i förekommande fall; Junior synonymi baseras vanligtvis på publicerad revision)
9. Registreringsstatus (anger vem som kontrollerat registreringen)
10. Taxonets rang, t.ex.
11. Parent: omedelbart högre taxon, t.ex. släkte, till vilket det aktuella taxonet hör
12. Synonymiserade taxa: förteckningen över juniorsynonymer som är kopplade till det aktuella namnet
13. Källor: litteraturreferens till den ursprungliga beskrivningen och i förekommande fall till en nyare revidering (som ”grund för registreringen”).
14. Child taxa: alla omedelbart underordnade taxa, t.ex. underarter
15. Miljö: marin eller bräckt
16. Fossilutbredning: endast recent eller även känd som fossil (snart kommer epokutbredningar att finnas tillgängliga)
17. Utbredning: Uppgift om taxonets senaste geografiska utbredning, åtminstone baserat på holotypens ursprung,
    Olika geografiska områden kan anges, företrädesvis den marina ekoregionen (se Spalding et al. 2007), men ofta även landets exklusiva ekonomiska zon. Utbredningsområdena för de yngre synonymerna visas automatiskt med varje ”accepterad art”
18. Specimen: information om typexemplar eller information om publicerade exemplar
19. Länkar: till andra foraminiferalresurser, till bilder och annan information på specifika servrar. De nuvarande allmänna länkarna är följande: Genbank, etc.
20. Notiser: ytterligare relevant information, inklusive beskrivningar, kommentarer, förklaringar etc.
21. Bilder: foton eller andra bilder som laddas upp till webbplatsen
    Vi föredrar ”objektiva” bilder av taxa, t.ex. foton eller illustrationer av typexemplar. Vi uppmuntrar inte foton av oidentifierade foraminifera, men tillförlitligt identifierade upphovsrättsfria bilder är välkomna.
22. LSID-notering: (liknar ISBN i publikationer)
23. Redigeringshistorik: datum för införande och gjorda ändringar, redaktörens namn
24. Länkar till ett taxonomiskt träd, Google, Google Scholar och Google images.

Uppgifterna om högre taxa har i allmänhet samma struktur som artuppgifterna. Alla ovanstående punkter existerar inte redan för alla taxa som finns inlagda i databasen, men de kommer att läggas till när tiden tillåter.

Vad du kan göra med denna databas för närvarande är att ta reda på vad den för närvarande accepterade kombinationen är för din ämnesforaminifer, vad dess för närvarande accepterade högre taxontillhörighet är och varifrån den ursprungligen beskrevs. Du kan också kontrollera vilka accepterade arter som förekommer i ett högre taxon. Vad du (ännu) inte kan göra är att hitta alla publicerade kombinationer av släkt- och artnamn, eftersom vi hittills har prioriterat de ursprungliga och de för närvarande accepterade kombinationerna (så icke-originala icke-accepterade kombinationer saknas ofta fortfarande). Vad du inte heller kan göra på ett heltäckande sätt är att spåra utbredningen av arter och högre taxa eller ta fram regionala förteckningar över arter, eftersom det ännu inte finns någon konsistens i de uppgifter som matats in från hela världen.