NOAA Fisheries i NOAA Fisheries’ Atlantic Highly Migratory Species (HMS) Division są odpowiedzialne za zarządzanie amerykańskimi połowami tuńczyka bonito na mocy Atlantic Tunas Convention Act oraz Magnuson-Stevens Fishery Conservation and Management Act. Tuńczyk bonito, wraz z innymi HMS, takimi jak rekiny i mieczniki, jest zarządzany w ramach skonsolidowanego planu zarządzania zasobami gatunków daleko migrujących (FMP) z 2006 r. Zgodnie z FMP federalne przepisy dotyczące zarządzania mają zastosowanie do wszystkich stanów USA z wyjątkiem Maine, Connecticut i Mississippi. Wśród środków zawartych w FMP są wymagania dotyczące zezwoleń i ograniczenia dotyczące narzędzi połowowych.
Tuńczyk bonito jest gatunkiem daleko migrującym, który przemieszcza się pomiędzy jurysdykcją wielu narodów, jak również na pełnym morzu, i jako taki jego zarządzanie wymaga współpracy międzynarodowej. Zgodnie z prawem morza Organizacji Narodów Zjednoczonych zarządzanie HMS powinno odbywać się za pośrednictwem regionalnych organizacji ds. zarządzania rybołówstwem (RFMO). RFMO są jedynym prawnie upoważnionym organem zarządzającym rybołówstwem na pełnym morzu. RFMO odpowiedzialną za zarządzanie tuńczykiem atlantyckim, jak również innymi atlantyckimi HMS, jest Międzynarodowa Komisja ds. ICCAT składa się z 51 umawiających się stron, w tym Stanów Zjednoczonych, Kanady, Japonii, Chin, Rosji i Zjednoczonego Królestwa. ICCAT ocenia liczebność tuńczyka bonito oraz ocenia obecne i proponowane praktyki połowowe. Wszystkie umawiające się strony muszą rejestrować i zgłaszać dane dotyczące połowów i nakładu połowowego, które ICCAT wykorzystuje do ustalania limitów całkowitego dopuszczalnego połowu (TAC). Poza utrzymywaniem połowów poniżej maksymalnego podtrzymywalnego połowu, nie istnieją obecnie żadne szczegółowe zalecenia dotyczące zarządzania w odniesieniu do tuńczyka bonito i nie ma obecnie limitu TAC dla tego gatunku. Chociaż nie obowiązują żadne szczególne środki w odniesieniu do tuńczyka bonito, uważa się, że środki przyjęte przez ICCAT w celu ochrony innych gatunków tuńczyka są ogólnie korzystne dla tuńczyka bonito. NOAA Fisheries wykorzystuje środki ochrony i zarządzania przyjęte przez ICCAT, wraz z własnymi badaniami, w celu ustalenia przepisów dotyczących połowów tuńczyka bonito w Stanach Zjednoczonych.
NOAA Fisheries i Pacific Fishery Management Council zarządzają połowami tuńczyka bonito na zachodnim wybrzeżu USA w ramach planu zarządzania rybołówstwem (FMP) dla połowów gatunków daleko migrujących na zachodnim wybrzeżu USA. Na Hawajach i wyspiarskich terytoriach Pacyfiku w USA NOAA Fisheries i Rada Zarządzania Rybołówstwem na Zachodnim Pacyfiku zarządzają połowami tuńczyka bonito na Zachodnim Pacyfiku w ramach planu zarządzania ekosystemem rybołówstwa pelagicznego na Zachodnim Pacyfiku. Plany te są podobne, ponieważ w obu określono:
- wymagania dotyczące zezwoleń;
- ograniczenia dotyczące narzędzi połowowych w celu zminimalizowania przyłowu;
- wymagania dotyczące dokumentacji i sprawozdawczości w odniesieniu do połowu; oraz,
- wymagania, aby duże sejnery były zobowiązane do posiadania 100-procentowej obecności obserwatorów (mniejsze statki muszą to zrobić na wniosek NOAA).
Tuńczyk bonito z Pacyfiku, podobnie jak jego atlantyckie odpowiedniki, jest gatunkiem wędrownym, przekracza granice międzynarodowe i pełne morze oraz jest poławiany przez wiele krajów. As such, their management requires international cooperation. Tuńczyka Tropikalnego (IATTC) jest RFMO, której zadaniem jest zarządzanie międzynarodowymi połowami tuńczyka bonito oraz opracowywanie celów i limitów połowowych. Składająca się z ponad 20 różnych państw, w tym Stanów Zjednoczonych, Kanady, Chin, Belize, Kostaryki i Meksyku, IATTC ustanawia środki zarządzania, których muszą przestrzegać wszystkie państwa członkowskie. We wschodniej części Pacyfiku, IATTC ustanowiła środki zarządzania dla połowów okrężnicami i taklami, które obejmują zamknięcia czasowe i obszarowe, 100-procentową obecność obserwatorów na dużych statkach oraz wymogi, aby wszystkie statki w połowach okrężnicami zatrzymywały wszystkie złowione tuńczyki. Ponieważ połowy za pomocą trolli i wędek mają stosunkowo niewielki wpływ na stado (w porównaniu z innymi połowami), większość środków zarządzania nie ma zastosowania do tych połowów. IATTC regularnie ocenia tuńczyka bonito, a kraje uczestniczące przekazują IATTC dane dotyczące połowów za pośrednictwem dzienników połowowych, programów obecności obserwatorów, raportów z wyładunku oraz rejestrów wywozowych/przywozowych. Ponadto państwa członkowskie muszą składać IATTC coroczne sprawozdania dotyczące zgodności, monitorowania i środków kontroli. Każdy statek łowiący okrężnicą działający na wschodnim Pacyfiku musi również działać zgodnie z Międzynarodowym Programem Ochrony Delfinów, który ma na celu zmniejszenie przyłowu delfinów i niewymiarowych tuńczyków. IATTC ustanowiła tymczasowy cel i limit punktów odniesienia, jak również tymczasowe zasady kontroli odłowu dla wschodniego Pacyfiku skipjack.
Większość światowego odłowu tuńczyka bonito występuje w zachodnio-środkowym Pacyfiku (WCPO) – przy czym połowy amerykańskie stanowią około dziewięć procent tego całkowitego odłowu. Z tych dziewięciu procent, większość zbiorów USA występuje na Hawajach, z niektórych wyładunków występujących w USA Pacific Island territories (American Samoa, Guam, itp.). Komisja ds. Rybołówstwa na Zachodnim i Środkowym Pacyfiku (WCPFC) jest regionalną organizacją ds. rybołówstwa odpowiedzialną za zarządzanie międzynarodowymi i pełnomorskimi połowami bonito w WCPO. WCPFC składa się z ponad 25 państw członkowskich, w tym Australii, Chin, Nowej Zelandii, Indonezji, Japonii, Francji, Stanów Zjednoczonych i Republiki Korei. Wśród środków, do których stosują się kraje członkowskie są:
- Trzymiesięczny zakaz ustawiania urządzeń powodujących koncentrację ryb (FAD) w wyłącznych strefach ekonomicznych (EEZ) i na pełnym morzu między 20 stopniem na północ i 20 stopniem na południe;
- Państwa nadbrzeżne muszą zmniejszyć nakład połowowy sejnerów do poziomu z 2010 roku (jeśli są krajem członkowskim Stron Porozumienia z Nauru (PNA);
- Jeśli nie są uczestnikami PNA, muszą zmniejszyć nakład połowowy sejnerów do średnich poziomów między 2001 a 2004 r.;
- Nie można zwiększyć nakładu połowowego sejnerów dla innych krajów;
- Plan zarządzania FAD w celu zmniejszenia połowów młodych tuńczyków i przygotowania do zamknięcia FAD;
- Wymogi dotyczące corocznego monitorowania zgodności; oraz,
- Zakaz odrzutów jakiegokolwiek złowionego tuńczyka.
Kraje członkowskie PNA zgodziły się również na dodatkowe środki zarządzania, w tym: regionalny rejestr statków rybackich, zamknięcia obszarów kieszeniowych na pełnym morzu, zakazy dotyczące FAD w określonych porach oraz system dni połowowych dla statków.
WCPFC regularnie monitoruje i ocenia zasoby tuńczyka bonito. Jednakże docelowe punkty odniesienia nie zostały wprowadzone dla żadnego gatunku tuńczyka w WCPO (z wyjątkiem opastuna w perspektywie krótkoterminowej) i nie istnieją obecnie żadne zasady kontroli odłowu. Grupa robocza WCPFC pracuje nad rozwiązaniem problemu docelowych punktów referencyjnych.