Wylot z jeziora Henrys podlega latem znacznemu poborowi wody ze źródeł irygacyjnych. Późną porą roku, gdy wraz z nadejściem chłodniejszej pogody zmniejsza się ilość pobieranej wody, więcej wody jest uwalniane do strumienia, umożliwiając rybom przemieszczanie się w górę z dolnego odcinka rzeki. The Nature Conservancy sponsoruje stację edukacyjną w pobliżu strumienia wylotowego.
Na południe od jeziora w Big Springs, prawie 500 000 galonów amerykańskich (1 900 m3) stałej wody o temperaturze 52°F (11°C) wpływa do rzeki każdego dnia. Rzeka płynie na południe przez wysoki płaskowyż w północnej części hrabstwa Fremont, przez Caribou-Targhee National Forest i przepływa przez Island Park Reservoir. Wypływa ze zbiornika i przepływa przez kanion, który otwiera się na szeroką, płaską łąkę w kalderze Island Park w środkowej części hrabstwa Fremont. Rzeka płynie powoli obok miasta Island Park, przez Park Stanowy Harriman, znany jako „Railroad Ranch”, a następnie szybko opada, zbliżając się do ściany kaldery, przepływając przez wodospady Upper Mesa i Lower Mesa, i wypływa z gór na równinę Snake River w pobliżu Ashton. Płynie na południowy zachód przez równinę, mija St. Anthony i rozdziela się na wiele kanałów, tworząc szeroką deltę śródlądową na północ od Rexburga. Odbiera rzekę Teton od wschodu, około 5 mil (8.0 km) na zachód od Rexburga. Łączy się z Snake z północnego wschodu około 10 mil (16 km) na południowy zachód od Rexburga, tuż poniżej 4800 stóp (1463 m).
Island Park Reservoir, składnik Minidoka Project, jest używany do nawadniania w Snake River Plain. Jego zlewnia zapewnia jedno z najważniejszych łowisk pstrąga tęczowego w Idaho pod względem siedliska, populacji ryb i wykorzystania przez wędkarzy. Odcinek rzeki pomiędzy Henry’s Lake i Big Springs jest głównym obszarem tarła pstrąga i jest zamknięty dla wędkarzy.
Henrys Fork jest od dawna znany z doskonałego wędkarstwa, szczególnie z połowu na suchą muchę. Bing Lempke, hydraulik z pobliskiego Idaho Falls, był uważany za lokalnego dziekana tego łowiska, aż do swojej śmierci w 1990 roku.
.