Foraminifera – The World Foraminifera Database

Wyższa klasyfikacja

Lista obecnie przyjętych nazw gatunków-grup jest w co najmniej 90% kompletna dla ostatnich gatunków, ale taksonomia wielu taksonów nadal wymaga rewizji, a nowo opisane gatunki będą dodawane tak szybko jak to możliwe po publikacji, co będzie zadaniem stale podejmowanym przez redakcję. Kopalne rodzaje i wyższe taksony są w większości kompletne, ale dodanie gatunków kopalnych zajmie wiele lat. Obecnie nie ma szerokiego konsensusu co do wyższej klasyfikacji Foraminifera. Tutaj, klasyfikacja podana w Loeblich i Tappan (1987 i 1992) jest głównie używana dla taksonów wapiennych, a Kamiński (2004) jest przestrzegany dla taksonów aglutynowanych, ale klasyfikacja wyższego rzędu Foraminifera jest w stanie rewizji i została zaktualizowana, aby była zgodna z dotychczasowymi wynikami opartymi na sekwencji genetycznej Pawlowski et al. (2013) i Holzmann i Pawlowski (2017). Dalsze wyniki prowadzonych obecnie molekularnych badań filogenetycznych pozwolą, miejmy nadzieję, ustabilizować system taksonomiczny w przyszłości.

• Holzmann, M. and Pawlowski, J. (2017). An updated classification of rotaliid foraminifera based on ribosomal DNA phylogeny. Marine Micropaleontology 132, 18-34.
• Kaminski, M. A. (2004). The Year 2000 Classification of the Agglutinated Foraminifera. In: M. K. Bubik, Ma. (red). Proceedings of the Sixth International Workshop on Agglutinated Foraminifera. Grzybowski Foundation Special Publication. Pp. 237-255.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1987). „Foraminiferal genera and their classification”. Van Nostrand Reinhold, New York.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1992). Present status of foraminiferal classification. In „Studies in Benthic foraminifera. Proceedings of the Fourth Symposium on benthic foraminifera, Sendai, 1990.” (Y. Takayanagi, and T. Saito, Eds.), pp. 93-102. Tokai University Press, Tokyo.
• Pawłowski, J., Holzmann, M., Tyszka, J. (2013). New supraordinal classification of Foraminifera: Molecules meet morphology. Marine Micropaleontology 100, 1-10

Steering Committee

Komitet sterujący zapewnia międzynarodowy nadzór i sprzyja kompilacji i racjonalizacji World Foraminifera Database.

Członkami komitetu sterującego są:

• Tomas Cedhagen, Dania
• Peter Frenzel, Niemcy
• Bruce W. Hayward, Nowa Zelandia (convenor)
• Martin Langer, Niemcy
• François Le Coze, Francja
• Briony Mamo, Hong Kong, Chiny
• Willem Renema, The Netherlands
• Daniel Vachard, France

Editors

Enter data and make taxonomic decisions in the groups they have responsibility for:

• Hayward, Bruce: Foraminifera

• Encarnação, Sarita Camacho da: Foraminifera
• Le Coze, François: Foraminifera
• Mamo, Briony: Foraminifera
• Vachard, Daniel: Foraminifera

Editors are responsible for entries, decision on validity of names. Korekty i pominięcia mogą być kierowane do któregokolwiek z redaktorów.

Akceptacja gatunku w bazie danych jest decyzją redakcyjną, ale przyznajemy, że takie decyzje muszą być często ponownie analizowane w świetle nowych informacji. Jeśli nie zgadzasz się ze starszymi decyzjami synonimicznymi lub przypisaniami rodzajowymi, prosimy o przekazanie nam dobrze uargumentowanego i poprawionego przypisania. Only the editors can add or modify the data, but anybody can upload images with identifications and location information, although this will be checked and can be modified by the editors

History of the World Foraminifera Database

The World Foraminifera Database began as the European recent species list compiled by Tomas Cedhagen and Onno Gross. Dodano do niej w 2010 roku listę najnowszych gatunków z Zatoki Meksykańskiej skompilowaną przez Barun Sen Gupta i współpracowników oraz nowozelandzką listę nowoczesnych gatunków skompilowaną przez Bruce’a Haywarda i współpracowników.

• Gross, O. (2001). Foraminifera, w: Costello, M.J. et al. (Ed.) (2001). European register of marine species: a check-list of the marine species in Europe and a bibliography of guides to their identification. Collection Patrimoines Naturels, 50: 60-75.
• Hayward, B.W., Tendal, O.S., Carter, R., Grenfell, H.R., Morgans, H.E.G., Scott, G.H., Strong, C.P., Hayward, J.J. (2012). Phylum Foraminifera. Foraminifera and Xenophyophores. In: Gordon, D.P. (ed.). New Zealand Inventory of biodiversity: A Species 2000 Symposium Review. Canterbury University Press,. Christchurch. Pp. 242-287
• Sen Gupta, B.K., Smith, L.E., Machain-Castillo, M.L. (2009). Foraminifera of the Gulf of Mexico, Pp. 87-129 in Felder, D.L. and D.K. Camp (eds.), Gulf of Mexico-Origins, Waters, and Biota. Biodiversity. Texas A&M Press, College Station, Texas.

Od tego czasu zostały dodane rekordy z katalogu ostatnich foraminiferów Johannesa Pignatti, wielu głównych atlasów ostatnich foraminiferów oraz dane wyjściowe z Ellis and Messina Catalogue of Foraminifera. Zdajemy sobie sprawę, że wiele taksonów opisanych od 1980 roku wymaga jeszcze odnalezienia i dodania

Kto opisał największą liczbę ostatnich gatunków foraminiferali?

• McCulloch – 2429
• Cushman – 1134
• D’Orbigny – 691
• Brady – 398
• Saidova – 394
• Earland -. 306

Biblioteka literatury

Biblioteka literatury zawiera obecnie ~9000 referencji, wiele starszych prac jest dostępnych jako zeskanowane pliki PDF.

Photogallery

Photogallery zawiera obecnie ~6000 obrazów powiązanych z rekordami gatunków, w większości wprowadzonych przez Tomasa Cedhagena z tomu Brady’s Challenger i monografii Cushmana, ale także kilku innych monografii.

Zadania do wykonania

Komitet sterujący zidentyfikował następujące zadania, które mogłyby być podjęte w celu poprawy użyteczności i wartości bazy Forams in WoRMS. Zadania te zostały przypisane do jednej z trzech list priorytetów. Zapraszamy wszystkich pracowników, którzy chcą zwiększyć użyteczność tej bazy danych poprzez dobrowolny wkład w realizację któregokolwiek z poniższych zadań, do kontaktu z przewodniczącym Komitetu Sterującego, Brucem Haywardem, za pośrednictwem poczty elektronicznej.

1. Pierwszy priorytet

• Uzyskanie 100% wpisów wszystkich formalnie zaproponowanych nazw taksonomicznych foraminiferałów. .
• Dodanie wszystkich nowych taksonów w miarę ich zgłaszania.
• Uaktualnia wyższą taksonomię, gdy jest ona zmieniana w oparciu o dowody molekularne.
• Uaktualnienie taksonomii i synonimów taksonów w miarę publikowania nowych badań molekularnych i kompleksowych badań morfologicznych.
• Uzyskanie 100% pokrycia dla obrazów typów lub zweryfikowanych okazów wszystkich zaakceptowanych taksonów wymarłych

2. Drugi priorytet

• Sprawdzenie wszystkich wpisów sprzed 2010 roku, aby upewnić się, że nie zawierają już błędów.
• Wynegocjowanie linków do renomowanych obrazów/opisów taksonomicznych dostępnych na instytucjonalnych (długowiecznych) stronach internetowych.
• Osiągnięcie 100% pokrycia dla obrazów typów lub zweryfikowanych okazów wszystkich zaakceptowanych taksonów kopalnych
• Przypisanie wszystkich taksonów kopalnych do co najmniej jednego lub więcej z następujących okresów czasowych: Paleozoic, Triassic, Jurassic, Cretaceous, Paleogene, Neogene.
• Zapewnij link w sieci lub załaduj na WoRMS kopie wszystkich publikacji, które opisują nowe taksony foraminiferów.
• Użyj bazy danych źródeł literaturowych Forams in WoRMS (obecnie 11 000 pozycji) jako punktu wyjścia do opracowania wyczerpującej bibliografii światowych publikacji dotyczących foraminiferów.

3. Trzeci priorytet

• Podaj znane zakresy czasowe (bardziej precyzyjne niż okresy) dla wszystkich taksonów kopalnych.
• Uzyskanie danych o globalnym rozmieszczeniu geograficznym dla wszystkich gatunków wymarłych.
• Uzyskanie danych o globalnym rozmieszczeniu geograficznym dla wszystkich gatunków kopalnych.

Linki do innych stron poświęconych Foriminiferal

Aby pomóc początkującym lub niespecjalistom podajemy tutaj wybór linków do stron poświęconych foraminiferałom w celu uzyskania dalszych informacji.

• Ilustrowany słownik terminów używanych w badaniach foraminiferów http://paleopolis.rediris.es/cg/CG2006_M02/index.html
• Techniki przygotowywania próbek do badań foraminiferów w klasie http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Snyder&Huber.html
• Foram Facts http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Wetmore.html
• Wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Foraminifera
• Odniesienia do foraminiferów http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/foramrefs.htm.
• Cushman Foundation for Foraminiferal Research http://www.cushmanfoundation.org/
• Fundacja Grzybowskiego http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/
• The Micropalaeontological Society http://www.tmsoc.org/
• University of California Museum of Paleontology – Introduction to foraminifera http://www.ucmp.berkeley.edu/foram/foramintro.html
• University College, London – Foraminifera http://www.ucl.ac.uk/GeolSci/micropal/foram.html
• Chronos foram on-line atlases http://portal.chronos.org/gridsphere/gridsphere?cid=resources
• The Foraminifera.eu Project http://www.foraminifera.eu/
• E-formas http://www.eforams.org
• Molecular Database of Foraminifera http://forambarcoding.unige.ch/
• Biografia Josepha Cushmana http://paleobiology.si.edu/cushman

Cytowanie

Usage of data from the World Foraminifera Database in scientific publications should be acknowledged by citing as follows:

• Hayward, B.W.; Le Coze, F.; Vachard, D.; Gross, O. (2021). World Foraminifera Database. Dostęp http://www.marinespecies.org/foraminifera w dniu 2021-03-25. doi:10.14284/305

Jeśli dane z World Foraminifera Database stanowią znaczną część rekordów wykorzystywanych w analizach, należy skontaktować się z redaktorem naczelnym (redaktorami naczelnymi) tej bazy. W bazie mogą znajdować się dodatkowe dane, które mogą okazać się cenne dla takich analiz.
Poszczególne strony są indywidualnie autoryzowane i datowane. Mogą one być cytowane oddzielnie: właściwe cytowanie jest podane na dole każdej strony.

About

The World List jest wyszukiwalnym katalogiem nazw gatunków i wyższych taksonów.

Poruszanie się po tym katalogu rozpoczyna się od kliknięcia na jeden z wyborów w menu, które można znaleźć na górze każdej strony

• Introduction doprowadzi Cię do tej części wprowadzającej
• Search taxa doprowadzi Cię do strony z zapytaniami, przez którą wszystkie strony taksonów mogą być dostępne
• Browse taxa doprowadzi Cię do drzewa taksonomicznego
• Checklist doprowadzi Cię do strony z zapytaniami, w której można bezpośrednio wybrać geounit, jeśli dokładna nazwa jednostki jest już znana. W ten sposób można szybko znaleźć listę taksonów dla danego obszaru.
• Atrybuty
• Atrybuty
• Staty kilka statystyk dotyczących World Foraminifera Database
• Źródła
• Źródła
• Obrazy
• Obrazy
• Logowanie dostępne tylko dla redaktorów.

Dla każdego gatunku foraminifera lub taksonu infraspecyficznego, zaakceptowanego lub nie, mogą istnieć następujące wpisy:

1. nazwa rodzaju
2. nazwa podrodzaju, jeśli dotyczy,
   N.B. nazwy podrodzajów nie muszą być cytowane przez cały czas zgodnie z ICZN; akceptacja kombinacji bez nazw podrodzajów jest uważana za „alternatywną reprezentację” w bazie danych.
3. nazwa gatunku
4. nazwa infraspecyficzna, jeśli dotyczy
5. autor i rok podania nazwy gatunku, bez nawiasów lub z nawiasami w zależności od tego, czy jest to oryginalna kombinacja czy nie
6. AphiaID (unikalny numeryczny identyfikator bazy danych)
7. Najwyższa klasyfikacja (zgodnie z Loeblich i Tappan, 1990, 1992)
8. Status jako „przyjęty” lub „nieprzyjęty” (jeśli dotyczy; Młodsze synonimy są zwykle oparte na opublikowanej rewizji)
9. Status rekordu (wskazuje, kto sprawdził rekord)
10. Ranga taksonu, np.gatunek
11. Parent: bezpośrednio wyższy takson, np. rodzaj, do którego należy obecny takson
12. Synonimized taxa: wykaz młodszych synonimów powiązanych z obecną nazwą
13. Sources: odniesienie literaturowe do oryginalnego opisu i, w stosownych przypadkach, do ostatniej rewizji (jako „podstawa zapisu”).
14. Taksony potomne: wszystkie taksony bezpośrednio podrzędne, np. podgatunki
15. Środowisko: morskie lub słonawe
16. Zasięg kopalny: wyłącznie niedawny lub znany również jako kopalny (wkrótce dostępne będą zasięgi epokowe)
17. Rozmieszczenie: wskazanie najnowszego rozmieszczenia geograficznego taksonu, przynajmniej w oparciu o pochodzenie holotypu,
    Różne jednostki geograficzne mogą zostać wskazane, najlepiej morski ekoregion (zob. Spalding et al. 2007), ale często również wyłączna strefa ekonomiczna danego kraju. Obszary występowania młodszych synonimów są automatycznie pokazywane przy każdym „zaakceptowanym gatunku”
18. Okaz: informacje o okazie typu lub opublikowane informacje o okazie
19. Linki: do innych zasobów foraminiferałów, do obrazów i innych informacji na konkretnych serwerach. Aktualne ogólne linki to: Genbank, etc.
20. Notatki: wszelkie dalsze istotne informacje, w tym opisy, komentarze, wyjaśnienia, etc.
21. Obrazy: zdjęcia lub inne obrazy przesłane na stronę
    Preferujemy „obiektywne” obrazy taksonów, takie jak zdjęcia lub ilustracje okazów typu. Nie zachęcamy do zamieszczania zdjęć niezidentyfikowanych foraminiferów, ale rzetelnie zidentyfikowane, wolne od praw autorskich obrazy są mile widziane.
22. Notacja LSID: (podobna do ISBN w publikacjach)
23. Historia edycji: data wpisu i dokonanych zmian, nazwisko redaktora
24. Linki do drzewa taksonomicznego, Google, Google Scholar i Google images.

Rekordy dotyczące wyższych taksonów mają generalnie taką samą strukturę jak rekordy gatunków. Nie wszystkie z powyższych pozycji istnieją już dla wszystkich taksonów wprowadzonych do bazy danych, ale będą one dodawane w miarę upływu czasu.

To co możesz zrobić z tą bazą danych w tym momencie, to dowiedzieć się jaka jest obecnie akceptowana kombinacja twojego tematu foraminifera, jaka jest jego obecnie akceptowana przynależność do wyższego taksonu i skąd został pierwotnie opisany. Możesz również sprawdzić, które z zaakceptowanych gatunków występują w wyższym taksonie. To, czego nie możesz (jeszcze) zrobić, to znaleźć każdą opublikowaną kombinację nazwy rodzaju i gatunku, ponieważ do tej pory dawaliśmy pierwszeństwo oryginalnym i obecnie akceptowanym kombinacjom (więc nieoryginalnych, nieakceptowanych kombinacji często jeszcze brakuje). Nie można również prześledzić rozmieszczenia gatunków i wyższych taksonów ani wyodrębnić regionalnych list gatunków, ponieważ jak dotąd nie ma spójności w danych wprowadzanych z całego świata.

.