Przechowywanie tkanki FFPE

Próbki FFPE mogą być przechowywane w szpitalach, biobankach i ośrodkach badawczych. Ośrodki przechowujące często prowadzą rejestry dotyczące sposobu pobrania tkanki, procedur konserwacyjnych i informacji demograficznych (takich jak, ale nie tylko: pochodzenie, czas trwania, wiek, pochodzenie etniczne, płeć i stadium choroby) dawcy. Informacje demograficzne są ważnym czynnikiem w badaniach naukowych i próbach klinicznych. Próbki FFPE, które są odpowiednio konserwowane, są bardzo cenne i mogą być przechowywane w temperaturze pokojowej przez długi okres czasu.

Zastosowania

Próbki FFPE są ważne, ponieważ są często wykorzystywane w:

a) Immunohistochemii

Przekrojone próbki FFPE są montowane na szkiełku mikroskopowym, kąpane w roztworze zawierającym przeciwciała, a następnie barwione, dzięki czemu mogą być lepiej widoczne. Metoda ta jest ważna dla lekarzy i badaczy poszukujących patologii w tkankach, takich jak choroba Alzheimera lub rak.

b) Onkologia

Próbki FFPE są istotne w dziedzinie onkologii, ponieważ tkanki nowotworowe mają charakterystyczną morfologię pozwalającą badaczom na poszukiwanie pewnych białek. Białka te są następnie wykorzystywane do pomocy w ocenie leczenia i diagnostyki.

c) Hematologia

W badaniach krwi i jej zaburzeń, próbki FFPE są ważne w określaniu anomalii i odkrywaniu lekarstw. Próbki mogą być wykorzystywane w badaniach związanych z regeneracją tkanek, genetyką i toksykologią.

d) Immunologia

Próbki FFPE od dawcy z chorobą autoimmunologiczną pomagają w określeniu przyczyny i opracowaniu terapii dla tego schorzenia.

Powikłania lub ograniczenia

Jednym z możliwych ograniczeń procesu utrwalania przy użyciu formaliny jest potencjalna denaturacja białek, które są obecne w tkance, co czyni je niewykrywalnymi dla przeciwciał. Aby zrekompensować ten problem, opracowano techniki odzyskiwania antygenu. Technika odzyskiwania antygenów polega na odzyskiwaniu DNA, RNA i białek z próbek FFPE. Aby ta metoda mogła działać, jakość próbek FFPE jest krytyczna. Istnieje również problem, że nie ma standardowej procedury, która byłaby stosowana w obróbce przedanalitycznej, takiej jak utrwalanie i izolacja DNA. Oznacza to, że drobne różnice, takie jak różne użycie instrumentów, obchodzenie się z próbkami i metodologia mogą powodować różnice, które wpływają na jakość DNA i wyniki badań. Niektóre z czynników, które wpływają na wyniki badań z próbek FFPE to:

  1. Niedokładne rejestrowanie protokołu utrwalania

  2. Zmienność czasu utrwalania

  3. Temperatura podczas utrwalania

  4. Warunki przechowywania próbek FFPE

Kontrola jakości

Aby zapewnić najwyższą jakość próbek FFPE, osoby pobierające i przechowujące te próbki powinny:

  1. Postępować zgodnie z normami etycznymi i prawnymi.

  2. Prowadzić jasny i dokładny rejestr dawców.

  3. Udzielać informacji dotyczących procesu pobierania i gromadzenia próbek

  4. Podlegać nadzorowi licencjonowanego patologa podczas pobierania próbek

  5. Prowadzić pełny łańcuch nadzoru

  6. Współpracować wyłącznie z starannie dobraną siecią dystrybutorów, którzy konsekwentnie dostarczają próbki o wysokiej jakości i dokładności

Tkanki świeżo mrożone

Tkanki świeżo mrożone to próbki, które są konserwowane przy użyciu ciekłego azotu metodą znaną jako „flash freezing”. Okazy te są następnie przechowywane w zamrażarce, która jest ustawiona na temperaturę poniżej -80 stopni Celsjusza. Tkanka świeżo mrożona ma inne zastosowania niż próbki FFPE, ponieważ może być używana w badaniach morfologii lub analizie molekularnej.

Próbki FFPE Vs. Tkanka świeżo mrożona

FFPE i tkanka świeżo mrożona mają swoje wady i zalety. Są to dwa różne rodzaje próbek, które mają różne zastosowania w zależności od wymagań badań lub badań klinicznych.

  1. Bloki FFPE są bardzo twarde i mogą być łatwo przechowywane w temperaturze pokojowej przez dziesięciolecia bez potrzeby stosowania specjalnego sprzętu, co czyni ten typ próbki tkankowej bardzo efektywnym kosztowo.

  2. Dla badaczy dostępne jest duże archiwum próbek FFPE ze względu na łatwość związaną z ich przechowywaniem.

  3. Próbki FFPE są używane od dziesięcioleci, co sprawia, że są one doskonale znane patologom.

  4. Tkanka świeżo mrożona jest znacznie bardziej odpowiednia do analizy białek natywnych, łańcuchowej reakcji polimerazy i sekwencjonowania DNA następnej generacji.

  5. Tkanka świeżo mrożona zapewnia zachowanie DNA, RNA i białek natywnych.

  6. Tkanki świeżo mrożone wymagają specjalistycznego sprzętu do przechowywania. Oznacza to, że awarie mechaniczne, przerwy w dostawie prądu i nieostrożność mogą wpłynąć na jakość próbek.

1) Ward T. The importance of proper formalin fixation of FFPE samples. Personalis. Dostęp 6/19/2018. https://www.personalis.com/importance-proper-formalin-fixation-ffpe-specimens/

2) Doiron L. 5 zasad kontroli jakości dla banków tkanek nowotworowych. Folio Conversant. Dostęp 6/19/2018. http://www.conversantbio.com/blog/bid/339034/5-Quality-Control-Rules-for-Cancer-Tissue-Banks

3) FFPE vs mrożone próbki tkanek. BioChain. Dostęp 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/ffpe-vs-frozen-tissue-samples/

4) Co to jest tkanka FFPE i jakie są jej zastosowania. BioChain. Dostęp 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/what-is-ffpe-tissue/

By: adminPosted on

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.