Vroege geschiedenisEdit
Vóór het Europese contact, en tot ver in de 19e eeuw, leefde de Ohlone stam in de regio, vooral in de oeverzone van El Granada Creek. Het National Register of Historic Places vermeldt een Ohlone archeologische vindplaats, Archeological Site SMA-151, in deze directe omgeving. De eerste Europese verkenning van Alta California, de Spaanse Portolà expeditie, passeerde het gebied op weg naar het noorden en kampeerde net ten zuiden van de haven op 28 oktober 1769. In zijn expeditie dagboek, beschreef missionaris Juan Crespi Pillar Point.
19e eeuwEdit
In het begin van de 19e eeuw doorkruisten Russische pelsjagers dit deel van de Noord-Californische kust. In 1859 was een deel van het gebied eigendom van James G. Denniston, een parlementslid van de staat Californië die San Mateo County vertegenwoordigde. Hij bouwde een diepwater aanlegsteiger bij Pillar Point die jarenlang een belangrijke haven was voor timmerhout, producten en ander materiaal bestemd voor San Francisco.
… een herinnering aan de meer dan 85 zeilschepen die in de laatste helft van de negentiende eeuw aan de kust van San Mateo County vergingen.
– Plaquette bij het anker van de Rydal Hall,
Vele scheepswrakken en andere nautische ongelukken vonden plaats in dit gebied van de kustlijn van de Stille Oceaan. Het schip Rydal Hall verging in oktober 1876 bij Pillar Point terwijl het steenkool vervoerde bestemd voor San Francisco. In 1971 werd het anker van het schip geborgen en het is nog steeds te bezichtigen bij een nabijgelegen restaurant.
20e eeuwEdit
In de twintigste eeuw werd de haven gebruikt door kleine vissersboten, hoewel hevige winterstormen soms boten vernietigden, zelfs als ze in de haven lagen. Van 1959 tot 1961 bouwde het Army Corps of Engineers een golfbreker om de haven te beschermen. In die tijd werden ook een pier, het kantoor van de havenmeester en andere faciliteiten gebouwd, en werd een misthoorn geïnstalleerd. Al snel bleek echter dat de golfbreker geen bescherming bood tegen stormgolven uit het zuidwesten, die door de opening van de golfbreker gierden. In 1967 werd de westelijke arm van de golfbreker met 320 m verlengd in een poging dergelijke golven tegen te houden. Ook die oplossing bleek ontoereikend, zodat in 1982 een binnenste golfbreker werd gebouwd.
De buitenste golfbreker leidt de stormgolven af naar de nabijgelegen kusten, waardoor de erosie op sommige plaatsen drastisch toenam. Een lijn van nabijgelegen bluffs geërodeerd terug 150 voet (46 m) in de 35 jaar na de golfbreker werd gebouwd, ondanks een poging in de jaren 1960 om de bluffs te beschermen met een riprap barrière.