Warburton doet in zijn acteerrollen vaak een beroep op zijn kenmerkende diepe, dreunende stem en zijn forse postuur. In de jaren negentig werd hij bekend door zijn terugkerende rol als David Puddy in Seinfeld, de op-en-top vriend van Elaine Benes. Hij speelde Eric in de sitcom “Dave’s World”. Hij had een kleine rol in de film Men in Black II uit 2002 als de nieuwe partner van J, T.
Warburton speelde in de kortstondige serie The Tick van FOX, waarin hij de titelrol vertolkte. Hij heeft herhaaldelijk kritiek geuit op FOX’s wanbeheer van de serie na de annulering ervan, door te verklaren dat het netwerk “blijkbaar geen idee had.”
Hij speelde Nick Sharp in 8 Simple Rules en kwam in 2003 bij de cast van Less Than Perfect, als anchorman Jeb Denton. Hij speelde ook Jeff Bingham in Rules of Engagement, en Rip Riley in de FX-serie Archer.
Warburton heeft zijn stem gebruikt voor verschillende tekenfilms en tv-programma’s, waaronder een hoofdrolspeler in Game Over, Buzz Lightyear en de Little Green Men in Buzz Lightyear of Star Command, en Kronk in The Emperor’s New Groove, met David Spade, Eartha Kitt, en John Goodman; Spade en Warburton zouden weer samenkomen in de CBS sitcom Rules of Engagement, die van 2007 tot 2013 werd uitgezonden, en Joe Dirt 2: Beautiful Loser in 2015. Warburton hernam zijn rol als Kronk voor de direct-to-video sequel, Kronk’s New Groove, en de daaropvolgende tv-serie The Emperor’s New School. Hij zong de stem van Steve Barkin in de Disney Channel show Kim Possible.
Warburton werd ook gecast in The Venture Bros., waarin hij de stem van Brock Samson speelt. Hij stemt Joe Swanson in Fox’s Family Guy en Detective Cash in The Batman. Hij leende zijn stem talent aan de computer-geanimeerde speelfilms Hoodwinked, Chicken Little, Bee Movie, Open Season, en Tak (alle drie de games),Tak and the Power of Juju. Hij was ook de stem van commandant Blaine H. Tate in de Comedy Central animatieserie Moonbeam City in oktober 2015.
Warburton verscheen op GSN’s Poker Royale Celebrities vs. the Pros toernooi in 2005, waarbij hij het toernooi won en de hoofdprijs van $ 50.000. Op 8 november 2009 was Warburton te zien als het wildwestpersonage Cal Johnson in Seth & Alex’s (Almost Live) Comedy Show, gepresenteerd door Seth MacFarlane en Alex Borstein, op Fox. Hij was ook gecast als Sheriff Bronson Stone in de Cartoon Network serie Scooby-Doo! Mystery Incorporated. Hij verscheen als Bowser in een video van CollegeHumor getiteld “The Roast of Mario”.
Hij was te zien in de Amerikaanse versie van Top Gear op 21 februari 2012. Hij vestigde het “Big Star, Small Car” ronderecord, waarmee hij de vorige recordhouder Arlene Tur versloeg.
Warburton speelde in 2016 in de NBC sitcom Crowded, waarin hij naast Carrie Preston speelde als ouders die op het punt staan om van hun lege nestjaren te genieten, alleen om te ontdekken dat hun dochters en zijn ouders allemaal weer bij hen intrekken om bij hen te wonen. De show liep voor een seizoen van 13 afleveringen.
Hij is te zien als de steward, Patrick, in de “preboarding” video getoond aan gasten in Soarin’ Around the World in Disney California Adventure in Anaheim, Californië en Epcot in het Walt Disney World Resort, in Orlando, Florida waar hij de eisen van de rit uitlegt, zijn rol herhalend van de preboarding video van de voorganger van de rit Soarin’ Over California. Hij leende zijn stem aan de droid G2-4T in de wachtrij van Star Tours: The Adventures Continue in Disney’s Hollywood Studios in Orlando, Florida en Disneyland in Anaheim, Californië.
Hij speelde de hoofdrol als Lemony Snicket in de Netflix-komedie-dramaserie A Series of Unfortunate Events.
Ondanks het feit dat hij een levenslange fan is van het Los Angeles Kings hockeyteam, is Warburton bij meerdere New Jersey Devils-wedstrijden verschenen met zijn gezicht (en borst) geschilderd op een manier die vergelijkbaar is met die van zijn Devils-gekke rol in een aflevering van “Seinfeld”, waarbij hij de menigte vermaande op een manier die vergelijkbaar is met die van zijn “Puddy”-personage. Zijn echte relatie met de Devils begon toen het team hem uitnodigde om de ceremoniële eerste puck van het seizoen 1995 te gooien, en hij kwam met beschilderd gezicht opdagen. Na het gooien van de puck gleed hij uit en viel, maar redde het moment door zijn evenwicht te hervinden en zijn shirt uit te scheuren om te onthullen dat zijn borst was beschilderd met de letter “D”. Dit werd beschouwd als een iconisch moment in de geschiedenis van de Devils. De Devils deelden een Puddy bobblehead pop uit aan fans tijdens een wedstrijd in 2019.
In de commerciële en reclamewereld is Warburton de stem in de Carrier Corporation commercials voor hun airconditioning en HVAC-units, en was de stem van Superman in The Adventures of Seinfeld en Superman voor American Express. Hij is de stem van “Lewis” in de “Clark & Lewis Expedition” radioreclames voor Horizon Air. In augustus 2009 speelde Warburton een high-end PC in een “Get a Mac” reclame voor Apple Inc. Warburton werd de woordvoerder van de reclamecampagne “Good Reasons” van de Japanse autofabrikant Honda in september 2011. Hij is de stem in NAPA’s “Can of Know How”-reclame. In 2015 werd Warburton de ster van de National Car Rental commercials “Be the Boss of You”. En hij werd de stem in de huidige “Discover Fresh” radioreclamecampagne van Souplantation, een in Californië gevestigde restaurantketen in buffetstijl (het restaurant staat in andere markten bekend als “Sweet Tomatoes”).
Warburton is ook de stem van Ranger, een boswachter, in een reeks radiospots voor de nationale Smokey Bear-campagne, gesponsord door de U.S. Forest Service en de Ad Council.