“Metagenomics” zijn de twee woorden “meta” en “genomics”. Dus genomics is het verkrijgen van de DNA-sequentie, maar meta impliceert dat we het van veel organismen samen doen. En metagenomics wordt gewoonlijk gebruikt wanneer we microbiële gemeenschappen bestuderen waar we de ene microbe niet kunnen scheiden van de andere. Er kunnen bijvoorbeeld twee bacteriën zijn die samen groeien, en wanneer je dus de DNA-sequentie neemt, krijg je de DNA-sequentie van twee bacteriën samen. Als voorbeeld kun je je voorstellen dat ik naar binnen zou kunnen gaan en de DNA-sequentie zou kunnen nemen van een persoon die in New York woont. Maar als ik binnen zou komen en het DNA van iedereen die in New York woont zou nemen en dat samen zou sequencen, dan zou dat het equivalent zijn van wat we doen als we het DNA van alle bacteriën die op één plek op je huid of je darmen leven samen sequencen. Dus we kijken niet alleen naar één organisme, we kijken naar de DNA-sequentie van alle organismen samen. Want we kunnen ons voorstellen dat we het DNA van een individu in New York sequencen, maar stel je voor dat onze technologie beperkt is en we deze mensen in New York niet kunnen scheiden. Als we de DNA-sequentie van elke persoon in New York samen moeten nemen, en dan later proberen uit te zoeken welk DNA bij welke persoon hoorde, dat is vaak wat we doen als we bacteriële en schimmelgemeenschappen samen bestuderen.
Julie A. Segre, Ph.D.