Het begin van haar cultus dateert althans uit de vroege dynastieke periode. Haar naam maakte deel uit van de namen van enkele hooggeboren personen uit de Tweede Dynastie die te Helwan waren begraven en werd vermeld op een stèle van Wepemnofret en in de Piramideteksten. Vroege kikkerbeeldjes worden vaak beschouwd als afbeeldingen van haar.
Heqet werd beschouwd als de vrouw van Khnum, die de lichamen van nieuwe kinderen vormde op zijn pottenbakkersschijf.
In de Osiris-mythe was het Heqet die leven blies in het nieuwe lichaam van Horus bij de geboorte, aangezien zij een godin was van de laatste momenten van de geboorte. Naarmate de geboorte van Horus nauwer werd geassocieerd met de wederopstanding van Osiris, werd ook de rol van Heqet nauwer geassocieerd met de wederopstanding. Uiteindelijk leidde deze associatie ertoe dat haar amuletten in het christelijke tijdperk de uitdrukking I am the resurrection kregen, samen met kruis- en lamssymboliek.
Een tempel gewijd aan Horus en Heqet uit de Ptolemeïsche Periode werd gevonden te Qus.
Als vruchtbaarheidsgodin, die uitdrukkelijk werd geassocieerd met de laatste stadia van de overstroming van de Nijl, en dus met het ontkiemen van het graan, werd zij geassocieerd met de laatste stadia van de geboorte van een kind. Deze associatie, die schijnt te zijn ontstaan tijdens het Middenrijk, bezorgde haar de titel Zij die de geboorte bespoedigt (vgl. de rol van Heqet in het verhaal van De geboorte van de Koninklijke Kinderen uit de Westcar Papyrus). Sommigen zeggen dat – hoewel er geen oude Egyptische term voor “vroedvrouw” met zekerheid bekend is – vroedvrouwen zich vaak de Dienaressen van Heqet noemden, en dat haar priesteressen werden opgeleid in de vroedvrouwerij. Vrouwen droegen vaak amuletten van haar tijdens de bevalling, die Heqet afbeeldden als een kikker, zittend in een lotus.