In 1959 nam William Morgan van Morgan Marine, een botenbouwer uit Silver Bay, aan Lake George, New York, de naam Hacker-Craft over met als doel de historische erfenis van het bedrijf nieuw leven in te blazen.
Morgan Marine voerde belangrijke structurele en technische wijzigingen door. Het gebruik van nieuwe technologieën, die niet beschikbaar waren voor Hacker, maakte het mogelijk de boten op een paar subtiele maar belangrijke manieren te verbeteren. Waar Hacker 110 pk (82 kW) motoren had gebruikt, was Morgan Marine in staat om deze rompen aan te drijven met 350 pk (260 kW) of 454 pk (339 kW) Crusader motoren die meer dan 50 mijl per uur konden halen. Om deze verbeterde motoren te kunnen plaatsen, moest Morgan Marine de steunen sterker maken dan die in de oorspronkelijke ontwerpen werden gebruikt. Morgan’s grootste prestatie was echter het verbeteren van de hanteerbaarheid van de Hacker Crafts. Als de oude Hackers op topsnelheid voeren, kon de boeg omhoog komen en het zicht van de bestuurder blokkeren. Door het ontwerp van de bodem te herzien, zorgde Morgan ervoor dat de boot meer waterpas in het water zou blijven.
Op dit moment waren veel van de originele mallen verloren gegaan, en waar nodig, maakten ze nieuwe zandgietstukken voor de hardware. Met behoud van het meeste traditionele vakmanschap, bracht Morgan een aantal belangrijke verbeteringen aan ten opzichte van de oude plannen, als concessies aan de voortschrijdende technologie: dubbele uitlaten, in plaats van de oorspronkelijke enkele uitlaat, voor betere motorprestaties; het gebruik van roestvrijstalen beslag en hardware, zodat pitting niet langer een probleem was; state-of-the-art epoxy inkapseling en verbindingstechnieken; driedubbele beplanking bodems volledig omhuld met epoxy; dubbel beplankte zijkanten en dek verzadigd in epoxy; 25% meer spanten; het dubbele aantal vloerbalken; tot 18 lagen vernis; het gebruik van hernieuwbare Honduras mahonie; nieuwe verbeterde besturing voor meer manoeuvreerbaarheid; en gelamineerde windschermen met blauwe of groene tinten.
In 2004 kocht Robert Wagemann het bedrijf van William Morgan. In 2008 verwierf George Badcock’s Erin Investments een meerderheidsbelang in het bedrijf van Robert Wagemann. Vervolgens opende het bedrijf een productiefaciliteit van 32.000 vierkante meter in Ticonderoga, waar het de productie van Silver Bay naartoe verplaatste om de capaciteit te vergroten. In 2011 werd Erin Investments volledig eigenaar van het bedrijf.
Naast de nieuwe productiefaciliteit werd de campus van het hoofdkantoor aan Lake George, waar zich ook een jachthaven bevindt, opgewaardeerd met een nieuwe showroom waar vier boten kunnen worden tentoongesteld. De kantoren van het hoofdkantoor en alle opslag- en servicegebouwen werden gerepareerd/opgeknapt. De campus werd aangelegd en parkeerplaatsen werden opgewaardeerd.
In 2011 was Hacker-Craft te zien in TV en catalogus shoots voor Marks & Spencer (UK), Tommy Hilfiger en Nautica.
In 2011 werd de op maat ontworpen Neiman Marcus Edition Hacker-Craft geselecteerd als een “fantasie cadeau” in de legendarische Neiman Marcus Christmas Book catalogus.
In 2012 resulteerde een samenwerking met Tommy Bahama in een op maat ontworpen model, de Tommy Bahama Edition Hacker-Craft (TBE).
In 2015 introduceerde het bedrijf een limousine jachttender, en benoemde de Sierra Boat Company, aan Lake Tahoe, Nevada, en Wawasee Boat Company, van Syracuse, Indiana, als geautoriseerde vertegenwoordigers.
In 2017 benoemde het bedrijf de in Thailand gevestigde Classic Boats Lifestyle, Ltd. (CBL) als een officiële voorraadhoudende dealer.
In 2019 verscheen een Hacker Craft boot in een seizoen twee aflevering van Netflix’s Ozark.