Foraminifera – The World Foraminifera Database

Huidig aantal geldige recente soorten opgenomen: 8 887
Huidig aantal geldige fossiele soorten opgenomen: 40 130
Huidig aantal totaal geldige (fossiele + recente) soorten opgenomen: 48 271

The World Foraminifera Database

Deze werelddatabase van alle ooit beschreven soorten Foraminifera (recente en fossiele), maakt deel uit van het World Register of Marine Species (WoRMS), een wereldwijd initiatief om een register van alle mariene organismen aan te leggen.

De database doorzoeken (fossiel en/of recent)

De standaardinstelling is om de gehele database van fossiele en recente soorten te doorzoeken. Als u alleen in de recente (levende) taxa wilt zoeken, vink dan het vakje ‘extant’ aan in het Taxon Search venster.

Wat zijn Foraminifera?

Foraminifera (‘gatendragers’), kortweg foraminiferen of forams, zijn een groot fylum van amoeboïde protozoën (eencelligen) met reticulerende pseudopoden, fijne strengen cytoplasma die zich vertakken en samensmelten om een dynamisch net te vormen. Zij produceren gewoonlijk een test (of schelp) die één of meer kamers kan hebben, en gemaakt is van calciumcarbonaat (CaCO3) of aan elkaar gelijmde minerale korrels of andere deeltjes. De testikels zijn meestal minder dan 0,5 mm groot, maar de grootste kunnen een diameter tot 20 cm hebben. Foraminifera behoren tot de meest overvloedige en wetenschappelijk belangrijke groepen organismen. De testen van recent afgestorven planktische foraminifera zijn zo talrijk dat zij een dikke deken vormen over een derde van het aardoppervlak (als Globigerina ooze op de oceaanbodem). Foraminifera zijn in wezen mariene en estuariene protozoën die leven in alle milieus van de grootste diepten tot het hoogste astronomische getijdenniveau en van de evenaar tot de polen.

Het belang van foraminifera komt voort uit het gebruik van hun fossiele testen in biostratigrafie, paleomilieustudies, en isotopengeochemie. Hun alomtegenwoordigheid in de meeste mariene sedimentaire gesteenten, vaak als grote, goed bewaarde, diverse assemblages, heeft ertoe geleid dat zij wereldwijd de meest bestudeerde groep van fossielen zijn. Omdat recente foraminifera weinig belangstelling hebben getrokken van biologen, zijn paleontologen gedwongen de meeste studies, met inbegrip van genetisch onderzoek, uit te voeren op de levende fauna.

Deze site heeft de volgende doelstellingen:

• een catalogus van ’s werelds soorten foraminiferen
• de stabiliteit in de foraminiferennomenclatuur bevorderen
• een hulpmiddel zijn voor hogere taxonomische revisies en regionale monografieën

Hogere classificatie

De lijst van momenteel aanvaarde soort-groepsnamen is minstens 90% volledig voor recente soorten, maar de taxonomie van vele taxa moet nog worden herzien en nieuw beschreven soorten zullen zo spoedig mogelijk na publicatie worden toegevoegd, een taak die door de redactie voortdurend zal worden ondernomen. Fossiele geslachten en hogere taxa zijn grotendeels compleet, maar het zal nog vele jaren duren voordat fossiele soorten kunnen worden toegevoegd. Er is momenteel geen brede consensus beschikbaar voor de hogere classificatie van de Foraminifera. Hier wordt de classificatie gegeven in Loeblich en Tappan (1987 en 1992) meestal gebruikt voor kalkhoudende taxa en Kaminski (2004) wordt gevolgd voor geagglutineerde taxa, maar de hogere classificatie van Foraminifera is in een staat van revisie en is bijgewerkt om te voldoen aan de op genetische sequentie gebaseerde resultaten tot nu toe van Pawlowski et al. (2013) en Holzmann en Pawlowski (2017). Verdere resultaten van lopend moleculair fylogenetisch onderzoek zullen hopelijk helpen om het taxonomische systeem in de toekomst te stabiliseren.

• Holzmann, M. en Pawlowski, J. (2017). Een bijgewerkte classificatie van rotaliide foraminifera op basis van ribosomale DNA-fylogenie. Marine Micropaleontology 132, 18-34.
• Kaminski, M. A. (2004). The Year 2000 Classification of the Agglutinated Foraminifera. In: M. K. Bubik, Ma. (ed). Proceedings of the Sixth International Workshop on Agglutinated Foraminifera. Speciale publicatie van de Grzybowski Stichting. Pp. 237-255.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1987). “Foraminiferal genera and their classification.” Van Nostrand Reinhold, New York.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1992). Huidige status van de foraminiferenclassificatie. In “Studies in Benthic foraminifera. Proceedings of the Fourth Symposium on benthic foraminifera, Sendai, 1990.” (Y. Takayanagi, and T. Saito, Eds.), pp. 93-102. Tokai University Press, Tokyo.
• Pawlowski, J., Holzmann, M., Tyszka, J. (2013). New supraordinal classification of Foraminifera: Molecules meet morphology. Marine Micropaleontology 100, 1-10

Steering Committee

Een stuurgroep zorgt voor internationaal toezicht en bevordert de compilatie en rationalisatie van de World Foraminifera Database.

De leden van de stuurgroep zijn:

• Tomas Cedhagen, Denemarken
• Peter Frenzel, Duitsland
• Bruce W. Hayward, Nieuw-Zeeland (convenor)
• Martin Langer, Duitsland
• François Le Coze, Frankrijk
• Briony Mamo, Hongkong, China
• Willem Renema, Nederland
• Daniel Vachard, Frankrijk

Redacteuren

Verzenden gegevens en nemen taxonomische beslissingen in de groepen waarvoor zij verantwoordelijk zijn:

• Hayward, Bruce: Foraminifera

• Encarnação, Sarita Camacho da: Foraminifera
• Le Coze, François: Foraminifera
• Mamo, Briony: Foraminifera
• Vachard, Daniel: Foraminifera

Redacteuren zijn verantwoordelijk voor vermeldingen, beslissing over geldigheid van namen. Correcties en weglatingen kunnen aan beide redacteuren worden gericht.

De aanvaarding van een soort in de database is een redactionele beslissing, maar we erkennen dat dergelijke beslissingen regelmatig opnieuw moeten worden bekeken in het licht van nieuwe informatie. Als u het niet eens bent met oudere synonymiebeslissingen of geslachtstoewijzingen, laat ons dan uw goed beargumenteerde en gecorrigeerde toewijzing weten. Alleen de redactie kan gegevens toevoegen of wijzigen, maar iedereen kan afbeeldingen uploaden met identificaties en informatie over de vindplaats, hoewel deze door de redactie zullen worden gecontroleerd en gewijzigd kunnen worden

Geschiedenis van de World Foraminifera Database

De World Foraminifera Database begon als de Europese recente soortenlijst, samengesteld door Tomas Cedhagen en Onno Gross. In 2010 zijn daar de recente soortenlijst voor de Golf van Mexico aan toegevoegd, samengesteld door Barun Sen Gupta en collega’s, en de moderne soortenlijst voor Nieuw-Zeeland, samengesteld door Bruce Hayward en collega’s.

• Gross, O. (2001). Foraminifera, in: Costello, M.J. et al. (Ed.) (2001). European register of marine species: a check-list of the marine species in Europe and a bibliography of guides to their identification. Collection Patrimoines Naturels, 50: 60-75.
• Hayward, B.W., Tendal, O.S., Carter, R., Grenfell, H.R., Morgans, H.E.G., Scott, G.H., Strong, C.P., Hayward, J.J. (2012). Phylum Foraminifera. Foraminifera en Xenophyophora. In: Gordon, D.P. (ed.). Inventaris van de biodiversiteit in Nieuw-Zeeland: A Species 2000 Symposium Review. Canterbury University Press,. Christchurch. Pp. 242-287
• Sen Gupta, B.K., Smith, L.E., Machain-Castillo, M.L. (2009). Foraminifera van de Golf van Mexico, Pp. 87-129 in Felder, D.L. and D.K. Camp (eds.), Gulf of Mexico-Origins, Waters, and Biota. Biodiversiteit. Texas A&M Press, College Station, Texas.

Sindsdien zijn records toegevoegd uit Johannes Pignatti’s catalogus van recente foraminifera, vele belangrijke atlassen van Recente foraminifera en output van Ellis en Messina Catalogus van Foraminifera. Wij zijn ons ervan bewust dat vele taxa beschreven sinds 1980 nog moeten worden gevonden en toegevoegd

Wie beschreef het grootste aantal recente soorten Foraminiferen?

• McCulloch – 2429
• Cushman – 1134
• D’Orbigny – 691
• Brady – 398
• Saidova – 394
• Earland – 306

Literatuurbibliotheek

De literatuurbibliotheek bevat momenteel ~9000 referenties, veel van de oudere werken zijn beschikbaar als gescande PDF’s.

Fotogalerij

De fotogalerij bevat momenteel ~6000 afbeeldingen gekoppeld aan soortrecords, meestal ingevoerd door Tomas Cedhagen uit Brady’s Challenger-deel en Cushman-monografieën, maar ook enkele andere monografieën.

Taken

De stuurgroep heeft de volgende taken geïdentificeerd die kunnen worden ondernomen om het nut en de waarde van de Forams in WoRMS-databank te verbeteren. De taken zijn toegewezen aan een van de drie prioriteitenlijsten. We nodigen elke werknemer die deze databank nuttiger wil maken door op vrijwillige basis bij te dragen tot een van de onderstaande taken, uit om contact op te nemen met de voorzitter van de stuurgroep, Bruce Hayward, via e-mail.

1. Eerste prioriteit

• Alle formeel voorgestelde taxonomische namen van foraminiferen voor 100% invoeren.
• Alle nieuwe taxa toevoegen als ze worden voorgesteld.
• Update hogere taxonomie als deze wordt herzien op basis van moleculair bewijs.
• Update taxonomy and synonymies of taxa as new molecular and comprehensive morphological studies are published.
• Benaderen van 100% dekking voor afbeeldingen van typen of geverifieerde specimens van alle geaccepteerde extante taxa

2. Tweede prioriteit

• Alle vermeldingen van vóór 2010 controleren om er zeker van te zijn dat ze geen fouten meer bevatten.
• Neggen van links naar gerenommeerde afbeeldingen/taxonomische beschrijvingen die beschikbaar zijn op institutionele (langlevende) websites.
• Bereik 100% dekking voor afbeeldingen van typen of geverifieerde specimens van alle geaccepteerde fossiele taxa.
• Benoem alle fossiele taxa aan ten minste één of meer van de volgende tijdvakken: Paleozoïcum, Trias, Jura, Krijt, Paleogeen, Neogeen.
• Voorzie een link op het web of laad op WoRMS een kopie van alle publicaties die nieuwe foraminifera taxa beschrijven.
• Gebruik de Forams in WoRMS literature sources database (momenteel 11.000 entries) als uitgangspunt voor het ontwikkelen van een uitgebreide bibliografie van wereldwijde foraminifera publicaties.

3. Derde prioriteit

• Geef bekende tijdbereiken (preciezer dan perioden) voor alle fossiele taxa.
• Gebruik maken van wereldwijde geografische verspreidingsgegevens voor alle bestaande soorten.
• Gebruik maken van wereldwijde geografische verspreidingsgegevens voor alle fossiele soorten.

Links naar andere foraminiferen sites

Om de beginner of de niet-specialist te helpen geven we hier een selectie van links naar foraminiferen websites voor verdere informatie.

• Illustrated glossary of terms used in foraminiferal research http://paleopolis.rediris.es/cg/CG2006_M02/index.html
• Technieken voor het prepareren van monsters voor het bestuderen van foraminiferen in de klas http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Snyder&Huber.html
• Foram Facts http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Wetmore.html
• Wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Foraminifera
• Foraminiferal referenties http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/foramrefs.htm
• Cushman Foundation for Foraminiferal Research http://www.cushmanfoundation.org/
• Grzybowski Foundation http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/
• The Micropalaeontological Society http://www.tmsoc.org/
• University of California Museum of Paleontology – Introduction to foraminifera http://www.ucmp.berkeley.edu/foram/foramintro.html
• University College, London – Foraminifera http://www.ucl.ac.uk/GeolSci/micropal/foram.html
• Chronos foram on-line atlassen http://portal.chronos.org/gridsphere/gridsphere?cid=resources
• The Foraminifera.eu Project http://www.foraminifera.eu/
• E-forma’s http://www.eforams.org
• Molecular Database of Foraminifera http://forambarcoding.unige.ch/
• Biografie van Joseph Cushman http://paleobiology.si.edu/cushman

Citatie

Gebruik van gegevens uit de World Foraminifera Database in wetenschappelijke publicaties dient te worden erkend door als volgt te citeren:

• Hayward, B.W.; Le Coze, F.; Vachard, D.; Gross, O. (2021). World Foraminifera Database. Accessed at http://www.marinespecies.org/foraminifera on 2021-03-25. doi:10.14284/305

Als de gegevens uit de World Foraminifera Database een substantieel deel uitmaken van de in analyses gebruikte records, moet contact worden opgenomen met de hoofdredacteur(en) van de database. Er kunnen aanvullende gegevens zijn die voor dergelijke analyses waardevol kunnen blijken.
Afzonderlijke pagina’s zijn individueel geschreven en gedateerd. Deze kunnen afzonderlijk worden geciteerd: de juiste citatie staat onderaan elke pagina.

Over

De Wereldlijst is een doorzoekbare catalogus van namen van soorten en hogere taxa.

Navigatie in deze catalogus begint met het aanklikken van een van de keuzes in het menu, dat u bovenaan elke pagina vindt

• Inleiding leidt naar deze inleidende sectie
• Zoek taxa leidt naar een zoekpagina waarmee alle taxonpagina’s kunnen worden opgeroepen
• Blader taxa leidt naar een taxonomische boom
• Checklist leidt naar een zoekpagina waarin direct een geounit kan worden gekozen als de exacte naam van de eenheid al bekend is. Op deze manier kan snel een lijst van taxa voor een bepaald gebied worden gevonden.
• Attributen zal leiden naar een pagina om (voornamelijk) fossiele reeksen op te zoeken
• Statistieken over de World Foraminifera Database
• Bronnen zal leiden naar een zoekpagina voor Referenties van Foraminifera literatuur.
• Afbeeldingen zal leiden naar een fotogalerij met afbeeldingen
• Inloggen alleen beschikbaar voor redacteuren.

Voor elke foraminiferale soort of infraspecifiek taxon, aanvaard of niet, kunnen er de volgende vermeldingen zijn:

1. geslachtsnaam
2. de subgeslachtsnaam, indien van toepassing,
   N.B. subgeslachtsnamen hoeven volgens de ICZN niet altijd geciteerd te worden; aanvaarding van combinaties zonder subgeslachtsnamen wordt beschouwd als ‘alternatieve vertegenwoordiging’ in de database.
3. de soortnaam
4. de infraspecifieke naam, indien van toepassing
5. de auteur en het jaar van de soortnaam, zonder of met haakjes, afhankelijk van of het de oorspronkelijke combinatie is of niet
6. de AphiaID (een unieke numerieke database-identifier)
7. de hogere classificatie (volgens Loeblich en Tappan, 1990, 1992)
8. de status als ‘aanvaard’ of ‘niet-aanvaard’ (indien van toepassing; junior synonymie is meestal gebaseerd op gepubliceerde revisie)
9. Record status (geeft aan wie het record heeft gecontroleerd)
10. Rank van taxon, bijv.b.v. species
11. Parent: onmiddellijk hoger gelegen taxon, b.v. genus, waartoe het huidige taxon behoort
12. Synonymized taxa: de lijst van junior synoniemen gekoppeld aan de huidige naam
13. Sources: literatuurverwijzing van de oorspronkelijke beschrijving en indien van toepassing naar een recente revisie (als de ‘basis van het record’).
14. Kindtaxa: alle direct ondergeschikte taxa, b.v. ondersoorten
15. Milieu: marien of brak
16. Fossiel verspreidingsgebied: alleen recent of ook bekend als fossiel (binnenkort zullen ook tijdperkbereiken beschikbaar zijn)
17. Distributie: aanduiding van de recente geografische verspreiding van het taxon, ten minste op basis van de herkomst van het holotype,
    Verschillende geounits kunnen worden aangegeven, bij voorkeur de mariene ecoregio (zie Spalding et al. 2007), maar vaak ook de exclusieve economische zone van het land. De verspreidingsgebieden van de junior synoniemen worden automatisch getoond bij elke ‘geaccepteerde soort’
18. Specimen: informatie over het type specimen, of gepubliceerde specimeninformatie
19. Links: naar andere foraminiferenbronnen, naar afbeeldingen en andere informatie op specifieke servers. De huidige algemene links zijn: Genbank, etc.
20. Notes: alle verdere relevante informatie, inclusief beschrijvingen, opmerkingen, verklaringen, etc.
21. Images: foto’s of andere afbeeldingen die naar de site zijn geüpload
    We geven de voorkeur aan ‘objectieve’ afbeeldingen van de taxa, zoals foto’s of illustraties van typespecimens. We moedigen foto’s van ongeïdentificeerde foraminifera niet aan, maar betrouwbaar geïdentificeerde auteursrechtvrije afbeeldingen zijn welkom.
22. LSID notatie: (vergelijkbaar met ISBN in publicaties)
23. Aanpassingsgeschiedenis: datum van invoer en aangebrachte wijzigingen, naam van de redacteur
24. Links naar een taxonomische boom, Google, Google Scholar en Google images.

De records over hogere taxa hebben over het algemeen dezelfde structuur als die van de soortrecords. Niet alle bovenstaande items bestaan al voor alle taxa die in de database zijn ingevoerd, maar ze zullen worden toegevoegd als de tijd het toelaat.

Wat u op dit moment met deze database kunt doen is uitzoeken wat de momenteel geaccepteerde combinatie is van uw onderwerp foraminifeer, wat zijn momenteel geaccepteerde hogere taxon verwantschap is, en van waar het oorspronkelijk werd beschreven. U kunt ook nagaan welke geaccepteerde soorten in een hoger taxon voorkomen. Wat u (nog) niet kunt doen is elke gepubliceerde combinatie van geslachts- en soortnaam vinden, omdat we tot nu toe prioriteit hebben gegeven aan de originele en de momenteel geaccepteerde combinaties (zodat niet-originele niet-geaccepteerde combinaties vaak nog ontbreken). Wat u ook niet uitgebreid kunt doen, is de verspreiding van soorten en hogere taxa traceren of regionale lijsten van soorten samenstellen, omdat er nog geen consistentie is in de ingevoerde gegevens van over de hele wereld.