Opslag van FFPE-weefsel

FFPE-monsters kunnen worden opgeslagen in ziekenhuizen, biobanken en onderzoekscentra. In de opslagplaatsen wordt vaak bijgehouden hoe het weefsel is verzameld, welke conserveringsprocedures zijn gevolgd en welke demografische gegevens (zoals herkomst, duur, leeftijd, etnische afkomst, geslacht en ziektestadium) de donor heeft verstrekt. De demografische informatie is een belangrijke factor bij onderzoek en klinische proeven. FFPE stalen die goed bewaard zijn, zijn zeer waardevol en kunnen gedurende lange tijd bij kamertemperatuur bewaard worden.

Toepassingen

FFPE stalen zijn belangrijk omdat ze vaak gebruikt worden in:

a) Immunohistochemie

De doorgesneden FFPE stalen worden op een draagglaasje gemonteerd, in een oplossing met antilichamen ondergedompeld, en dan gekleurd zodat ze duidelijker te zien zijn. Deze methode is belangrijk voor artsen en onderzoekers die op zoek zijn naar pathologie in het weefsel, zoals Alzheimer of kanker.

b) Oncologie

FFPE-monsters zijn van vitaal belang op het gebied van de oncologie, aangezien tumorweefsels karakteristieke morfologieën hebben die onderzoekers in staat stellen naar bepaalde eiwitten te zoeken. Deze proteïnen worden dan gebruikt om te helpen bij de beoordeling van de behandeling en de diagnose.

c) Hematologie

Bij de studie van bloed en bloedziekten zijn FFPE-monsters belangrijk voor het vaststellen van de afwijkingen en het vinden van genezing. De specimens kunnen worden gebruikt in studies met betrekking tot weefselregeneratie, genetica en toxicologie.

d) Immunologie

FFPE-monsters van een donor met auto-immuunziekte helpen bij het vaststellen van de oorzaak en het ontwikkelen van therapie voor de aandoening.

Complicaties of beperkingen

Een van de mogelijke beperkingen van het fixatieproces met formaline is de mogelijke denaturatie van de eiwitten die in het weefsel aanwezig zijn, waardoor ze voor antilichamen ondetecteerbaar worden. Om dit probleem te ondervangen werden antigeen retrieval technieken ontwikkeld. De antigen retrieval techniek recupereert specifiek DNA, RNA, en proteïnen uit FFPE stalen. Wil deze methode werken, dan is de kwaliteit van FFPE-monsters van kritiek belang. Er is ook het probleem dat er geen standaardprocedure is voor de preanalytische verwerking, zoals fixatie en DNA-isolatie. Dit betekent dat kleine verschillen zoals het verschillend gebruik van instrumenten, monsterbehandeling en methodologie kunnen resulteren in variatie die de kwaliteit van het DNA en de studieresultaten beïnvloedt. Enkele van de factoren waarvan is vastgesteld dat zij van invloed zijn op studieresultaten van FFPE-monsters zijn:

  1. Inaccurate registratie van fixatieprotocol

  2. Variatie in fixatietijd

  3. Temperatuur tijdens fixatie

  4. Opbergomstandigheden van FFPE-monsters

Kwaliteitscontrole

Om de hoogste kwaliteit van FFPE-monsters te garanderen, moeten degenen die deze monsters verzamelen en bewaren:

  1. De ethische en wettelijke normen volgen.

  2. Nauwkeurige en duidelijke gegevens over donors bijhouden.

  3. Informatie verschaffen over het monsterafname- en verzamelproces

  4. Tijdens het afnemen van monsters onder toezicht staan van een gediplomeerd patholoog

  5. Een volledige chain of custody hebben

  6. Alleen werken met een zorgvuldig geselecteerd netwerk van distributeurs die consequent kwalitatief hoogwaardige en nauwkeurige monsters leveren

Vers ingevroren weefsel

Vers ingevroren weefsels zijn specimens die met vloeibare stikstof worden geconserveerd via een methode die bekend staat als “flash freezing”. Deze specimens worden vervolgens bewaard in een vriezer die op een temperatuur van minder dan -80 graden Celsius is ingesteld. Vers ingevroren weefsel heeft andere toepassingen dan FFPE-monsters, omdat ze ook kunnen worden gebruikt voor morfologisch onderzoek of moleculaire analyse.

FFPE-monsters vs. vers ingevroren weefsel

FFPE- en vers ingevroren weefsel hebben hun voor- en nadelen. Het zijn twee verschillende soorten monsters die voor verschillende doeleinden worden gebruikt, afhankelijk van de eisen van het onderzoek of de klinische studie.

  1. FFPE-blokken zijn zeer hard en kunnen gemakkelijk tientallen jaren bij kamertemperatuur worden bewaard zonder dat daarvoor speciale apparatuur nodig is, waardoor dit type weefselmonster zeer kostenefficiënt is.

  2. Er is een groot archief van FFPE-monsters beschikbaar voor onderzoekers vanwege het gemak waarmee het kan worden bewaard.

  3. FFPE-monsters worden al tientallen jaren gebruikt, waardoor pathologen er zeer vertrouwd mee zijn.

  4. Vers ingevroren weefsel is veel geschikter voor de analyse van natieve eiwitten, polymerasekettingreactie en DNA-sequencing van de volgende generatie.

  5. Vers ingevroren weefsel garandeert de bewaring van DNA, RNA en natieve eiwitten.

  6. Vers ingevroren weefsel vereist gespecialiseerde apparatuur voor de opslag. Dit betekent dat mechanische storingen, stroomuitval en onzorgvuldigheid de kwaliteit van de monsters kunnen aantasten.

1) Ward T. The importance of proper formalin fixation of FFPE samples. Personalis. Geraadpleegd op 6/19/2018. https://www.personalis.com/importance-proper-formalin-fixation-ffpe-specimens/

2) Doiron L. 5 kwaliteitscontroleregels voor kankerweefselbanken. Folio Conversant. Accessed 6/19/2018. http://www.conversantbio.com/blog/bid/339034/5-Quality-Control-Rules-for-Cancer-Tissue-Banks

3) FFPE vs ingevroren weefselmonsters. BioChain. Accessed 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/ffpe-vs-frozen-tissue-samples/

4) Wat is FFPE-weefsel en wat zijn de toepassingen ervan. BioChain. Accessed 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/what-is-ffpe-tissue/

By: adminPosted on

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.