Egy erős érv amellett, hogy az új humán retrovírus, az XMRV nem laboratóriumi szennyeződés, az a megállapítás, hogy a vírus DNS-e beépül a prosztatadaganatok kromoszómális DNS-ébe. Miért jelent ez az eredmény olyan erős bizonyítékot a vírusfertőzésre?
A vírusgenom integrált példányának – a provírusnak – a létrehozása kritikus lépés a retrovírusok életciklusában. A provirális DNS-t a sejtes RNS-polimeráz II írja át a vírus RNS-genom és a replikációs ciklus befejezéséhez szükséges mRNS-ek előállításához. A provirális DNS nélkül a retrovírus replikációja nem folytatódhat.
A provirális DNS előállításához a retrovírus RNS-genomot a vírus enzim, a reverz transzkriptáz kettősszálú DNS-é alakítja át. Ez a lépés a citoplazmában történik. A vírus-DNS specifikus és efficiens beillesztését a gazdasejt DNS-ébe az integráz nevű vírusenzim katalizálja. Ez az enzim felismeri és elkapja a vírus-DNS két végét, majd az új 3′-végeket az integráz által készített lépcsőzetes elkapásoknál kovalensen összekapcsolja a gazdaszervezet DNS-ével.
Az alábbi kép a retrovírusos integráció néhány jellegzetes vonását mutatja. A felső képen a madárszarkóma/leukózis vírus nem integrált lineáris DNS-e látható, amelyet reverz transzkripcióval állítottak elő. Az integráció befejezésekor mindkét végződésből két bázispár (AA-TT) elvész, és a provirális DNS mindkét oldalán egy 6 bp hosszúságú célhely duplikálódik a gazdaszervezet DNS-ében (rózsaszín). Ennek a célhelynek a hossza a különböző retrovírusoknál 4-6 bp között változik. A provirális DNS (középen) a konzervált 5′-T G…C A-3′ szekvenciával végződik. A provírus templátként szolgál a vírus RNS-genomjának előállításához (alul).
Az XMRV provirális DNS azonosításához prosztata tumorokból genomiális DNS-t izoláltak, és a DNS-t olyan primerrel amplifikálták, amely a vírus env génjében, a jobb oldali LTR közelében kapcsolódott. A 14 9 különböző betegből származó felerősített DNS-ek nukleotidszekvencia-elemzései a várt vírus CA-szekvenciát mutatták, amelyet emberi DNS követett. A retrovírusos integráció másik kardinális jelét – az integrációs helyet flankáló gazdaszervezeti DNS-szekvenciák duplikációját – azonban nem sikerült megerősíteni, mivel csak a jobb oldali integrációs helyet vizsgálták.
A teljes provirális DNS izolálása, beleértve mindkét flankáló integrációs helyet, prosztatarákos vagy krónikus fáradtság szindrómás betegekből további bizonyíték lenne arra, hogy az XMRV egy embert fertőző vírus.