Aproteom az egy szervezet által kifejezett fehérjék teljes halmaza. A kifejezést használhatjuk egy adott időpontban egy adott sejt- vagy szövettípusban termelődő fehérjék választékának leírására is. A proteom az organizmus genomjának kifejeződése. A genommal ellentétben azonban, amelyet a stabilitás jellemez, a proteom aktívan változik különböző tényezők hatására, beleértve a szervezet fejlődési szakaszát, valamint a belső és külső körülményeket.
A proteom tanulmányozását proteomikának nevezik, és a fehérjék működésének és egymás közötti kölcsönhatásainak megértését jelenti. Például sok fehérje bonyolult háromdimenziós struktúrákba rendeződik, és egyesek komplexeket alkotnak egymással, hogy betöltsék funkciójukat. Ezen túlmenően a fehérjék átalakulnak, ami történhet a transzláció előtt vagy után. A proteom többféle technikával is tanulmányozható. Például kétdimenziós gélelektroforézissel a fehérjéket méretük és töltésük alapján szét lehet választani. A proteom egy másik laboratóriumi technikával, az úgynevezett tömegspektrometriával is tanulmányozható, amely a komplex mintákon belül azonosítja a specifikus fehérjéket.