A Henrys-tó kivezetése nyáron az öntözési célú elterelések miatt jelentős levonulásoknak van kitéve. A szezon végén, amikor a hűvösebb időjárás miatt a levonulások csökkennek, több vizet engednek a patakba, lehetővé téve a halak számára, hogy a folyó alsó szakaszáról feljebb jussanak. A Nature Conservancy szponzorál egy tanulóállomást a kilépő patak közelében.
A tótól délre, Big Springsnél közel 500 000 amerikai gallon (1900 m3) állandó, 11 °C-os víz folyik a folyóba minden nap. A folyó dél felé folyik egy magas fennsíkon keresztül Fremont megye északi részén, a Caribou-Targhee Nemzeti Erdőn keresztül, és áthalad az Island Park víztározón. A tározóból kilépve egy kanyonban folyik, amely egy széles, lapos rétre nyílik az Island Park Calderában, Fremont megye középső részén. A folyó lassan elhalad Island Park városa mellett, áthalad a Harriman State Parkon, más néven a “Railroad Ranch”-en, majd a kaldera falához közeledve gyorsan leereszkedik, átfolyik az Upper Mesa és az Lower Mesa vízesésen, és Ashton közelében kilép a hegyekből a Snake River Plainre. A folyó délnyugatra folyik a síkságon, St. Anthony mellett, majd több csatornára osztódva egy széles szárazföldi deltába torkollik Rexburgtól északra. Rexburgtól nyugatra körülbelül 8,0 km-re (5 mérföldre) kelet felől fogadja a Teton folyót. Északkeletről, Rexburgtól mintegy 16 km-re (10 mérföldre) délnyugatra csatlakozik a Snake folyóhoz, alig 1.463 m (4.800 láb) alatt.
A Minidoka projekt részét képező Island Park víztározót öntözésre használják a Snake folyó síkságán. Lefolyása az egyik legfontosabb szivárványos pisztráng halászatot biztosítja Idahóban az élőhely, a halállomány és a horgászok általi használat szempontjából. A folyó Henry’s Lake és Big Springs közötti szakasza a pisztrángok egyik fő ívási területe, és le van zárva a horgászat elől.
A Henry’s Fork régóta híres a kiváló horgászatáról, különösen a szárazlegyes horgászatról. Bing Lempke, egy csőszerelő a közeli Idaho Fallsból, a horgászat helyi dékánjának számított, amíg 1990-ben meg nem halt.