Foraminifera – The World Foraminifera Database

Az érvényes újkori fajok jelenlegi száma: 8 887
Az érvényes fosszilis fajok jelenlegi száma: 40 130
A teljes érvényes (fosszilis + újkori) fajok jelenlegi száma: 48 271

The World Foraminifera Database

A valaha leírt összes (újkori és fosszilis) foraminiferafaj világadatbázisa a World Register of Marine Species (WoRMS) részét képezi, amely egy globális kezdeményezés az összes tengeri élőlény nyilvántartására.

Keresés az adatbázisban (fosszilis és/vagy recens fajok)

Az alapértelmezett beállítás a fosszilis és recens fajok teljes adatbázisában való keresés. Ha csak a recens (élő) taxonokban szeretne keresni, akkor jelölje be az “extant” jelölőnégyzetet a Taxon Search ablakban.

Mi a foraminiferák?

A foraminiferák (“lyukhordozók”), röviden foraminiferák vagy forámok, az amőboid (egysejtű) protozoák nagy törzse, amelyek hálózatos pszeudopodokkal, finom citoplazma szálakkal rendelkeznek, amelyek dinamikus hálót alkotva elágaznak és egyesülnek. Általában tesztet (vagy héjat) alkotnak, amely egy vagy több kamrából állhat, és kalcium-karbonátból (CaCO3) vagy egymáshoz ragasztott ásványi szemcsékből vagy más részecskékből áll. A tesztek általában 0,5 mm-nél kisebbek, de a legnagyobbak akár 20 cm átmérőjűek is lehetnek. A foraminiferák az élőlények legelterjedtebb és tudományosan legfontosabb csoportjai közé tartoznak. A nemrégiben elpusztult planktikus foraminiferák tesztjei olyan nagy mennyiségben fordulnak elő, hogy a Föld felszínének egyharmadát vastag takarót képeznek (mint a Globigerina ooze az óceánfenéken). A foraminiferák lényegében tengeri és torkolati őslények, amelyek a legnagyobb mélységektől egészen a legmagasabb csillagászati árapályszintig és az Egyenlítőtől a sarkokig minden környezetben élnek.

A foraminiferák jelentősége abból ered, hogy fosszilis tesztjeiket felhasználják a biosztratigráfiában, a paleokörnyezeti vizsgálatokban és az izotópgeokémiában. A legtöbb tengeri üledékes kőzetben való mindenütt jelenlétük, gyakran nagy, jól megőrződött, változatos együttesek formájában, azt eredményezte, hogy világszerte a fosszíliák legtöbbet tanulmányozott csoportja. Mivel a közelmúltbeli foraminiferák a biológusok részéről kevés érdeklődést váltottak ki, a paleontológusok kénytelenek voltak a legtöbb tanulmányt, beleértve a genetikai kutatásokat is, az élő faunán végezni.

Ez az oldal a következő célokat tűzte ki:

• a világ foraminiferafajainak katalógusa
• a foraminiferák nómenklatúrájának stabilitásának elősegítése
• a magasabb taxonómiai felülvizsgálatok eszközeként szolgáljon. és regionális monográfiák

Felsőbb osztályozás

A jelenleg elfogadott fajok listája-csoportnevek listája legalább 90%-ban teljes a közelmúltbeli fajok esetében, de számos taxonómia még felülvizsgálatra szorul, és az újonnan leírt fajokat a megjelenés után a lehető leghamarabb felveszik, mely feladatot a szerkesztők folyamatosan végzik. A fosszilis nemzetségek és magasabb taxonok többnyire teljesek, de a fosszilis fajok felvétele még sok évet vesz igénybe. A Foraminiferák magasabb osztályozására vonatkozóan jelenleg nem áll rendelkezésre széles körű konszenzus. Itt a Loeblich és Tappan (1987 és 1992) által megadott osztályozást használják leginkább a meszes taxonok esetében, az agglutinált taxonok esetében pedig Kaminski (2004) osztályozását követik, de a Foraminifera magasabb szintű osztályozása felülvizsgálat alatt áll, és a Pawlowski et al. (2013) és Holzmann és Pawlowski (2017) eddigi genetikai szekvencia-alapú eredményeinek megfelelően frissítették. A folyamatban lévő molekuláris filogenetikai vizsgálatok további eredményei remélhetőleg a jövőben segítenek a rendszertani rendszer stabilizálásában.

• Holzmann, M. és Pawlowski, J. (2017). A rotaliida foraminiferák frissített osztályozása a riboszomális DNS filogeniája alapján. Marine Micropaleontology 132, 18-34.
• Kaminski, M. A. (2004). Az agglutinált foraminiferák 2000. évi osztályozása. In: M. K. Bubik, Ma. (szerk.). Proceedings of the Sixth International Workshop on Agglutinated Foraminifera. Grzybowski Alapítvány különkiadása. Pp. 237-255.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1987). “Foraminifera nemzetségek és osztályozásuk”. Van Nostrand Reinhold, New York.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1992). A foraminiferák osztályozásának jelenlegi helyzete. In “Tanulmányok a bentikus foraminiferákról. Proceedings of the Fourth Symposium on benthic foraminifera, Sendai, 1990”. (Y. Takayanagi, és T. Saito, szerk.), pp. 93-102. Tokai University Press, Tokyo.
• Pawlowski, J., Holzmann, M., Tyszka, J. (2013). A Foraminifera új szuperordinális osztályozása: A molekulák találkoznak a morfológiával. Marine Micropaleontology 100, 1-10

Steering Committee

Egy irányítóbizottság biztosítja a nemzetközi felügyeletet és elősegíti a World Foraminifera Database összeállítását és ésszerűsítését.

Az irányítóbizottság tagjai:

• Tomas Cedhagen, Dánia
• Peter Frenzel, Németország
• Bruce W. Hayward, Új-Zéland (összehívó)
• Martin Langer, Németország
• François Le Coze, Franciaország
• Briony Mamo, Hongkong, Kína
• Willem Renema, Hollandia
• Daniel Vachard, Franciaország

Szerkesztők

Adatok bevitele és taxonómiai döntések meghozatala a felelősségi körükbe tartozó csoportokban:

• Hayward, Bruce: Foraminifera

• Encarnação, Sarita Camacho da: Le Coze, François: Foraminifera
• Le Coze, François: Foraminifera
• Vachard, Daniel: Foraminifera

A bejegyzésekért, a nevek érvényességéről szóló döntésért a szerkesztők felelősek. A javítások és kihagyások bármelyik szerkesztőhöz intézhetők.

Egy faj felvétele az adatbázisba szerkesztői döntés, de elismerjük, hogy az ilyen döntéseket az új információk fényében gyakran felül kell vizsgálni. Ha nem ért egyet a rangidős szinonímiával kapcsolatos döntésekkel vagy a nemzetségbeosztással, kérjük, küldje el nekünk a jól megindokolt-korrigált hozzárendelését. Az adatokat csak a szerkesztők egészíthetik ki vagy módosíthatják, de bárki feltölthet képeket azonosításokkal és helymeghatározási információkkal, bár ezeket a szerkesztők ellenőrzik és módosíthatják

History of the World Foraminifera Database

A World Foraminifera Database a Tomas Cedhagen és Onno Gross által összeállított európai friss fajlistaként indult. Ehhez 2010-ben hozzáadódott a Barun Sen Gupta és munkatársai által összeállított Mexikói-öbölbeli recens fajok listája, valamint a Bruce Hayward és munkatársai által összeállított új-zélandi modern fajok listája.

• Gross, O. (2001). Foraminifera, in: Costello, M.J. et al. (szerk.) (2001). A tengeri fajok európai regisztere: az Európában előforduló tengeri fajok ellenőrző listája és az azonosításukat segítő útmutatók bibliográfiája. Collection Patrimoines Naturels, 50: 60-75.
• Hayward, B.W., Tendal, O.S., Carter, R., Grenfell, H.R., Morgans, H.E.G., Scott, G.H., Strong, C.P., Hayward, J.J. (2012). Phylum Foraminifera. Foraminifera and Xenophyophores. In: Gordon, D.P. (szerk.). A biológiai sokféleség új-zélandi leltára: A Species 2000 Symposium Review. Canterbury University Press,. Christchurch. Pp. 242-287
• Sen Gupta, B.K., Smith, L.E., Machain-Castillo, M.L. (2009). Foraminifera of the Gulf of Mexico, Pp. 87-129 in Felder, D.L. és D.K. Camp (szerk.), Gulf of Mexico-Origins, Waters, and Biota. Biodiversity. Texas A&M Press, College Station, Texas.

Azóta felvételeket adtak hozzá Johannes Pignatti katalógusából a recens foraminiferákról, a recens foraminiferák számos nagy atlaszából és az Ellis and Messina Catalogue of Foraminifera kimenetéből. Tisztában vagyunk azzal, hogy sok, 1980 óta leírt taxont még nem találtak meg és nem adtak hozzá

Ki írta le a legtöbb recens foraminiferafajt?

• McCulloch – 2429
• Cushman – 1134
• D’Orbigny – 691
• Brady – 398
• Saidova – 394
• Earland – 394
• Earland – 398
• Saidova – 394
• Earland. 306

Irodalomtár

Az irodalomtár jelenleg ~9000 hivatkozást tartalmaz, a régebbi művek közül sok szkennelt PDF formátumban is elérhető.

Fotógaléria

A Fotógaléria jelenleg ~6000 képet tartalmaz, amelyek fajrekordokhoz kapcsolódnak, és amelyeket nagyrészt Tomas Cedhagen adott be Brady Challenger kötetéből és Cushman monográfiáiból, de néhány más monográfiából is.

Elvégzendő feladatok

Az irányítóbizottság a következő feladatokat határozta meg, amelyeket a Forams in WoRMS adatbázis hasznosságának és értékének javítása érdekében lehetne elvégezni. A feladatokat a három érzékelt prioritási lista egyikébe sorolták. Felkérünk minden olyan dolgozót, aki az alábbi feladatok bármelyikéhez önkéntes alapon való hozzájárulással szeretné hasznosabbá tenni ezt az adatbázist, hogy vegye fel a kapcsolatot az irányítóbizottság elnökével, Bruce Haywarddal e-mailben.

1. Vegye fel a kapcsolatot az irányítóbizottság elnökével. Elsődleges prioritás

• Az összes hivatalosan javasolt foraminifera rendszertani név 100%-os bevitele. .
• Az összes új taxon felvétele a javasoltak szerint.
• A magasabb taxonómia frissítése, amint azt a molekuláris bizonyítékok alapján felülvizsgálják.
• A taxonómia és a taxonok szinonimáinak frissítése, amint új molekuláris és átfogó morfológiai tanulmányok jelennek meg.
• Az összes elfogadott, létező taxon típusainak vagy igazolt példányainak képi lefedettségének 100%-os elérése

2. Az összes elfogadott, létező taxon típusainak vagy igazolt példányainak képi lefedettsége. Második prioritás

• A 2010 előtti összes bejegyzés ellenőrzése annak biztosítása érdekében, hogy azok már ne tartalmazzanak hibákat.
• Tárgyaljuk meg az intézményi (hosszú életű) weboldalakon elérhető, jó hírű képekre/taksonómiai leírásokra mutató linkeket.
• Az összes elfogadott fosszilis taxon típusairól vagy igazolt példányairól készült képek 100%-os lefedettségének elérése
• Az összes fosszilis taxon hozzárendelése az alábbi időszakok közül legalább egy vagy több időszakhoz: Paleozoikum, triász, jura, kréta, paleogén, neogén.
• Megadni egy linket a weben vagy feltölteni a WoRMS-be az új foraminifera taxonokat leíró összes publikáció másolatát.
• A Forams in WoRMS irodalmi források adatbázisát (jelenleg 11 000 bejegyzés) kiindulópontként használja a világ foraminifera-kiadványainak átfogó bibliográfiájának kidolgozásához.

3. Harmadik prioritás

• Adjon ismert időintervallumokat (pontosabban, mint időszakokat) minden fosszilis taxonhoz.
• Megszerezni a globális földrajzi elterjedési adatokat az összes ma élő fajra vonatkozóan.
• Megszerezni a globális földrajzi elterjedési adatokat az összes fosszilis fajra vonatkozóan.

Linkek más foraminiferás oldalakra

A kezdők vagy a nem szakemberek segítésére itt nyújtunk egy válogatást a további információkat nyújtó foraminiferás honlapokra mutató linkekből.

• A foraminifera-kutatásban használt kifejezések illusztrált glosszáriuma http://paleopolis.rediris.es/cg/CG2006_M02/index.html
• Minták előkészítésének technikái a foraminiferák tanulmányozásához az osztályteremben http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Snyder&Huber.html
• Foraminifera tények http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Wetmore.html
• Wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Foraminifera
• Foraminifera referenciák http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/foramrefs.htm Foraminifera referenciák http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/foramrefs.htm
• Cushman Foundation for Foraminiferal Research http://www.cushmanfoundation.org/
• Grzybowski Foundation http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/
• The Micropalaeontological Society http://www.tmsoc.org/
• University of California Museum of Paleontology – Introduction to foraminifera http://www.ucmp.berkeley.edu/foram/foramintro.html
• University College, London – Foraminifera http://www.ucl.ac.uk/GeolSci/micropal/foram.html
• Chronos foram on-line atlases http://portal.chronos.org/gridsphere/gridsphere?cid=resources
• The Foraminifera.eu Project http://www.foraminifera.eu/
• E-formák http://www.eforams.org
• Molecular Database of Foraminifera http://forambarcoding.unige.ch/
• Biography of Joseph Cushman http://paleobiology.si.edu/cushman

Citation

A World Foraminifera Database adatainak tudományos publikációkban való felhasználását a következő hivatkozásokkal kell elismerni:

• Hayward, B.W.; Le Coze, F.; Vachard, D.; Gross, O. (2021). World Foraminifera Database. Hozzáférés: http://www.marinespecies.org/foraminifera 2021-03-25. doi:10.14284/305

Ha a World Foraminifera Database adatai az elemzésekben felhasznált rekordok jelentős részét teszik ki, az adatbázis főszerkesztőjével (főszerkesztőivel) kell felvenni a kapcsolatot. Lehetnek olyan további adatok, amelyek értékesnek bizonyulhatnak az ilyen elemzésekhez.
Az egyes oldalakat egyedileg írják és dátumozzák. Ezek külön is idézhetők: a megfelelő hivatkozást minden oldal alján megtaláljuk.

Róluk

A Világlista a fajok és magasabb taxonok neveinek kereshető katalógusa.

A katalógusban való navigálás a menüben található választási lehetőségek egyikére kattintva kezdődik, amelyet minden oldal tetején találunk

• Bevezetés erre a bevezető részre vezet
• Taxonok keresése egy lekérdezési oldalra vezet, amelyen keresztül az összes taxonoldal elérhető
• Taxonok böngészése egy taxonómiai fához vezet
• Ellenőrző lista egy lekérdezési oldalra vezet, amelyen közvetlenül egy geounitot lehet kiválasztani, ha az egység pontos neve már ismert. Így egy adott terület taxonjainak listája gyorsan megtalálható.
• Attribútumok egy olyan oldalra vezet, ahol (főleg) fosszilis tartományokat lehet lekérdezni
• Statisztikai adatok a World Foraminifera Database-ről
• Források egy olyan oldalra vezet, ahol a Foraminifera irodalom referenciáit lehet lekérdezni.
• Képek egy képgalériába vezet, ahol képek találhatók
• Bejelentkezés csak a szerkesztők számára elérhető.

Minden foraminifera faj vagy infraspecifikus taxon esetében, akár elfogadják, akár nem, a következő bejegyzések lehetnek:

1. nemzetségnév
2. az alnemzetségnév, ha van,
   N.B. az alnemzetségneveket az ICZN szerint nem kell mindig idézni; az alnemzetségnév nélküli kombinációk elfogadása az adatbázisban “alternatív képviseletnek” minősül.
3. a fajnév
4. az infraspecifikus név, ha alkalmazható
5. a fajnév szerzője és éve, zárójel nélkül vagy zárójelben, attól függően, hogy ez az eredeti kombináció vagy sem
6. Az AphiaID (egyedi numerikus adatbázis-azonosító)
7. A magasabb besorolás (Loeblich és Tappan, 1990, 1992 szerint)
8. A “elfogadott” vagy “nem elfogadott” státusz (ha alkalmazható; A junior szinonímia általában a publikált revízió alapján történik)
9. A rekord státusza (jelzi, hogy ki ellenőrizte a rekordot)
10. A taxon rangja, e.pl. faj
11. Szülő: közvetlenül magasabb taxon, pl. nemzetség, amelyhez a jelenlegi taxon tartozik
12. Szinonimizált taxonok: a jelenlegi névhez kapcsolódó junior szinonimák listája
13. Források: az eredeti leírás és adott esetben egy közelmúltbeli revízió irodalmi hivatkozása (mint a “rekord alapja”).
14. Fiatal taxonok: minden közvetlen alárendelt taxon, pl. alfajok
15. Környezet: tengeri vagy brakkos
16. Fosszilis elterjedési terület: csak a közelmúltban vagy fosszilisan is ismert (hamarosan korszakos elterjedési területek is rendelkezésre állnak majd)
17. Elterjedés: a taxon közelmúltbeli földrajzi elterjedésének feltüntetése, legalább a holotípus származása alapján,
    különböző földrajzi területeket lehet feltüntetni, lehetőleg a tengeri ökorégiót (lásd Spalding et al. 2007), de gyakran az ország kizárólagos gazdasági övezetét is. A junior szinonimák elterjedési területei automatikusan megjelennek minden “elfogadott faj”
18. Mintadarab: a típuspéldányra vonatkozó információk, vagy a publikált példányokra vonatkozó információk
19. Hivatkozások: más foraminiferális forrásokra, képekre és egyéb információkra az egyes szervereken. A jelenlegi általános linkek a következők:
20. Jegyzetek: bármilyen további releváns információ, beleértve leírásokat, megjegyzéseket, magyarázatokat stb.
21. Képek: az oldalra feltöltött fényképek vagy egyéb képek
    A taxonok “objektív” képeit részesítjük előnyben, például a típuspéldányok fényképeit vagy illusztrációit. Nem bátorítjuk az azonosítatlan foraminiferák fotóit, de a megbízhatóan azonosított, szerzői jogdíjmentes képeket szívesen fogadjuk.
22. LSID jelölés: (hasonlóan a publikációkban használt ISBN-hez)
23. Szerkesztési előzmények: a bejegyzés dátuma és az elvégzett változtatások, a szerkesztő neve
24. Linkek a rendszertani fához, a Google, a Google Scholar és a Google képekhez.

A magasabb taxonokra vonatkozó rekordok általában ugyanolyan szerkezetűek, mint a fajrekordok. A fenti elemek közül nem mindegyik létezik már az adatbázisba bevitt összes taxonra, de amint az idő engedi, hozzáadjuk őket.

Amit jelenleg ezzel az adatbázissal tehetsz, az az, hogy megtudod, mi a tárgyalt foraminifer jelenleg elfogadott kombinációja, mi a jelenleg elfogadott magasabb rendszertani hovatartozása, és honnan írták le eredetileg. Azt is ellenőrizheted, hogy mely elfogadott fajok fordulnak elő egy magasabb taxonban. Amit (még) nem tudsz megtenni, az az, hogy a nemzetség- és fajnév minden publikált kombinációját megtalálod, mivel eddig az eredeti és a jelenleg elfogadott kombinációkat részesítettük előnyben (így a nem eredeti, nem elfogadott kombinációk gyakran még hiányoznak). Amit szintén nem tudsz átfogóan megtenni, az a fajok és magasabb taxonok elterjedésének nyomon követése vagy a fajok regionális listáinak kivonása, mivel egyelőre nincs összhang a világ minden tájáról bevitt adatok között.