In den 1700er Jahren trennten sich die Ponca-Indianer vom Stamm der Omaha und gründeten Dörfer entlang des Niobrara River und des Ponca Creek im heutigen Nebraska und South Dakota. Dort lebten sie vom Gartenbau und der Bisonjagd. Bis zur Ankunft der Teton Sioux um 1750 erstreckte sich das Gebiet der Poncas vom Missouri River bis zu den Black Hills. Pocken und andere Krankheiten im achtzehnten und neunzehnten Jahrhundert ließen ihre Zahl schrumpfen. Die Kriegsführung der Sioux zwang sie zum Rückzug in ein Gebiet nahe der Mündung des Niobrara River.
Die Ponca führten nie Krieg mit den Vereinigten Staaten, mit denen sie 1817 ihren ersten Friedensvertrag unterzeichneten. Im Jahr 1825 folgte ein Handelsabkommen. In den Jahren 1858 und 1865 unterzeichneten die Ponca außerdem Verträge über Landabtretungen als Gegenleistung für militärischen Schutz und wirtschaftliche Unterstützung. In den 1860er und 1870er Jahren brachten Dürreperioden, erfolglose Bisonjagden und die ständige Bedrohung durch die Sioux die Ponca an den Rand des Verhungerns. Anstatt ihre vertraglichen Verpflichtungen zu erfüllen, traten die Vereinigten Staaten 1868 das Land der Ponca an die Sioux ab. Anstatt den Vertrag mit den Sioux neu zu verhandeln, siedelte die Bundesregierung die Ponca 1877 in das Indianerterritorium um.
Die Umsiedlung der Ponca war eine grobe Fehlentscheidung. Die Vereinigten Staaten versäumten es nicht nur, die Zustimmung der Ponca-Häuptlinge einzuholen, sondern versäumten es auch, ein Reservat mit angemessenen Einrichtungen zu schaffen. Einigen Schätzungen zufolge kamen in den ersten Jahren in Oklahoma fast 158 Ponca, also fast ein Drittel des Stammes, ums Leben. Nach dem Tod seines Sohnes im Jahr 1878 kehrte der Ponca-Häuptling Standing Bear mit einer Gruppe von Anhängern nach Nebraska zurück. Seine Verhaftung und sein Prozess führten zu einer bahnbrechenden Entscheidung in der indianischen Bundesrechtsprechung. Das Gericht entschied in der Rechtssache Standing Bear gegen Crook (1879), dass Indianer gemäß dem vierzehnten Verfassungszusatz als Personen anerkannt wurden und daher ihre Rechte einklagen konnten. Die Entscheidung spaltete den Stamm in eine nördliche und eine südliche Gruppe, da die Anhänger von Standing Bear in Nebraska bleiben durften.
Die südlichen Ponca unter ihrem Oberhäuptling White Eagle ließen sich in einem 101.000 Morgen großen Reservat in der Nähe des Zusammenflusses von Salt Fork und Arkansas im Cherokee Outlet (den heutigen Bezirken Kay und Noble in Oklahoma) nieder. Sie errichteten Winterlager entlang des Arkansas River und pflegten weiterhin ihre Stammesbräuche. Sie verpachteten den größten Teil ihres Landes an euroamerikanische Farmer und Viehzüchter, darunter die Miller-Brüder von der 101 Ranch.
Die Ponca-Kultur geriet in den 1880er und 1890er Jahren unter Druck. Agenten und Missionare versuchten, traditionelle Tänze, Heiratspraktiken und religiöse Bräuche abzuschaffen. Trotz des Widerstands der Stämme zwang die Regierung ihnen 1892 ihre Zuteilungspolitik auf, was schließlich zur Veräußerung eines Großteils ihres Landes führte. Die Ponca gerieten erneut unter Druck, nachdem der Ölmann Ernest Whitworth Marland 1911 in ihrem Reservat und in dessen Nähe Öl entdeckt hatte. Die Erschließung der Ponca- und Tonkawa-Ölfelder führte zu Umweltproblemen und zwang die Ponca, ihre Winterlager entlang des Arkansas River aufzugeben und in einzelne Zuteilungen umzuziehen.
Trotz dieses Drucks gestalteten die Ponca ihre Kultur weiter. Viele schlossen sich der 101 Ranch Wild West Show der Miller Brothers an, die es ihnen ermöglichte, Aspekte ihrer traditionellen Lebensweise nachzustellen. Die Einführung der Peyote-Religion ermöglichte es ihnen, ihre eigene Version des Christentums zu etablieren. Zwei gebildete junge Poncas, Frank Eagle und Louis McDonald, waren 1918 Mitbegründer der Native American Church.
Im Jahr 1919 gründeten Ponca-Veteranen des Ersten Weltkriegs ein Chapter der American Legion mit dem Namen Buffalo Post 38. Diese Organisation belebte traditionelle kriegsbezogene Praktiken wie den Ponca-Kriegstanz (Heluska) wieder. Das Tanzen blieb der zentrale Ausdruck der traditionellen Ponca-Kultur. In ganz Oklahoma waren die Ponca für ihre Kenntnisse von Liedern und Tänzen bekannt. Sie leisteten einen wichtigen Beitrag zur Entwicklung der Powwow-Kultur in den südlichen Plains. Im Jahr 1926 wurde Gus McDonald zum ersten Weltmeister der Fancy Dancer gekrönt, was den Ponca die Ehre einbrachte, jedes Jahr die Weltmeisterschaften auszurichten. Das jährliche Ponca-Powwow, eines der ältesten Powwows in Oklahoma, findet jedes Jahr im August statt.
Im Jahr 1950 organisierten die Ponca eine Stammesregierung gemäß dem Oklahoma Indian Welfare Act von 1936. Der Hauptsitz des Stammes befindet sich in White Eagle, fünf Meilen südlich von Ponca City. 1961 war Clyde Warrior, ein Aktivist der Ponca, Mitbegründer des National Indian Youth Council. Warriors Aufruf zur Selbstbestimmung der Stämme ebnete den Weg für eine neue Generation indianischer Aktivisten in den 1960er und frühen 1970er Jahren.
Die Politik der Ponca-Stämme war in den 1970er und 1980er Jahren von Aufruhr geprägt. Anschuldigungen wegen Betrugs und Misswirtschaft führten zu einer hohen Fluktuationsrate bei den Beamten des Stammesgeschäftsausschusses, dem Führungsgremium des Stammes. Als die Bundesregierung in den 1980er Jahren die Mittel für den Stamm reduzierte, begann das Komitee mit einem Bingo-Betrieb, um die Einnahmen zu erhöhen. Gegenwärtig ist das indianische Glücksspiel eines der umstrittensten Themen zwischen dem Bundesstaat Oklahoma und der Ponca-Gemeinschaft.
Die Beziehungen zwischen den Ponca in Oklahoma und den Ponca in Nebraska verbesserten sich, nachdem die US-Regierung letztere 1990 wieder anerkannt hatte. Seitdem haben beide in zahlreichen Fragen zusammengearbeitet, unter anderem bei der Rückführung menschlicher Überreste und Artefakte im Rahmen des NAGPRA-Gesetzes (Native American Graves Protection and Repatriation Act). Eine der größten Herausforderungen für die Ponca-Gemeinschaft in Oklahoma ist die Bewahrung ihrer Sprache und kulturellen Traditionen. Im Jahr 2003 hatte der Ponca-Stamm von Oklahoma 2.549 registrierte Mitglieder.