Der Zusammenhang zwischen Migräne und funktionellen gastrointestinalen Störungen ist durch zahlreiche klinische Beobachtungen und epidemiologische Studien bestätigt worden. Bei den meisten Patienten treten während eines Migräneanfalls neben verschiedenen neurologischen und vaskulären Symptomen auch gastrointestinale Störungen wie Übelkeit, Erbrechen, Bauchschmerzen oder Durchfall auf. Funktionelle gastrointestinale Störungen wie das Reizdarmsyndrom (IBS) werden bei Migränepatienten auch in der Zeit zwischen den Attacken beobachtet. Andererseits haben 23-53 % der IBS-Patienten häufig Kopfschmerzen. Migräne und Reizdarmsyndrom treten häufig zusammen mit Fibromyalgie und anderen chronischen Schmerzsyndromen und funktionellen Störungen auf. Migräne und Reizdarmsyndrom betreffen etwa 10-20 % der Allgemeinbevölkerung, meist junge Erwachsene. Beide Erkrankungen treten häufiger bei Frauen auf, was möglicherweise auf die Rolle von Östrogen in der Pathogenese zurückzuführen ist. Auf der Suche nach den gemeinsamen pathogenetischen Mechanismen von Reizdarmsyndrom und Migräne werden die Rolle der Gehirn-Darm-Achse sowie neuroimmune und neuroendokrine Wechselwirkungen untersucht. Der Einfluss von Stress auf das Auftreten und die Schwere von Symptomen scheint mit einer Hyperaktivität der Hypothalamus-Hypophysen-Nebennieren-Achse verbunden zu sein. Das enterische Nervensystem als Quelle zahlreicher Neurotransmitter und viszeraler Reflexe ist ein plausibler gemeinsamer pathogener Zusammenhang zwischen Reizdarmsyndrom und Migräne. Insbesondere Serotonin, der wichtigste Neurotransmitter des Gastrointestinaltrakts, spielt eine wichtige Rolle bei der Pathogenese von Reizdarmsyndrom und Migräne. Heutzutage sind Agonisten und Antagonisten der serotonergen Rezeptoren die wirksamsten Medikamente für die Behandlung von Reizdarmsyndrom und Migräne. Einige Nebenwirkungen von Triptanen, 5-HT(1B/D)-Agonisten, die in der Migränebehandlung eingesetzt werden, könnten mit dem Einfluss der Triptane auf die Magen-Darm-Funktionen zusammenhängen. Ein besseres Verständnis des Zusammenhangs zwischen Migräne und Reizdarmsyndrom könnte zu einer wirksameren Behandlung beider Krankheiten führen.