Im Jahr 1959 erwarb William Morgan von Morgan Marine, einem Bootsbauer aus Silver Bay am Lake George, New York, den Namen Hacker-Craft mit dem Ziel, das historische Erbe des Unternehmens wiederzubeleben.
Morgan Marine nahm erhebliche strukturelle und technische Änderungen vor. Durch den Einsatz neuer Technologien, die Hacker nicht zur Verfügung standen, konnten die Boote in einigen subtilen, aber wichtigen Punkten verbessert werden. Während Hacker Motoren mit 110 PS (82 kW) verwendet hatte, konnte Morgan Marine diese Boote mit Crusader-Motoren mit 350 PS (260 kW) oder 454 PS (339 kW) antreiben, die eine Geschwindigkeit von über 50 Meilen pro Stunde erreichen konnten. Um diese verbesserten Motoren aufnehmen zu können, musste Morgan Marine die Stützen stärker machen als bei den ursprünglichen Entwürfen. Die größte Errungenschaft von Morgan war jedoch die Verbesserung des Fahrverhaltens der Hacker Crafts. Wenn die alten Hacker Crafts mit Höchstgeschwindigkeit gefahren wurden, konnte sich der Bug anheben und die Sicht des Fahrers versperren. Durch eine Überarbeitung des Bodens sorgte Morgan dafür, dass das Boot ebener im Wasser lag.
Zu dieser Zeit waren viele der ursprünglichen Vorrichtungen verloren gegangen, und wo es nötig war, wurden neue Sandgussstücke für die Beschläge angefertigt. Während die traditionelle Handwerkskunst größtenteils beibehalten wurde, machte Morgan als Zugeständnis an den technischen Fortschritt einige bedeutende Verbesserungen gegenüber den alten Plänen: Doppelauspuffanlagen anstelle der ursprünglichen Einzelauspuffanlage, um die Motorleistung zu verbessern; Verwendung von Beschlägen aus rostfreiem Stahl, damit Lochfraß kein Problem mehr darstellt; modernste Verkapselungs- und Verklebungstechniken mit Epoxidharz; dreifach beplankte Böden, die vollständig mit Epoxidharz überzogen sind; doppelt beplankte Seiten und ein mit Epoxidharz getränktes Deck; 25 % mehr Spanten; die doppelte Anzahl an Bodenhölzern; bis zu 18 Lackschichten; die Verwendung von Mahagoni aus Honduras, das aus nachwachsenden Rohstoffen gewonnen wird; eine neue, verbesserte Steuerung für bessere Manövrierfähigkeit und laminierte Windschutzscheiben mit blauer oder grüner Tönung.
Im Jahr 2004 kaufte Robert Wagemann das Unternehmen von William Morgan. Im Jahr 2008 erwarb George Badcock’s Erin Investments eine Mehrheitsbeteiligung an dem Unternehmen von Robert Wagemann. In der Folge eröffnete das Unternehmen eine 32.000 Quadratmeter große Produktionsstätte in Ticonderoga und verlagerte die Produktion von Silver Bay dorthin, um die Kapazität zu erhöhen. Im Jahr 2011 übernahm Erin Investments das Unternehmen vollständig.
Neben der neuen Produktionsstätte wurde der Hauptsitz des Unternehmens am Lake George, der auch einen Yachthafen mit umfassendem Service beherbergt, um einen neuen Ausstellungsraum erweitert, in dem vier Boote ausgestellt werden können. Die Büroräume der Zentrale und alle Lager- und Servicegebäude wurden repariert bzw. renoviert. Der Campus wurde landschaftlich gestaltet und die Parkplätze verbessert.
Im Jahr 2011 war Hacker-Craft in TV- und Katalogaufnahmen für Marks & Spencer (UK), Tommy Hilfiger und Nautica zu sehen.
Im Jahr 2011 wurde die speziell entworfene Neiman Marcus Edition Hacker-Craft als „Fantasiegeschenk“ im legendären Neiman Marcus Weihnachtsbuchkatalog ausgewählt.
Im Jahr 2012 führte eine Partnerschaft mit Tommy Bahama zu einem individuell gestalteten Modell, der Tommy Bahama Edition Hacker-Craft (TBE).
Im Jahr 2015 führte das Unternehmen einen Limousinen-Yachttender ein und ernannte die Sierra Boat Company am Lake Tahoe, Nevada, und die Wawasee Boat Company in Syracuse, Indiana, zu autorisierten Vertretern.
Im Jahr 2017 ernannte das Unternehmen die in Thailand ansässige Classic Boats Lifestyle, Ltd. (CBL) zum offiziellen Vertragshändler.
Im Jahr 2019 erschien ein Hacker Craft Boot in einer Episode der zweiten Staffel von Netflix’s Ozark.