Biorepository

Lagerung von FFPE-Gewebe

FFPE-Proben können in Krankenhäusern, Biobanken und Forschungszentren gelagert werden. In den Lagereinrichtungen werden häufig Aufzeichnungen darüber geführt, wie das Gewebe entnommen wurde, welche Konservierungsverfahren angewandt wurden und welche demografischen Informationen (z. B. Herkunft, Dauer, Alter, ethnische Zugehörigkeit, Geschlecht und Krankheitsstadium) über den Spender vorliegen. Die demografischen Informationen sind ein wichtiger Faktor in der Forschung und bei klinischen Studien. FFPE-Proben, die ordnungsgemäß aufbewahrt werden, sind sehr wertvoll und können bei Raumtemperatur über einen langen Zeitraum gelagert werden.

Anwendungen

FFPE-Proben sind wichtig, da sie häufig für folgende Zwecke verwendet werden:

a) Immunhistochemie

Die geschnittenen FFPE-Proben werden auf einen Objektträger aufgezogen, in eine Lösung mit Antikörpern getaucht und dann angefärbt, damit sie deutlicher zu sehen sind. Diese Methode ist wichtig für Ärzte und Forscher, die im Gewebe nach Krankheiten wie Alzheimer oder Krebs suchen.

b) Onkologie

FFPE-Proben sind im Bereich der Onkologie unerlässlich, da Tumorgewebe eine charakteristische Morphologie aufweist, die es den Forschern ermöglicht, nach bestimmten Proteinen zu suchen. Diese Proteine werden dann zur Beurteilung von Behandlung und Diagnose herangezogen.

c) Hämatologie

In der Erforschung des Blutes und seiner Störungen sind FFPE-Proben wichtig für die Bestimmung von Anomalien und die Entdeckung von Heilmethoden. Die Proben können in Studien zur Geweberegeneration, Genetik und Toxikologie verwendet werden.

d) Immunologie

FFPE-Proben von einem Spender mit einer Autoimmunerkrankung helfen bei der Ermittlung der Ursache und der Entwicklung einer Therapie für die Erkrankung.

Komplikationen oder Einschränkungen

Eine der möglichen Einschränkungen des Fixierungsprozesses mit Formalin ist die mögliche Denaturierung der im Gewebe vorhandenen Proteine, wodurch sie für Antikörper nicht mehr nachweisbar sind. Um dieses Problem auszugleichen, wurden Antigen-Retrieval-Techniken entwickelt. Mit der Antigenrückgewinnungstechnik werden speziell DNA, RNA und Proteine aus FFPE-Proben zurückgewonnen. Damit diese Methode funktioniert, ist die Qualität der FFPE-Proben entscheidend. Ein weiteres Problem besteht darin, dass es kein Standardverfahren für die präanalytische Aufbereitung wie Fixierung und DNA-Isolierung gibt. Dies bedeutet, dass geringfügige Unterschiede wie die unterschiedliche Verwendung von Instrumenten, die Handhabung der Proben und die Methodik zu Abweichungen führen können, die sich auf die Qualität der DNA und der Studienergebnisse auswirken. Einige der Faktoren, die nachweislich die Studienergebnisse von FFPE-Proben beeinflussen, sind:

1. Ungenaue Protokollierung des Fixierungsprotokolls

2. Variation der Fixierungszeit

3. Temperatur während Fixierung

4. Lagerungsbedingungen von FFPE-Proben

Qualitätskontrolle

Um die höchste Qualität von FFPE-Proben zu gewährleisten, sollten diejenigen, die diese Proben sammeln und lagern sollten diejenigen, die diese Proben sammeln und lagern:

1. Ethische und rechtliche Standards einhalten.

2. Eine klare und genaue Aufzeichnung der Spender führen.

3. Informationen über den Probenahme- und -entnahmeprozess bereitstellen

4. Bei der Probenahme von einem zugelassenen Pathologen beaufsichtigt werden

5. Eine lückenlose Überwachungskette haben

6. Nur mit einem sorgfältig ausgewählten Netz von Händlern zusammen, die durchgängig qualitativ hochwertige und genaue Proben liefern

Fresh Frozen Tissue

Fresh Frozen Tissue sind Proben, die mit flüssigem Stickstoff durch eine als „Flash Freezing“ bekannte Methode konserviert werden. Diese Proben werden dann in einem Gefrierschrank gelagert, der auf eine Temperatur von weniger als -80 Grad Celsius eingestellt ist. Frisch gefrorenes Gewebe hat andere Anwendungsmöglichkeiten als FFPE-Proben, da es auch für Studien zur nativen Morphologie oder für molekulare Analysen verwendet werden kann.

FFPE-Proben vs. frisch gefrorenes Gewebe

FFPE und frisch gefrorenes Gewebe haben ihre Vor- und Nachteile. Es handelt sich um zwei verschiedene Arten von Proben, die je nach den Anforderungen der Forschung oder der klinischen Studie unterschiedliche Verwendungszwecke haben.

1. FFPE-Blöcke sind sehr hart und können leicht bei Raumtemperatur jahrzehntelang gelagert werden, ohne dass eine spezielle Ausrüstung erforderlich ist, was diese Art von Gewebeproben sehr kosteneffizient macht.

2. Es gibt ein großes Archiv von FFPE-Proben, die den Forschern zur Verfügung stehen, da sie leicht gelagert werden können.

3. FFPE-Proben werden seit Jahrzehnten verwendet und sind den Pathologen sehr vertraut.

4. Frischgefrorenes Gewebe eignet sich viel besser für die Analyse nativer Proteine, die Polymerase-Kettenreaktion und die DNA-Sequenzierung der nächsten Generation.

5. Frischgefrorenes Gewebe gewährleistet die Erhaltung von DNA, RNA und nativen Proteinen.

6. Frischgefrorenes Gewebe erfordert eine spezielle Ausrüstung zur Lagerung. Das bedeutet, dass mechanisches Versagen, Stromausfälle und Nachlässigkeit die Qualität der Proben beeinträchtigen können.

1) Ward T. The importance of proper formalin fixation of FFPE samples. Personalis. Accessed 6/19/2018. https://www.personalis.com/importance-proper-formalin-fixation-ffpe-specimens/

2) Doiron L. 5 Qualitätskontrollregeln für Krebsgewebebanken. Folio Conversant. Accessed 6/19/2018. http://www.conversantbio.com/blog/bid/339034/5-Quality-Control-Rules-for-Cancer-Tissue-Banks

3) FFPE vs. gefrorene Gewebeproben. BioChain. Accessed 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/ffpe-vs-frozen-tissue-samples/

4) Was ist FFPE-Gewebe und wofür wird es verwendet. BioChain. Accessed 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/what-is-ffpe-tissue/