Misionář San Buenaventura, založený 31. března 1782, je devátou misií v řetězci, poslední založenou ještě za života otce Serry a jednou ze šesti, které osobně zasvětil. Misie byla postavena jako součást části Santa Barbara Channel, která zahrnovala misie v Santa Barbaře a La Purísima a El Presidio v Santa Barbaře.
Otcové, kteří již měli tři misie na severu a tři v jižní části Kalifornie, se obávali indiánského povstání ve střední části státu. Domnívali se, že indiánská vzpoura by vzhledem k terénu oblasti mohla mít ničivé následky. Hory v oblasti průlivu Santa Barbara se ladně svažují k oceánu a ponechávají jen málo prostoru pro průchod. Misionáři se obávali, že rozzuření indiáni by si mohli stát snadno rozdělit a omezit Španěly na komunikaci po moři. Ke vzpouře nikdy nedošlo a misie San Buenaventura pokračovala jako velký zemědělský producent.
Indiáni v oblasti byli Čumaši, kteří pokrývali oblast od Ventury na sever až po San Luis Obispo. Čumašové byli ze všech misijních kmenů nejvyspělejší. Pomocí kánoí, jako je tato replika prkenné kánoe, Čumašové často cestovali na ostrovy v kanálu Santa Barbara, vzdálené až 65 mil od pevniny. Čumašové vynikali ve výrobě košíků, což Španělé často používali k posouzení inteligence indiánského kmene. Indiáni používali koše na vaření, chytání ryb a nošení vody.
Pod vedením otce Cambona postavili domorodci sedmimílový akvadukt, který přiváděl vodu z řeky Ventura do této budovy na filtrování vody. Byl vhodně pojmenován el caballo, což ve španělštině znamená „kůň“, protože výtok prý připomínal koňskou hlavu. El caballo později vzbuzoval hrůzu a opovržení, když byl přeměněn na vězení.
Jedinečné pro misii San Buenaventura jsou tyto dřevěné zvony. Používaly se během Svatého týdne, mezi Květnou nedělí a Velikonocemi, zatímco kovové zvony mlčely. Ačkoli jsou to jistě originály, jejich původ je záhadou.
Po sérii zemětřesení a doprovodné přílivové vlně v roce 1812 byl kostel krásně zrestaurován; nachází se v něm 400 let starý krucifix z Filipín. Uprostřed nad svatostánkem je vyobrazen svatý Bonaventura, patron misie. V kostele se také nachází svatyně Nuestra Señora de Guadalupe.