Bill a Flora Hewlettovi spojili své filantropické aktivity do Nadace Williama R. Hewletta, kterou 53letý Bill založil v roce 1966 ve svém domě v kalifornském Palo Altu. Zakládajícími členy správní rady byli Bill, Flora a nejstarší syn manželů Walter Hewlett. Léta 1966-1972 byla označována jako „léta obývacího pokoje“. Flora Hewlettová byla členkou správní rady a Bill Hewlett byl aktivní součástí nadace až do své smrti. Bill Hewlett se snažil financovat zavedené organizace působící v oblastech jeho zájmu. V prvních deseti letech nadace poskytla téměř 15,3 milionu dolarů organizacím působícím v oblasti vzdělávání, obyvatelstva, divadelního umění, životního prostředí, zdravotnictví a sociálních služeb.
V roce 1972 byla správní rada nadace rozšířena o Williama A. Hewletta a Jamese S. Hewletta. V roce 1974 nadace přijala svého prvního výkonného ředitele Johna Maye, který byl zároveň výkonným ředitelem Sanfranciské nadace. Po smrti Flory Hewlettové v roce 1977 a na její památku byl název nadace změněn na „The William and Flora Hewlett Foundation“. Krátce poté byl prezidentem nadace jmenován bývalý rektor Kalifornské univerzity Roger W. Heyns a předsedou správní rady se stal Bill Hewlett. Správní rada byla rozšířena o Eleanor Hewlett Gilmonovou a Mary Hewlett Jaffeovou, dcery Billa a Flory. Od roku 1981 se většina správní rady nadace skládala z členů, kteří nebyli členy rodiny.
Nadace získala uznání za svou činnost v oblasti řešení konfliktů, vzdělávání, ochrany životního prostředí, scénického umění a jako podporovatel organizací v oblasti Bay Area.
V roce 1993 se jmenováním bývalého rektora Kalifornské univerzity Davida P. Gardnera, který nahradil Rogera Heynse, jenž po 15 letech odešel do důchodu, rozšířilo zaměření nadace. Nadace rozšířila financování ekologických projektů, dříve omezené na Kalifornii, na celý západ Spojených států a Kanadu. Nadace se také začala zaměřovat na reformy školství K-12. Gardner zavedl nový program na podporu vztahů mezi USA a Latinskou Amerikou. Gardner v nadaci působil šest let.
Během Gardnerova působení nadace zavedla omezení funkčních období programových pracovníků, přičemž funkční období končilo po šesti letech a po schválení správní radou mohlo být prodlouženo o tři roky. V roce 2005 bylo toto omezení funkčního období prodlouženo na osm let.
V lednu 2000 byl novým prezidentem nadace jmenován Paul Brest, bývalý děkan Stanford Law School. Ve funkci působil dvanáct let. Dne 12. ledna 2001 zemřel Bill Hewlett ve věku 87 let na selhání srdce. Během Brestova působení ve funkci prezidenta se nadace začala zaměřovat na udělování grantů na úsilí o omezení globálního oteplování a na rozšíření využívání otevřených vzdělávacích zdrojů. V této době se také nadace přestěhovala do Menlo Parku v Kalifornii.
Od roku 2012 zastává funkci prezidenta nadace Larry Kramer, rovněž bývalý děkan Stanfordovy právnické fakulty. Zavedl nové iniciativy zabývající se politickou polarizací a také kybernetickou bezpečností.
Stephen C. Neal, který působil jako člen správní rady od roku 2006, byl jmenován a vystřídal Waltera Hewletta ve funkci předsedy správní rady.
Majetek nadace a nadační jměníUpravit
Během prvních deseti let nadace udělila granty ve výši přibližně 15 dolarů.3 miliony dolarů.
Dotační fond nadace stále výrazně rostl, v roce 1981 jej Flora Hewlettová posílila na více než 300 milionů dolarů a v devadesátých letech dosáhl majetek nadace více než 800 milionů dolarů, což představuje více než třicetinásobný nárůst.
Mezi lety 1993 a 1999, pod vedením Davida P. Gardnera, vzrostla aktiva nadace na více než 2 miliardy dolarů a granty se zvýšily z 35 milionů dolarů v roce 1993 na 84 milionů dolarů v roce 1998.
V roce 2000 vzrostla aktiva nadace na 3,93 miliardy dolarů. Po převodu majetku Billa Hewletta se tato částka dále zvýšila, čímž se aktiva zvýšila na 8,52 miliardy dolarů a katapultovala nadaci na páté místo mezi soukromými nadacemi v Americe.
Podle údajů OECD poskytla Hewlettova nadace v roce 2018 na rozvoj 209 milionů dolarů, vše formou grantů.