Modrý Marlin a jeho sesterská loď patřily společnosti Offshore Heavy Transport z norského Osla od jejich postavení v dubnu 2000, resp. listopadu 1999, až do 6. července 2001, kdy je koupila společnost Dockwise. Americké námořnictvo si Blue Marlin najalo od Offshore Heavy Transport, aby přepravilo torpédoborec USS Cole zpět do Spojených států poté, co byla válečná loď poškozena sebevražednými atentátníky Al-Káidy, když kotvila v jemenském přístavu Aden. V druhé polovině roku 2003 byla na Blue Marlinu provedena práce, která zvýšila jeho kapacitu a přidala dva zatahovací pohony pro zlepšení manévrovatelnosti. Loď byla znovu uvedena do provozu v lednu 2004. Po těchto vylepšeních dopravila Blue Marlin ropnou plošinu Thunder Horse PDQ o hmotnosti 60 000 tun do Corpus Christi v Texasu, kde byla dokončena.
V červenci 2005 převezla Blue Marlin plynovou rafinerii Snøhvit z místa její výstavby v Cádizu do Hammerfestu, což byla jedenáctidenní cesta. Tato přeprava byla natočena pro televizní pořad Extreme Engineering na Discovery Channel a také pro televizní pořad Mega Movers na History Channel.
V listopadu 2005 Blue Marlin opustil Corpus Christi, aby přes jižní cíp Jižní Ameriky a Pearl Harbor na Havaji převezl masivní námořní radar X-band do Adaku na Aljašce. Do Pearl Harboru dorazil 9. ledna 2006 po ujetí 15 000 mil. V lednu 2007 byla loď Blue Marlin nasazena na přepravu dvou zvedacích plošin Rowan Gorilla VI a GlobalSantaFe Galaxy II z přístavu Halifax do Severního moře.
16. června 2012 loď dorazila do přístavu Ferrol, aby se připravila na přepravu nedokončené obojživelné válečné lodi HMAS Canberra do Melbourne. Australská loď byla vyzdvižena na Blue Marlin 4. srpna 2012 a měla vyplout 12. srpna a směřovat do australské loděnice BAE Systems ve Williamstownu. Loď minula Port Phillip Heads a 17. října 2012 dorazila do Melbourne.
V květnu 2019 byl Blue Marlin krátce unesen u pobřeží Rovníkové Guineje. Posádka se ukryla v lodní citadele, zatímco piráti ze zoufalství rozstříleli můstek a uprchli před příjezdem rovníkového guinejského a španělského námořnictva.