Ačkoli byl egyptský tisk svobodnější než za Násira nebo Sadata, zavedl Mubarak v roce 1995 zákon, podle kterého měli být uvězněni novináři nebo straničtí vůdci, kteří zveřejnili zprávy poškozující vládního představitele. Tlak obyvatelstva přiměl shromáždění k omezení tohoto zákona, který byl nakonec zrušen egyptským ústavním soudem. Rostoucí cenzura ze strany islámských soudů a rektora univerzity al-Azhar však na přelomu 20. a 21. století mírnila svobodu slova a tisku.
V boji proti islamistickému terorismu se Mubarakův režim uchyloval k preventivnímu zadržování a údajně i k mučení. Egyptští teroristé zase zavraždili několik vládních ministrů, v roce 1995 v etiopské Addis Abebě málem zabili samotného Mubaraka a stříleli do turistů v blízkosti nejznámějších egyptských památek – včetně obzvláště brutálního útoku v Luxoru v roce 1997. Jeden z předních islamistů, šejch ʿUmar ʿAbd al-Raḥmān, uprchl do Spojených států, kde se v roce 1993 zúčastnil útoku nákladním automobilem na Světové obchodní centrum v New Yorku a později byl za tento čin a za spiknutí s cílem spáchat další útoky odsouzen na doživotí. Další islamistický vůdce, káhirský pediatr Ayman al-Zawahiri, uprchl do Afghánistánu, kde vedl členy EIJ ke vstupu do nadnárodní teroristické organizace al-Káida. Navzdory vládním iniciativám zaměřeným na kontrolu tohoto problému zůstává domácí terorismus hrozbou pro stabilitu Egypta.
Některé sociální a ekonomické problémy buď vyplynuly z účasti Egypta ve válce v Perském zálivu (1990-91) na straně koalice vedené USA, nebo se ještě prohloubily. Konfliktu se účastnili egyptští vojáci i vojáci z mnoha arabských zemí. Ačkoli byl Egypt za svou účast odměněn odpuštěním miliard dolarů, které dlužil za nákup zbraní od Západu, mnoho egyptských expatriantů přišlo o práci v Iráku kvůli invazi této země do Kuvajtu. Stejně tak byly zklamány naděje Egypta, že jeho dodavatelé vyhrají nabídky na pomoc při obnově Kuvajtu po válce, a plán na umístění egyptských a syrských jednotek jako mírových sil v regionu byl státy Perského zálivu odmítnut. Snad je pochopitelné, že finančně strádající Egypťané začali mít odpor k bohatým Saúdům, Kuvajťanům a dalším Arabům z Perského zálivu, kteří často trávili své dovolené hraním v luxusních hotelech v Káhiře.
Egyptská veřejnost také začala být skeptická k pokračujícím snahám po sobě jdoucích amerických prezidentů i vlastního prezidenta o podporu míru mezi Izraelem a dalšími arabskými zeměmi a zejména Palestinci. V měnící se globální ekonomice panovalo všeobecné podezření, že tyto pokusy o podporu lepších vztahů mohou mít nějaké postranní úmysly. Mnozí Egypťané se zejména obávali možného pokusu USA a Izraele o manipulaci s egyptským průmyslem, zejména proto, že počítačové a informační technologie – jejichž získání a využívání v Egyptě do značné míry záviselo na Západu – se staly pro hospodářský růst stále důležitějšími. Od roku 2004 však patřilo rozšíření internetového připojení země k ekonomické agendě egyptského premiéra Ahmada Nazífa, který je sám počítačovým inženýrem, obzvláště vysoké místo.
Mubarakova angažovanost ve prospěch domácího rozvoje byla ostatně patrná i při výběru tří po sobě jdoucích ekonomických plánovačů do funkce premiéra v 90. letech. A přestože se Egypt stával ekonomicky stále vyspělejším, dělo se tak za vysokou cenu. Jeho nezávislost byla omezována zásahy mezinárodních věřitelů, jako je MMF, a rostoucí rozdíly v příjmech a přístupu ke zdrojům napínaly vztahy mezi bohatými a chudými občany a přispívaly k narušení jednoty mezi muslimy a kopty. Zatímco někteří muslimové obviňovali kopty, že slouží jako agenti cizích mocností a ovládají egyptskou ekonomiku, někteří koptové obviňovali muslimy z ničení kostelů a nucení egyptských křesťanů ke konverzi k islámu. Přestože se muslimští i křesťanští Egypťané většinou snažili své rozdíly veřejně minimalizovat, aby si udrželi národní jednotu, rychlý a nerovnoměrný vývoj nakonec představoval hrozbu pro politické a kulturní vedení Egypta v arabském světě.
Arthur Eduard Goldschmidt
Vnitřní napětí rostlo, když Mubarakův režim pokračoval v potlačování opozice, zatýkání disidentských vůdců a omezování politických projevů. Rozsáhlé nesrovnalosti byly zaznamenány při parlamentních volbách v listopadu 2010, v nichž drtivě zvítězila NDP, čímž byly z Lidového shromáždění fakticky vyřazeny opoziční strany.