V březnu 2004 byly čtyři poddruhy lišky ostrovní zařazeny mezi federálně chráněné druhy: liška ostrovní Santa Cruz, liška ostrovní Santa Rosa, liška ostrovní San Miguel a liška ostrovní Santa Catalina. Od roku 2013 IUCN uvádí celý druh jako téměř ohrožený, což je zlepšení oproti předchozímu statusu „kriticky ohrožený“. V 90. letech 20. století byl zjištěn pokles populace lišky ostrovní. Na ostrově San Miguel začal pokles v roce 1994 a do roku 1999 klesla populace ze 450 dospělých jedinců na 15 jedinců. Podobný pokles populace byl zjištěn i na ostrově Santa Cruz. Na ostrově Santa Cruz se populace snížila z 2 000 dospělých jedinců v roce 1994 na méně než 135 v roce 2000 a na ostrově Santa Rosa, kde lišky v roce 1994 mohly čítat více než 1 500 jedinců, ale do roku 2000 se jejich počet snížil na 14 zvířat. V roce 2004 bylo na ostrově San Miguel 38 lišek, všechny v zajetí; na ostrově Santa Rosa 46 lišek v zajetí a sedm ve volné přírodě (predace orlem skalním zabránila vypuštění lišek v zajetí do volné přírody); na ostrově Santa Cruz bylo 25 lišek v zajetí a stabilní volně žijící populace čítala asi 100 lišek.
Příčinou vysoké úmrtnosti se ukázala být predace orlem skalním, která byla zjištěna, když byly lišky označeny rádiovým obojkem a monitorovány. Podle údajů shromážděných Dr. Lyndalem Laughrinem z ostrovní rezervace Kalifornské univerzity v Santa Cruz byl orel skalní před 90. lety minulého století na Normanských ostrovech vzácným návštěvníkem a první hnízdo orla skalního bylo na ostrově Santa Cruz zaznamenáno v roce 1999. Biologové předpokládají, že orel zlatý mohl být na ostrovy přilákán v 60. letech 20. století po úbytku orla bělohlavého. Orel skalní nahradil orla bělohlavého a začal se živit divokými prasaty po devastaci místní populace orla bělohlavého v důsledku působení DDT v 50. letech 20. století – orel bělohlavý by odradil orla skalního od usídlení na ostrovech, když se živil rybami.
Divoká prasata na ostrově Santa Rosa byla vyhubena Správou národního parku na počátku 90. let 20. století, čímž byl odstraněn jeden ze zdrojů potravy orla skalního. Orel skalní pak začal lovit ostrovní populaci lišek. Divoká prasata na ostrově Santa Cruz a jeleni a losi na ostrově Santa Rosa byli vysazeni téměř 70 let před úbytkem lišek ostrovních, proto orel skalní s největší pravděpodobností tato zvířata jako alternativní kořist nevyhledával. K tomu došlo nejspíše v důsledku procesu známého jako zdánlivá konkurence: při tomto procesu se dravec, jako je orel skalní, živí nejméně dvěma kořistmi, například liškou ostrovní a divokými prasaty. Jedna kořist je přizpůsobena vysokému predačnímu tlaku a podporuje populaci dravce (tj. prasata), zatímco druhá kořist (tj. liška ostrovid) je na predaci přizpůsobena špatně a v důsledku predačního tlaku klesá. Bylo také navrženo, že úplné odstranění orlů skalních může být jediným opatřením, které by mohlo zachránit tři poddruhy lišky ostrovní před vyhynutím. Ochránci přírody však prasata na ostrově Santa Cruz vybíjeli s tím, že přitahují orly k liškám.
Zavlečené choroby nebo parazité mohou devastovat populace lišek ostrovních. Protože jsou ostrovní lišky izolované, nemají imunitu vůči parazitům a nemocem zavlečeným z pevniny a jsou obzvláště zranitelné vůči těm, které může přenášet pes domácí. Epidemie psinky v roce 1998 zahubila přibližně 90 % lišek na ostrově Santa Catalina a snížila jejich populaci z 1 300 na 103 v roce 2000. Byl zahájen vakcinační program na ochranu lišek na ostrově Catalina před psinkou. Po několika letech pečlivého odchytu lišek do pastí a jejich očkování proti psince a vzteklině dosáhla jejich populace v roce 2015 počtu 1 717 kusů, čímž překonala populaci před onemocněním, která činila přibližně 1 300 kusů. Vědci se domnívají, že virus psinky byl zavlečen domácím psem nebo mývalem z pevniny, který se svezl na lodi nebo člunu. Aby se eliminovalo riziko nákazy, není v národním parku Channel Islands povoleno chovat domácí zvířata.
Na populaci lišek má negativní vliv také snížená potravní nabídka a celková degradace biotopu v důsledku zavlečených druhů savců, včetně divokých koček, prasat, ovcí, koz a amerických bizonů, z nichž poslední byl na ostrov Catalina zavlečen ve 20. letech 20. století hollywoodským filmovým štábem při natáčení westernu.
Lišky ohrožují populaci silně ohroženého piskoře ostrovního žijícího na ostrově San Clemente. Ostrovní populace lišek byla negativně ovlivněna odchytem a odstraňováním nebo eutanazií lišek námořnictvem Spojených států. Od roku 2000 námořnictvo používá různé strategie řízení: odchyt a zadržování lišek v období rozmnožování křepelky, instalace systému elektrických ohradníků kolem stanovišť křepelky a používání šokových obojků. S postupným obnovováním populace křepelky na ostrově San Clemente již námořnictvo lišky nekontroluje.
Populace lišek na ostrovech Santa Cruz, San Miguel a Santa Rosa se dramaticky zvedly z nejnižších hodnot v roce 2000, kdy jich bylo 70 na ostrově Santa Cruz a po 15 na ostrovech San Miguel a Santa Rosa. Organizace Catalina Island Conservancy provozuje na ostrově Catalina program chovu lišek v zajetí. Dne 14. září 2012 zveřejnil Úřad pro ochranu ryb a volně žijících živočichů USA návrh plánu obnovy pro lišku z ostrova San Miguel, lišku z ostrova Santa Rosa, lišku z ostrova Santa Cruz a lišku z ostrova Santa Catalina. V roce 2012 organizace Catalina Island Conservancy zjistila, že na ostrově Santa Catalina žije 1 500 lišek a populace je stabilní. V roce 2015 žilo podle skupiny Friends of the Island Fox na ostrově San Miguel 520 původních lišek a na ostrově Santa Rosa 874 lišek. Počet lišek na ostrově Santa Cruz se zvýšil na 1750. Americký úřad pro ochranu ryb a volně žijících živočichů doporučil vyřazení lišek z ostrovů Santa Cruz, San Miguel a Santa Rosa ze seznamu v rámci velkého úspěchu zákona o ohrožených druzích. Doporučuje však překlasifikovat ostrov Santa Catalina z ohroženého na ohrožený, a to kvůli hrozbě nemocí na tomto hojně navštěvovaném ostrově.
Dva další poddruhy na ostrovech San Nicolas a San Clemente nejsou ohrožené. Na San Nicolas žije 263 lišek a na San Clemente 1230 lišek.
Protože jsou Normanské ostrovy téměř celé ve vlastnictví a pod kontrolou buď organizace Catalina Island Conservancy, The Nature Conservancy, nebo federální vlády, má liška šanci získat potřebnou ochranu, včetně stálého dohledu zainteresovaných úředníků, bez stálé hrozby zásahů člověka do jejího životního prostředí.
Liška se na ostrově Anacapa neudržela, protože nemá spolehlivý zdroj sladké vody; ostrov Santa Barbara je příliš malý na to, aby uživil potravní potřeby životaschopné liščí populace.
Rene Vellanoweth, archeolog, se domnívá, že inbreedingovou depresi lze zvládnout smícháním populací různých poddruhů lišek na ostrově podobně, jako to dělali domorodí obyvatelé, jejich přesunem z ostrova na ostrov, čímž se vytvoří větší genetická rozmanitost a napomůže se jejich obnově.
Podle jeho názoru se liška na ostrově Anacapa neudržela.