Chromofor, skupina atomů a elektronů tvořící součást organické molekuly, která způsobuje její zbarvení.
Souvislosti mezi strukturními vlastnostmi chemických sloučenin a jejich barvami se hledají přibližně od roku 1870, kdy bylo zjištěno, že chinony a aromatické azosloučeniny a nitrosloučeniny jsou často silně zbarvené a že při hydrogenaci těchto sloučenin se barvy zeslabují nebo ničí. Schopnost sloučeniny přijímat vodík, nazývaná nenasycenost, je způsobena přítomností elektronů, které nejsou pevně vázány v kovalentních vazbách mezi jednotlivými dvojicemi atomů, ale zaujímají větší oblasti prostoru (molekulové orbitaly), které mohou být spojeny s několika atomy. Tyto elektrony mohou absorbovat energii světla v určitém rozsahu vlnových délek ve viditelné oblasti; přenos nebo odraz zbytku světla vede k pozorované barvě sloučeniny. Syté zbarvení vzniká, je-li v jedné molekule těsně spojeno několik chromoforů nebo je-li přítomna další skupina, nazývaná auxochrom.
.