Nos anos 1700, os índios Ponca separaram-se da tribo Omaha e estabeleceram aldeias ao longo do rio Niobrara e do riacho Ponca no actual Nebraska e Dakota do Sul. Lá eles subsistiam da horticultura e da caça de bisontes. Até a chegada dos Teton Sioux por volta de 1750, o território dos Poncas estendeu-se desde o rio Missouri até às Colinas Negras. A varíola e outras doenças nos séculos XVIII e XIX reduziram o seu número. A guerra dos Sioux forçou a sua retirada para uma área perto da foz do rio Niobrara.
Os Poncas nunca guerrearam com os Estados Unidos, com quem assinaram o seu primeiro tratado de paz em 1817. Um acordo comercial seguiu-se em 1825. Em 1858 e 1865, os Ponca também assinaram tratados de cessão de terras em troca de proteção militar e assistência econômica. Durante as décadas de 1860 e 1870, secas, caçadas de bisão fracassadas e uma incessante ameaça Sioux levaram os Ponca à beira da fome. Em vez de honrar suas obrigações de tratado, os Estados Unidos cederam as terras dos Ponca aos Sioux em 1868. Em vez de renegociar o tratado Sioux, o governo federal removeu os Ponca para Território Indiano em 1877.
A remoção dos Ponca foi grosseiramente maltratada. Os Estados Unidos não só falharam em obter o consentimento dos chefes Ponca, mas também negligenciaram em fornecer uma reserva com instalações adequadas. De acordo com algumas estimativas, quase 158, quase um terço da tribo, pereceu durante os primeiros anos em Oklahoma. Após a morte de seu filho em 1878, o sub-chefe Ponca Standing Bear retornou ao Nebraska com um grupo de seguidores. Sua prisão e julgamento levaram a uma decisão histórica na jurisprudência federal indiana. O tribunal decidiu em Standing Bear v. Crook (1879) que os índios eram reconhecidos como pessoas sob a Décima Quarta Emenda e, portanto, podiam processar por seus direitos. A decisão dividiu a tribo em bandas do norte e do sul, pois os seguidores de Standing Bear foram autorizados a permanecer no Nebraska.
A Ponca do sul, sob o comando do chefe principal White Eagle, estabeleceu uma reserva de 101.000 acres perto da confluência dos rios Salt Fork e Arkansas no Outlet Cherokee (atual condados Kay e Noble em Oklahoma). Eles estabeleceram acampamentos de inverno ao longo do rio Arkansas, e continuaram a praticar seus costumes tribais. Eles arrendaram a maior parte de suas terras a fazendeiros e fazendeiros euro-americanos, incluindo os irmãos Miller do 101 Rancho.
A cultura Bonca ficou sob pressão nos anos 1880 e 1890. Agentes e missionários procuraram abolir as danças tradicionais, as práticas matrimoniais e os costumes religiosos. Apesar da oposição tribal, o governo também impôs sua política de loteamento a eles em 1892, resultando na eventual alienação de grande parte de suas terras. Os Ponca novamente sofreram pressão após a descoberta de petróleo sobre e perto da sua reserva pelo petroleiro Ernest Whitworth Marland em 1911. O desenvolvimento dos campos de petróleo de Ponca e Tonkawa causou problemas ambientais, forçando os Ponca a abandonar seus campos de inverno ao longo do rio Arkansas e a passar para loteamentos individuais.
Apesar destas pressões os Ponca continuaram a moldar sua cultura. Muitos se juntaram aos 101 Ranch Wild West Show dos Irmãos Miller, o que lhes permitiu reencenar aspectos do seu estilo de vida tradicional. A introdução da religião peiote permitiu-lhes estabelecer a sua própria versão do cristianismo. Dois jovens educados Poncas, Frank Eagle e Louis McDonald, foram cofundadores da Igreja Nativa Americana em 1918.
Em 1919 os veteranos da Primeira Guerra Mundial de Ponca formaram um capítulo da Legião Americana chamado Buffalo Post 38. Esta organização reavivou práticas tradicionais relacionadas à guerra, como a dança de guerra de Ponca (heluska). A dança continuou a ser a expressão central da cultura tradicional ponca. Ao longo de Oklahoma os Ponca eram conhecidos por seu conhecimento de canções e danças. Eles deram importantes contribuições para o desenvolvimento da cultura powwow nas planícies do sul. Em 1926 Gus McDonald foi coroado o primeiro dançarino de fantasia campeão mundial, ganhando a Ponca a honra de organizar os campeonatos mundiais a cada ano. Anualmente os Ponca powwow, um dos mais antigos powwow em Oklahoma, é realizado a cada agosto.
Em 1950 os Ponca organizaram um governo tribal de acordo com a Lei de Bem-Estar dos Índios de Oklahoma de 1936. A sede tribal está localizada em White Eagle, a cinco milhas ao sul da cidade de Ponca. Em 1961 Clyde Warrior, um ativista dos Ponca, cofundou o Conselho Nacional da Juventude Indígena. O apelo do guerreiro à autodeterminação tribal abriu o caminho para uma nova geração de ativistas indígenas nos anos 60 e início dos anos 70.
Turmoil caracterizou a política tribal dos Ponca durante os anos 70 e 80. As acusações de fraude e má gestão levaram a uma alta taxa de rotatividade de funcionários no comitê de negócios tribais, o órgão de governo da tribo. Quando o governo federal reduziu o financiamento tribal na década de 1980, o comitê iniciou uma operação de bingo para aumentar as receitas. Atualmente, o jogo indígena é um dos assuntos mais polêmicos entre o Estado de Oklahoma e a comunidade Ponca.
As relações entre os Ponca de Oklahoma e os Ponca de Nebraska melhoraram depois que o governo dos EUA restabeleceu o reconhecimento a estes últimos em 1990. Desde então ambos têm cooperado em numerosas questões, incluindo a repatriação de restos humanos e artefatos sob a Lei de Proteção e Repatriação de Sepulturas dos Nativos Americanos (NAGPRA). Um dos maiores desafios enfrentados pela comunidade Ponca de Oklahoma é a retenção de sua língua e tradições culturais. Em 2003, a Tribo Ponca de Oklahoma tinha 2.549 membros matriculados.