有孔虫 – The World Foraminifera Database

高次分類

現在認められている種と地域のリストは、次のとおりです。グループ名は、最近の種については少なくとも90％以上完成している。 しかし、多くの分類群ではまだ分類法の改訂が必要であり、新しく記述された種は出版後できるだけ早く追加される予定であり、この作業は編集者によって継続的に行われる。 化石属や高等分類群についてはほぼ完成しているが、化石種の追加には何年もかかるだろう。 有孔虫の高次分類については、現在のところ、幅広いコンセンサスが得られていない。 ここでは、石灰質分類についてはLoeblich and Tappan (1987 and 1992)で示された分類が主に用いられ、膠質分類についてはKaminski (2004)に従っているが、有孔虫の上位分類は改訂中で、Pawlowski et al. (2013) and Holzmann and Pawlowski (2017) のこれまでの遺伝子配列ベースの結果に従って更新してきたところである。 現在進行中の分子系統学的調査のさらなる結果によって，今後，分類体系が安定することが期待される

• Holzmann, M. and Pawlowski, J. (2017)． リボソームDNA系統に基づくロータリッド有孔虫の最新の分類。 Marine Micropaleontology 132, 18-34.
• Kaminski, M. A. (2004). 膠質有孔虫の2000年分類． In: M. K. Bubik, Ma. (編)． 第6回膠質有孔虫国際ワークショップ報告書. グリボフスキー財団特別刊行物. Pp. 237-255.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1987). “有孔虫の属名とその分類”. Van Nostrand Reinhold, New York.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1992). 有孔虫分類の現状． 底生有孔虫の研究”． 第4回底生有孔虫シンポジウム講演集, 仙台, 1990.”. (高柳陽一・斉藤忠夫編），pp.93-102. 東海大学出版会，東京.
• Pawlowski, J., Holzmann, M., Tyszka, J. (2013). 有孔虫の新しい上位分類：分子と形態との出会い. Marine Micropaleontology 100, 1-10

Steering Committee

運営委員会は国際的な監督を行い、World Foraminifera Databaseの編集と合理化を促進する。

運営委員会メンバーは次の通り：

• Tomas Cedhagen, Denmark
• Peter Frenzel, Germany
• Bruce W. Hayward, New Zealand (convenor)
• Martin Langer, Germany
• François Le Coze, France
• Briony Mamo, Hong Kong, China
• Willem Renema, オランダ
• Daniel Vachard（フランス）

Editors

担当するグループのデータを入力し、分類を決定する。

• Hayward, Bruce: Foraminifera

• Encarnação, Sarita Camacho da: 有孔虫
• Le Coze, François: 有孔虫
• Mamo, Briony: Foraminifera
• Vachard, Daniel: Foraminifera

Editor is responsible for entries, decision on validity of name. 1593>

データベースへの種の登録は編集者の決定であるが、その決定は新しい情報に照らして頻繁に再検討される必要があることを認識している。 もし、上級者の同義語の決定や属の割り当てに同意できない場合は、よく議論された上で修正された割り当てを私たちに知らせてください。 データの追加や修正は編集者のみが行えますが、同定や位置情報を含む画像のアップロードは誰でも可能です（ただし、編集者がチェックし、修正することができます）

History of the World Foraminifera Database

世界有孔虫データベースは、Tomas Cedhagen と Onno Gross によってまとめられたヨーロッパの最新種リストとしてスタートしました。 2010年にこれにBarun Sen Guptaらがまとめたメキシコ湾の最新種リストとBruce Haywardらがまとめたニュージーランドの現代種リストが追加された。

• Gross, O. (2001). 有孔虫（Foraminifera），in: Costello, M.J. et al. (Ed.) (2001). European register of marine species: a check-list of the marine species in Europe and a bibliography of guides to their identification.ヨーロッパ海洋種登録：ヨーロッパの海洋種のチェックリストとその同定ガイドの書誌情報. Collection Patrimoines Naturels, 50: 60-75.
• Hayward, B.W., Tendal, O.S., Carter, R., Grenfell, H.R., Morgans, H.E.G., Scott, G.H., Strong, C.P., Hayward, J.J. (2012). 有孔虫門. 有孔虫とゼノフォア（Xenophyophores）. In: Gordon, D.P. (ed.). New Zealand Inventory of biodiversity: 種 2000 シンポジウムレビュー. カンタベリー大学出版、。 クライストチャーチ。 Pp. 242-287
• Sen Gupta, B.K., Smith, L.E., Machain-Castillo, M.L. (2009). メキシコ湾の有孔虫，Pp. 87-129 in Felder, D.L. and D.K. Camp (eds.), Gulf of Mexico-Origins, Waters, and Biota. 生物多様性。 Texas A&M Press, College Station, Texas.

その後、Johannes Pignattiのcatalogue of recent foraminifera、Recent foraminiferaの多くの主要アトラス、Ellis and Messina Catalogue of Foraminiferaから記録が追加されています。 1980年以降に記載された分類群の中には、まだ発見・追加されていないものが多数あることを承知している

Who described the largest number of recent Foraminiferal species?

• McCulloch – 2429
• Cushman – 1134
• D’Orbigny – 691
• Brady – 398
• Saidova – 394
• Earland・・・・・・。 306

Literature Library

文献ライブラリーは、現在約9000件の文献を所蔵しています。 古い作品の多くは、スキャンしたPDFで見ることができます。

Photogallery

Photogalleryには現在、種の記録にリンクされた約6000の画像があり、そのほとんどはTomas CedhagenがBradyのChallenger volumeとCushman monographsから入力しましたが、他のモノグラフもあります。

Tasks to do

運営委員会はWoRMSデータベースの有用性と価値を高めるために実施できる作業を以下の通り確認しました。 これらのタスクは3つの優先順位リストのうちの1つに割り当てられています。 我々は、以下のタスクのいずれかにボランティアで貢献することにより、このデータベースをより有用なものにしたいと考える作業者は、運営委員会の議長であるBruce Haywardに電子メールで連絡することを推奨します。 第一優先課題

• 有孔虫の分類名として正式に提案されたものをすべて100%登録する。 .
• 提案された新しい分類名をすべて追加する。
• 分子的な証拠に基づいて改訂された上位分類を更新します。
• 新しい分子的および包括的な形態学的研究が発表されたため、分類とシノニムを更新しました。
• 受け入れられた現存するすべての分類群のタイプまたは確認済み標本の画像を100%カバーする

2. 第二優先順位

• 2010年以前のすべてのエントリーをチェックして、もはや誤りを含んでいないことを確認する。
• 機関（長寿命）ウェブサイト上で利用できる評判の良い画像/分類学的記述へのリンクを交渉する。
• 受け入れられたすべての化石分類群のタイプまたは検証済み標本の画像について、100%のカバー率を達成する。
• すべての化石分類群を、以下の時代のうち少なくとも1つ以上に割り当てる。 古生代、三畳紀、ジュラ紀、白亜紀、古第三紀、新第三紀
• 新しい有孔虫の分類を記述したすべての出版物のコピーをウェブ上で提供するか、WoRMSに読み込ませること。
• Forams in WoRMS literature sourcesデータベース（現在11,000件）を出発点として、世界の有孔虫の出版物の包括的な書誌を開発する。 3.第三優先順位
  • すべての化石分類群に既知の時間範囲（期間より正確）を付与する。
  • すべての現存種の世界的な地理的分布データを得る。
  • すべての化石種の世界的な地理的分布を網羅する。

  他の有孔虫サイトへのリンク

  初心者や専門家ではない人のために、ここではさらに情報を得られる有孔虫サイトへのリンクを選んで提供しています。

  • 有孔虫研究で使われる用語集 http://paleopolis.rediris.es/cg/CG2006_M02/index.html
  • 教室での有孔虫研究のための試料作成テクニック http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Snyder&Huber.html
  • フォーラム・ファクト http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Wetmore.html
  • Wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Foraminifera
  • Foraminiferal reference群 http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/foramrefs.htm
  • Cushman Foundation for Foraminiferal Research http://www.cushmanfoundation.org/
  • Grzybowski Foundation http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/
  • The Micropalaeontological Society http://www.tmsoc.org/
  • カリフォルニア大学古生物学博物館 – 有孔虫入門 http://www.ucmp.berkeley.edu/foram/foramintro.html
  • University College, London – Foraminifera http://www.ucl.ac.uk/GeolSci/micropal/foram.html
  • Chronos foram on-line atlases http://portal.chronos.org/gridsphere/gridsphere?cid=resources
  • The Foraminifera.eu Project http://www.foraminifera.eu/
  • E-formas http://www.eforams.org
  • Molecular Database of Foraminifera http://forambarcoding.unige.ch/
  • Biography of Joseph Cushman http://paleobiology.si.edu/cushman

  引用

  科学出版物で World Foraminifera Database からのデータの使用は、以下のように引用して認めるべきである：

  • Hayward, B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B.W.; Le Coze, F.; Vachard, D.; Gross, O. (2021). World Foraminifera Database（世界有孔虫データベース）． Accessed at http://www.marinespecies.org/foraminifera on 2021-03-25. doi:10.14284/305

  World Foraminifera Databaseのデータが解析に使用するレコードのかなりの割合を占める場合、データベースのチーフエディターに連絡する必要があります。 そのような分析に有用な追加データがあるかもしれない。
  各ページは個別に執筆され、日付が記載されている。

  About

  The World Listは、種名および上位分類名の検索可能なカタログである。

  このカタログのナビゲーションは、メニューの中の選択肢の一つをクリックすることから始まります。

  • Introduction は、このイントロダクションセクションにつながります
  • Search taxa は、すべての分類群ページにアクセスできるクエリーページにつながります
  • Browse taxa は、分類群ツリーにつながります
  • Checklist は、ユニットの名前が正確であれば直接地理を選択できるクエリーページにつながります
  • Checklist は、このページになります。
  • Attributes は、主に化石の範囲を問い合わせるページです。
  • Stats は、World Foraminifera Database に関する統計です。
  • Sources は、有孔虫に関する文献を問い合わせるページです。
    1. 属名
    2. 亜属名（該当する場合）
       亜属名はICZNに従って常に引用される必要はない；亜属名なしの組み合わせはデータベース上で「代替表現」とみなされる。
    3. the species name
    4. the infraspecific name, if applicable
    5. the author and year of the species name, 元の組み合わせかどうかによって括弧なしまたは括弧付き
    6. AphiaID（ユニークな数値のデータベース識別子）
    7. 上位分類（Loeblich and Tappan, 1990, 1992による）
    8. 「受容」または「不受理」としての状態（該当する場合）。 junior synonymy is usually based on published revision)
    9. Record status (indicates who checked the record)
    10. Rank of taxon, e….8959>
    11. Parent: 現在の分類群が属する直上の分類群、例えば属
    12. Synonymized taxa: 現在の名前にリンクしている同義語のリスト
    13. Sources: 原著の文献参照、および（「記録の根拠」として）最近の改訂版への該当があれば、その文献参照。
    14. Child taxa: 全ての下位分類群、例えば亜種
    15. Environment: marine or brackish
    16. Fossil range: recent only or also known as fossil (soon epoch ranges will be available)
    17. Distribution: 分布。 少なくともホロタイプの由来に基づく、分類群の最近の地理的分布の表示
        異なる地理的位置を示すこともあり、好ましくはMarine Ecoregion (Spalding et al. 2007参照)、しばしば国の排他的経済水域も表示する。 ジュニアシノニムの分布域は、各「accepted species」で自動的に表示される
    18. Specimen: タイプ標本情報、または公開標本情報
    19. Links: 他の有孔虫リソース、特定のサーバーの画像や他の情報へのリンクです。 現在の一般的なリンクは Genbank, etc.
    20. Notes: 説明、コメント、解説など、さらに関連する情報
    21. Images: サイトにアップロードされた写真やその他の画像
        タイプ標本の写真やイラストなど、分類群の「客観」画像を希望します。 未同定の有孔虫の写真は奨励しませんが、確実に同定された著作権フリーの画像は歓迎します。
    22. LSID 表記。 (出版物におけるISBNと同様)
    23. 編集履歴: 記入日と変更点、編集者名
    24. 分類図、Google、Google Scholar、Google imagesへのリンク

    高次分類群に関する記録は一般に種記録と同じ構造になっている。 1593>

    現時点でこのデータベースでできることは、対象の有孔虫の現在認められている組み合わせは何か、現在認められている上位分類群所属は何か、元々はどこから記載されたかを調べることです。 また、どの種が上位分類群に含まれるかを確認することもできます。 ただし、今のところ、原種と現在認められている組み合わせを優先しているため、公表されているすべての属名と種名の組み合わせを見つけることはできません（そのため、原種以外の非認可の組み合わせがまだ不足していることがよくあります）。 また、世界中から入力されたデータにまだ一貫性がないため、種や高等分類群の分布の追跡や地域別種のリストの抽出を包括的に行うことはできません

    。