FFPE組織の保管
FFPEサンプルは病院、バイオバンク、研究センターで保管されます。 保存施設では、組織の収集方法、保存手順、および提供者の人口統計学的情報（由来、期間、年齢、民族性、性別、病期など）が記録されていることが多い。 人口統計学的情報は、研究および臨床試験において重要な要素である。 適切に保存されたFFPEサンプルは非常に貴重で、室温で長期間保存することができます。
アプリケーション
FFPEサンプルは、以下の用途によく使用されるので重要です。 この方法は、アルツハイマー病や癌などの病理学的な組織を探す医師や研究者にとって重要である。
b) 腫瘍学
FFPEサンプルは腫瘍学の分野では不可欠であり、腫瘍組織は特徴ある形態を持ち、研究者は特定のタンパク質を探すことができる。 これらのタンパク質は、治療や診断の評価に使用されます。
c) 血液学
血液とその障害の研究では、FFPEサンプルは異常の特定や治療法の発見に重要です。
d) 免疫学
自己免疫疾患を持つドナーからのFFPEサンプルは、原因の究明や治療法の開発に役立っています。
合併症または制限
ホルマリンを用いた固定プロセスの制限の1つは、組織に存在するタンパク質が変性し、抗体で検出できなくなる可能性があることである。 この問題を補うために、抗原賦活法が開発された。 抗原賦活法は、FFPE試料からDNA、RNA、タンパク質を特異的に回収する技術である。 この方法を用いるには、FFPEサンプルの品質が重要である。 また、固定やDNA分離などの分析前処理に標準的な手順が存在しないという問題もある。 つまり、器具の使い方、サンプルの取り扱い、方法論の違いなどの些細な違いが、DNAの品質や試験結果に影響を与えるばらつきとなる可能性があるのだ。 FFPEサンプルから得られる試験結果に影響を与えることが判明している要因には、以下のようなものがあります。
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固定プロトコルの不正確な記録
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固定時間のばらつき
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固定中の温度
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のばらつき
- 固定時間のばらつき4646 固定方法
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FFPEサンプルの保管条件
品質管理
FFPEサンプルの最高品質を確保することです。 サンプルを収集し保管する人は、以下のことを行う必要があります。
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倫理的・法的基準に従ってください。
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ドナーに関する明確かつ正確な記録を保持する。
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サンプリングと収集プロセスに関する情報を提供すること
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サンプル収集中は認可を受けた病理学者の監督を受けること
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保管のチェーンを完全に持つこと
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以下の会社とのみ仕事をすること。
Fresh Frozen Tissue
新鮮凍結組織は、液体窒素を用いて「瞬間凍結」と呼ばれる方法で保存された標本であります。 これらの標本は、その後、-80℃以下に設定された冷凍庫で保存されます。 新鮮凍結組織は、ネイティブな形態学的研究や分子生物学的解析に使用できるため、FFPEサンプルとは異なる用途があります。
FFPE Samples Vs. Fresh Frozen Tissue
FFPE と新鮮凍結組織は、それぞれ長所と短所があります。 このような場合、「FPE」と「新鮮凍結組織」は、研究または臨床試験の要件に応じて、異なる用途を持つ2つの異なるタイプのサンプルです。
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FFPE ブロックは非常に硬く、特別な装置を使用せずに室温で何十年も簡単に保管できるため、このタイプの組織サンプルは非常にコスト効率が高くなっています。
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FFPE標本は何十年も使用されており、病理学者にとって非常に身近な存在になっています。
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新鮮凍結組織は、ネイティブタンパク質の分析、ポリメラーゼ連鎖反応、次世代DNAシーケンスに非常に適しています。 つまり、機械的な故障、停電、不注意がサンプルの品質に影響を与える可能性があります。
1) Ward T. The importance of proper formalin fixation of FFPE samples(ウォード・T.)。 Personalis. 2018/6/19にアクセスしました。 https://www.personalis.com/importance-proper-formalin-fixation-ffpe-specimens/
2) Doiron L. がん組織バンクのための5つの品質管理ルール. フォリオ・コンバーサント． 2018/6/19にアクセスした。 http://www.conversantbio.com/blog/bid/339034/5-Quality-Control-Rules-for-Cancer-Tissue-Banks
3) FFPEと凍結組織サンプルの比較. BioChain. 2018/6/19にアクセス。 https://www.biochain.com/general/ffpe-vs-frozen-tissue-samples/
4) FFPE組織とは何か、その用途は何か。 BioChain. 2018/6/19にアクセスしました。 https://www.biochain.com/general/what-is-ffpe-tissue/