1959年、ニューヨーク州ジョージ湖畔のシルバーベイのボートビルダー、モーガン・マリンのウィリアム・モーガンが、会社の歴史的遺産を再生する目的でハッカークラフトの名前を取得しました。 ハッカーにはない新しい技術を用いることで、いくつかの微妙な、しかし重要な点でボートの改良が行われました。 ハッカーが110馬力（82kW）のエンジンを使用していたのに対し、モーガン・マリン社は時速50マイルを超える350馬力（260kW）または454馬力（339kW）のクルセイダー・エンジンでこれらの船体を動かすことができたのだ。 これらの改良型エンジンに対応するため、モーガン・マリーンはオリジナルの設計で使用されていたものよりも支柱を丈夫にする必要があった。 しかし、モーガンの最大の功績は、ハッカークラフトのハンドリングを改善したことである。 旧型のハッカークラフトを最高速度で走らせると、船首が上がってドライバーの視界を遮ってしまうことがあった。 この頃、オリジナルの治具の多くが失われていたため、必要な部分には新たに砂型鋳造を施し、ハードウェアを製作した。 モーガンは、伝統的な職人技のほとんどを残しながら、技術の進歩に譲歩して、古い計画に対していくつかの重要な改良を施した。 エンジン性能を向上させるため、オリジナルのシングルエグゾーストからデュアルエグゾーストに変更、ステンレス製のフィッティングやハードウェアを使用することで、腐食の問題を解消、最先端のエポキシ封入・接着技術、エポキシで完全に包まれたトリプルプランクのボトム、そして、エポキシで完全に包まれたトリプルプランクのボトム。 エポキシ樹脂で包まれた2枚板のサイドとデッキ、25％増のフレーム、2倍のフロア材、最大18回塗りのニス、再生可能資源であるホンジュラスマホガニーの使用、操縦性を高める新しい改良型ステアリング、青または緑の色調を持つラミネート・ウィンドシールドなどです。
2004年、Robert WagemannがWilliam Morganから会社を買収。 2008年、ジョージ・バドコックのエリン・インベストメンツがロバート・ワゲマンから同社の株式の過半数を取得した。 その後、生産能力増強のため、シルバーベイからタイコンデロガに32,000平方フィートの生産施設を開設。 2011年、エリン・インベストメンツが同社の完全所有権を獲得しました。
新しい生産施設に加え、ジョージ湖畔の本社キャンパスは、フルサービスのマリーナの敷地でもあり、4艇を展示できる新しいショールームを備えてアップグレードされました。 本社オフィスや倉庫、サービスビルもすべて補修・改修された。 2011年、Hacker-CraftはMarks & Spencer (UK), Tommy Hilfiger and NauticaのTVやカタログ撮影に登場しました。
カスタムデザインのNeiman Marcus Edition Hacker-Craftは、伝説のNeiman Marcus Christmas Bookカタログで「ファンタジーギフト」として採用されました。
2012年、Tommy Bahamaとのパートナーシップにより、カスタムデザインモデル「Tommy Bahama Edition Hacker-Craft（TBE）」を発表。
2015年にはリムジンヨットテンダーを発表し、ネバダ州タホ湖のSierra Boat Companyとインディアナ州シラクースのWawasee Boat Companyを正規代理店に任命。
2017年にはタイに本拠を置くClassic Boats Lifestyle, Ltd.を指名。 (CBL)を正規仕入れ販売店に指定した。
2019年、NetflixのOzarkのシーズン2のエピソードにHacker Craftのボートが登場した。