San Buenaventuran lähetysasema perustettiin 31. maaliskuuta 1782, ja se on yhdeksäs lähetysasemaketjussa. Se perustettiin viimeisenä isä Serran elinaikana, ja se on yksi kuudesta hänen henkilökohtaisesti omistamastaan. Lähetysasema rakennettiin osana Santa Barbaran kanaaliosastoa, johon kuuluivat Santa Barbaran ja La Purísiman lähetysasemat sekä El Presidio Santa Barbarassa.
Isät, joilla oli jo kolme lähetysasemaa Kalifornian pohjoisosassa ja kolme Kalifornian eteläosassa, pelkäsivät intiaanikapinaa osavaltion keskiosassa. He ajattelivat, että intiaanikapina voisi olla tuhoisa alueen maaston vuoksi. Santa Barbaran kanaalivyöhykkeen vuoret laskevat sirosti alaspäin kohti merta, jolloin läpikulkutilaa ei juuri jää. Lähetyssaarnaajat pelkäsivät, että vihaiset intiaanit voisivat helposti jakaa osavaltion ja rajoittaa espanjalaisten yhteydenpidon meritse. Kapinaa ei koskaan tapahtunut, ja San Buenaventuran lähetysasema jatkoi toimintaansa suurena maataloustuottajana.
Alueen intiaanit olivat chumasheja, jotka kattoivat alueen Venturasta pohjoiseen San Luis Obispoon asti. Chumashit olivat kaikista lähetyssaarnaajien heimoista edistyneimpiä. Chumashit käyttivät kanootteja, kuten tätä lankkukanootin kopiota, ja matkustivat usein Santa Barbaran kanaalisaarille, jotka sijaitsivat jopa 65 mailin päässä mantereesta. Chumashit olivat erinomaisia korien valmistuksessa, jota espanjalaiset käyttivät usein mittarina arvioidessaan intiaaniheimon älykkyyttä. Intiaanit käyttivät koreja ruoanlaittoon, kalojen pyydystämiseen ja veden kuljettamiseen.
Padre Cambonin johdolla alkuasukkaat rakensivat seitsemän mailin mittaisen akveduktin, joka toi vettä Ventura-joesta tähän vedensuodatusrakennukseen. Se sai sopivasti nimen el caballo, joka tarkoittaa espanjaksi ”hevosta”, koska suuaukon sanottiin muistuttavan hevosen päätä. El caballo herätti myöhemmin kauhua ja halveksuntaa, kun se muutettiin vankilaksi.
San Buenaventuran lähetysasemalle ominaisia ovat nämä puiset kellot. Niitä käytettiin pyhäinviikolla palmusunnuntain ja pääsiäisen välisenä aikana, kun metallikellot olivat hiljaa. Vaikka ne ovat varmasti alkuperäisiä, niiden alkuperä on arvoitus.
Kirkko on restauroitu kauniisti vuonna 1812 tapahtuneiden maanjäristysten ja niitä seuranneen hyökyaallon jälkeen; kirkossa on 400 vuotta vanha Filippiineiltä peräisin oleva krusifiksi. Keskellä tabernaakkelin yläpuolella on Pyhä Bonaventura, lähetysaseman suojelija. Kirkossa on myös Nuestra Señora de Guadalupen pyhäkkö.