Aproteomi on organismin ilmaisemien proteiinien kokonaisuus. Termiä voidaan myös käyttää kuvaamaan tietyllä hetkellä tietyssä solu- tai kudostyypissä tuotettujen proteiinien valikoimaa. Proteomi on organismin genomin ilmentymä. Toisin kuin genomi, jolle on ominaista sen pysyvyys, proteomi kuitenkin muuttuu aktiivisesti eri tekijöiden, kuten organismin kehitysvaiheen sekä sisäisten ja ulkoisten olosuhteiden, vaikutuksesta.
Proteomin tutkimista kutsutaan proteomikaksi, ja se käsittää proteiinien toiminnan ja keskinäisen vuorovaikutuksen ymmärtämisen. Esimerkiksi monet proteiinit taittuvat monimutkaisiksi kolmiulotteisiksi rakenteiksi, ja jotkin muodostavat toistensa kanssa komplekseja suorittaakseen tehtävänsä. Lisäksi proteiineihin tehdään muutoksia, jotka voivat tapahtua joko ennen translaatiota tai sen jälkeen. Proteomia voidaan tutkia useilla eri tekniikoilla. Esimerkiksi kaksiulotteisen geelielektroforeesin avulla proteiinit voidaan erottaa toisistaan niiden koon ja varauksen perusteella. Proteomia voidaan tutkia myös toisella laboratoriotekniikalla, jota kutsutaan massaspektrometriksi ja jolla tunnistetaan tiettyjä proteiineja monimutkaisista näytteistä.