1700-luvulla ponca-intiaanit erosivat omaha-heimosta ja perustivat kyliä Niobrara-joen ja Ponca Creek -joen varrelle nykyiseen Nebraskaan ja Etelä-Dakotaan. Siellä he elättivät itsensä puutarhaviljelyllä ja biisoninmetsästyksellä. Poncojen alue ulottui Missouri-joelta Black Hillsiin, kunnes teton-siouxit saapuivat noin vuonna 1750. Isorokko ja muut taudit 1700- ja 1800-luvuilla vähensivät heidän lukumääräänsä. Siouxien sodankäynti pakotti heidät vetäytymään alueelle lähelle Niobrara-joen suuta.
Poncat eivät koskaan sotineet Yhdysvaltojen kanssa, jonka kanssa he allekirjoittivat ensimmäisen rauhansopimuksensa vuonna 1817. Sitä seurasi kauppasopimus vuonna 1825. Vuosina 1858 ja 1865 poncat allekirjoittivat myös maanluovutussopimuksia vastineeksi sotilaallisesta suojelusta ja taloudellisesta avusta. 1860- ja 1870-luvuilla kuivuus, epäonnistuneet biisoninmetsästykset ja jatkuva sioux-uhka saattoivat poncat nälänhädän partaalle. Sen sijaan, että Yhdysvallat olisi noudattanut sopimusvelvoitteitaan, se luovutti Poncan maata siouxeille vuonna 1868. Sen sijaan, että liittovaltion hallitus olisi neuvotellut siouxien sopimuksen uudelleen, se siirsi poncat intiaanialueelle vuonna 1877.
Poncojen siirto hoidettiin törkeän huonosti. Yhdysvallat ei ainoastaan jättänyt saamatta ponca-päälliköiden suostumusta, vaan laiminlöi myös riittävät tilat sisältävän reservaatin perustamisen. Joidenkin arvioiden mukaan lähes 158, lähes kolmannes heimosta, menehtyi ensimmäisten Oklahomassa vietettyjen vuosien aikana. Poikansa kuoltua vuonna 1878 Ponca-alapäällikkö Standing Bear palasi Nebraskaan ryhmän seuraajien kanssa. Hänen pidätyksensä ja oikeudenkäyntinsä johtivat merkittävään päätökseen liittovaltion intiaanioikeudessa. Tuomioistuin päätti asiassa Standing Bear v. Crook (1879), että intiaanit tunnustettiin neljästoista lisäyksen nojalla henkilöiksi ja että he saattoivat siksi nostaa kanteen oikeuksiensa puolesta. Päätös jakoi heimon pohjoiseen ja eteläiseen joukkoon, sillä Standing Bearin seuraajat saivat jäädä Nebraskaan.
Eteläinen Ponca-heimo asettui pääpäällikkö White Eaglen johdolla 101 000 hehtaarin reservaattiin lähelle Salt Fork- ja Arkansas-jokien yhtymäkohtaa Cherokee Outletissa (nykyiset Kayn ja Noblen piirikunnat Oklahomassa). He perustivat talvileirejä Arkansas-joen varrelle ja jatkoivat heimotapojensa harjoittamista. He vuokrasivat suurimman osan maastaan euroamerikkalaisille maanviljelijöille ja karjankasvattajille, mukaan lukien Millerin veljekset 101 Ranchilta.
Ponca-kulttuuriin kohdistui paineita 1880- ja 1890-luvuilla. Agentit ja lähetyssaarnaajat pyrkivät lakkauttamaan perinteiset tanssit, avioliittokäytännöt ja uskonnolliset tavat. Heimojen vastustuksesta huolimatta hallitus määräsi vuonna 1892 myös jakopolitiikkansa, mikä johti lopulta siihen, että suuri osa heidän maistaan luovutettiin. Ponca-heimoon kohdistui jälleen paineita sen jälkeen, kun öljymies Ernest Whitworth Marland löysi öljyä reservaatistaan ja sen läheisyydestä vuonna 1911. Ponca- ja Tonkawa-öljykenttien kehittäminen aiheutti ympäristöongelmia, jotka pakottivat poncat hylkäämään talvileirinsä Arkansas-joen varrella ja siirtymään yksittäisille allotmenteille.
Näistä paineista huolimatta poncat jatkoivat kulttuurinsa muokkaamista. Monet liittyivät Millerin veljesten 101 Ranch Wild West Show’hun, joka antoi heille mahdollisuuden esittää uudelleen perinteisen elämäntapansa piirteitä. Peyote-uskonnon käyttöönotto antoi heille mahdollisuuden luoda oman versionsa kristinuskosta. Kaksi koulutettua nuorta poncaa, Frank Eagle ja Louis McDonald, olivat vuonna 1918 Amerikan alkuperäiskansojen kirkon perustajia.
Vuonna 1919 ensimmäisen maailmansodan ponca-veteraanit perustivat Amerikan legioonan osaston nimeltä Buffalo Post 38. Tämä järjestö elvytti sellaiset perinteiset sotaan liittyvät käytännöt kuin poncojen sotatanssi (heluska). Tanssi säilyi perinteisen ponca-kulttuurin keskeisenä ilmentymänä. Ponca-heimo tunnettiin kaikkialla Oklahomassa laulujen ja tanssien osaamisestaan. He vaikuttivat merkittävästi powwow-kulttuurin kehittymiseen eteläisillä tasangoilla. Vuonna 1926 Gus McDonald kruunattiin ensimmäiseksi fancy-tanssin maailmanmestariksi, minkä ansiosta Ponca-heimo sai kunnian järjestää maailmanmestaruuskilpailut joka vuosi. Vuosittainen Ponca-powwow, joka on yksi Oklahoman vanhimmista powwow’ista, järjestetään joka elokuu.
Vuonna 1950 ponca-heimo järjesti heimohallituksen vuoden 1936 Oklahoman intiaanien hyvinvointilain mukaisesti. Heimon päämaja sijaitsee White Eaglessa, viisi mailia Ponca Citystä etelään. Vuonna 1961 Ponca-aktivisti Clyde Warrior oli mukana perustamassa National Indian Youth Councilia. Warriorin vaatimus heimojen itsemääräämisoikeudesta tasoitti tietä uudelle intiaaniaktivistien sukupolvelle 1960-luvulla ja 1970-luvun alussa.
Myllerrys leimasi Ponca-heimon politiikkaa 1970- ja 1980-luvuilla. Syytökset petoksista ja huonosta hallinnosta johtivat siihen, että heimon hallintoelimen, heimon liiketoimintakomitean, virkamiesten vaihtuvuusaste oli suuri. Kun liittovaltion hallitus vähensi heimon rahoitusta 1980-luvulla, komitea aloitti bingotoiminnan lisätäkseen tuloja. Nykyään intiaanipelaaminen on yksi kiistanalaisimmista kysymyksistä Oklahoman osavaltion ja ponca-yhteisön välillä.
Oklahoman ja Nebraskan poncojen väliset suhteet paranivat sen jälkeen, kun Yhdysvaltain hallitus palautti jälkimmäisen tunnustuksen vuonna 1990. Siitä lähtien molemmat ovat tehneet yhteistyötä monissa asioissa, mukaan lukien ihmisten jäännösten ja esineiden kotiuttaminen alkuperäisamerikkalaisten hautojen suojelua ja kotiuttamista koskevan lain (NAGPRA, Native American Graves Protection and Repatriation Act) nojalla. Yksi Oklahoman Ponca-yhteisön suurimmista haasteista on heidän kielensä ja kulttuuriperinteidensä säilyttäminen. Vuonna 2003 Oklahoman Ponca-heimoon kuului 2 549 rekisteröityä jäsentä.