1. näytös
Darlingin lastenhuone
Kun herra ja rouva Darling valmistautuvat illanviettoon, kaksi heidän lapsistaan, Wendy ja John, leikkivät vanhempiaan. Kun rouva Darling huomaa Michaelin jääneen ulkopuolelle, hän saa hänet mukaan leikkiin ja osallistuu siihen kaikkien kanssa (”1, 2, 3”), jota vahtii koira Nana, heidän lastenhoitajansa. Kun herra Darling tulee solmion sitomista varten, hän kyseenalaistaa koiran hoitajaksi ottamisen, mutta rouva Darling puolustaa häntä. Edellisellä viikolla lasten nukkuessa Nana näki huoneessa pojan, joka lensi ulos ikkunasta ennen kuin Nana ehti ottaa sen kiinni ja jätti jälkeensä varjon, jonka rouva Darling on laittanut laatikkoon. Tästä huolimatta herra Darling vaatii, että Nana yöpyy alakerrassa. Rouva Darling ja lapset laulavat kehtolaulun (”Tender Shepherd”).
Lapset nukahtavat. Keiju, Helinä-keiju ja Peter Pan lentävät ikkunasta sisään etsimään varjoaan. Wendy herää pojan huutoihin, kun hän ei saa varjoaan takaisin kiinni, ja auttaa häntä ompelemalla sen takaisin kiinni. Peter on innoissaan, kun hänen varjonsa on kiinnitetty takaisin (”I’ve Gotta Crow”), ja kertoo Wendylle, että hän asuu Neverlandissa (”Never Never Never Land”) kadonneiden poikien kanssa. Wendy herättää veljensä, ja Peter kutsuu heidät kaikki Neverlandiin ja lupaa opettaa heidät lentämään. Pietari nousee iloisesti ilmaan (”Minä lennän”).
Pietari ripottelee lapsille keijupölyä ja kehottaa heitä ”ajattelemaan ihania ajatuksia” (”Minä lennän – Reprise”). Lapset seuraavat Pietaria, mutta Mikael palaa takaisin, kun sisäkkö Liza tulee huoneeseen, antaa hänelle keijupölyä ja kutsuu hänet mukaansa Mikä-mikä-maahan.
Toinen näytös Muokkaa
Mikä-mikä-maa
Mikä-maassa Pietarin ”kadonneet pojat” seisovat maanalaisen piilopaikkansa ulkopuolella ihmettelemässä, milloin Pietari palaa, kun he kuulevat kapteeni Koukun ja merirosvojensa äänen (”Merirosvojen laulu”). Pojat piiloutuvat. Koukku kertoo Smeelle, oikealle kädelleen, että hän haluaa tappaa Peterin, koska tämä katkaisi hänen kätensä ja heitti sen krokotiilille, joka on sittemmin alkanut pitää Koukusta ja seuraa häntä ympäriinsä. Koukun onneksi krokotiili on nielaissut kellon, joka tikittää ja varoittaa Koukkua sen läsnäolosta. Koukku törmää vahingossa piilopaikan sisäänkäyntiin ja kutsuu Smeen ja hänen miehensä taustamusiikiksi samalla, kun hän suunnittelee Poikien tuhoa (”Koukun tango”), runsasta kakkua, jossa on myrkyllinen kuorrutus. Koukku kuulee yhtäkkiä kovaäänisen tik-tak; krokotiili ilmestyy, mutta Koukku pakenee. Merirosvot pakenevat, ja Pojat ilmestyvät takaisin luullessaan olevansa turvassa. Yhtäkkiä ilmestyy joukko ”intiaaneja”, joita johtaa Tiikerililja (”Intiaanit”). He jättävät Pojat rauhaan ja jatkavat merirosvojen metsästystä.
Kadonneet pojat näkevät yhtäkkiä Wendyn taivaalla ja luulevat häntä linnuksi, ja yksi heistä ampuu nuolen. Peter, Michael ja John laskeutuvat maihin ja huomaavat nuolen juuttuneen Wendyn sydämeen, vaikka hän ei olekaan kuollut. Kadonneet pojat rakentavat talon hänen ympärilleen toivoen, että hänestä tulisi heidän äitinsä (”Wendy”), mihin hän herättyään suostuu. Koukku istuttaa kakun, mutta Wendy ei anna lasten syödä sitä, sillä hän tietää, ettei se tekisi heille hyvää; sen sijaan hän kertoo pojille tarinoita, muun muassa Tuhkimosta. Koukku on raivoissaan siitä, että pojat ovat löytäneet äidin. Hän suunnittelee sieppaavansa Wendyn ja Pojat, kun Smee ja merirosvot soittavat taas laulua ”My Tarantella”. Merirosvojen lähdettyä laivalleen Liza saapuu paikalle ja tanssii Neverlandin eläinten kanssa Peterin pitäessä vahtia talon ulkopuolella.
Muutama päivä kuluu, ja kaikilla on seikkailuja. Eräänä päivänä metsässä, sen jälkeen kun Peter johtaa Poikien hymniä (”I Won’t Won’t Grow Up”), he melkein törmäävät merirosvoihin, jotka ovat vanginneet Tiikerililjan ja sitoneet hänet puuhun. Peter piiloutuu ja matkii Koukun ääntä ja käskee miehiä vapauttamaan hänet. Kun Koukku saapuu paikalle, hän raivostuu ja vaatii ”metsän henkeä” puhumaan hänelle. Peter huijaa heidät kaikki luulemaan, että hän on Koukku ja että oikea Koukku on turska. Koukku pyytää ”henkeä” paljastamaan todellisen henkilöllisyytensä. Peter suostuu ja teeskentelee olevansa ”kaunis nainen” (”Oi, salaperäinen rouvani”), ja Koukku merirosvoineen yrittää väijyä Peteriä, mutta Tiikerililja ja hänen intiaaniheimonsa ajavat heidät karkuun.
Takaisin piilopaikassaan Pojat melkein ampuvat Tiikerililjan ja hänen heimonsa, kunnes Peter paljastaa heidän välillään vallitsevan aselevon. He polttavat rauhanpiippua ja vannovat ikuista ystävyyttä (”Ugg-a-Wugg”). Tiikerililja ja hänen intiaaninsa lähtevät vartioimaan yläpuolella olevaa taloa. Wendy pyytää Peteriä laulamaan pojille kehtolaulun (”Kaukainen melodia”), joka perustuu klassiseen satuun Tuhkimo. Michael ja John haluavat palata kotiin, ja Wendy myöntää, että myös hänellä on koti-ikävä. Pojat toivovat, että heillä olisi vanhemmat, ja Wendy tarjoaa heille kaikille omia vanhempiaan. Kaikki ovat innoissaan adoptiosta, paitsi Peter, joka sanoo, ettei lähde, koska tietää kasvavansa aikuiseksi, jos lähtee. Wendy kertoo hänelle tulevansa takaisin kerran vuodessa tekemään hänen kevätsiivouksensa.
Merirosvot hyökkäävät ja nujertavat intiaanit. He antavat Peterille väärennetyn merkin ”kaikki hyvin”, joten Peter lähettää Wendyn, hänen veljensä ja Kadonneet pojat surullisena matkaan. Ennen lähtöään Wendy laittaa Peterille ”lääkettä”, jonka tämä voi ottaa ennen nukkumaanmenoa. Wendyn lähdettyä itkuisena Peter, joka teeskenteli, ettei hän välitä, heittäytyy sängylle ja itkee itsensä uneen. Kun he lähtevät maanalaisesta talosta, merirosvot ottavat Wendyn ja pojat kiinni. Koukku hiipii sitten piilopaikkaan ja myrkyttää Peterin lääkkeet. Helinä-keiju herättää Peterin, kertoo hänelle väijytyksestä ja varoittaa häntä myrkystä, mutta Peter torjuu hänet ja valmistautuu pelastamaan hänet. Epätoivoissaan hän juo myrkyn itse. Kuolemaisillaan hän kertoo Pietarille, että jos kaikki keijuihin uskovat tytöt ja pojat taputtaisivat käsiään, hän jäisi henkiin. Peter pyytää yleisöä uskomaan ja taputtamaan käsiään. He tekevät niin, ja Helinä-keiju pelastuu. Pietari nappaa miekkansa ja lähtee pelastamaan Wendyä ja poikia.
III näytös Muokkaa
The Jolly Roger
Hook iloitsee menestyksestään (”Hook’s Waltz”). Kun lankkua valmistellaan, Koukku kuulee krokotiilin tikittää ja joutuu paniikkiin. Kyseessä on itse asiassa Peter kellon kanssa, ja Koukun lymyillessä Peter ja pojat auttavat intiaanit, eläimet ja Lizan laivaan ja piiloon. Peter piiloutuu komeroon ja tappaa kaksi merirosvoa, jotka Koukku lähettää paikalle. Kolmas merirosvo, Starkey, kieltäytyy tottelemasta Koukun käskyä mennä sisään ja hyppää yli laidan. Sitten merirosvot kantavat pojat sisään, ja pojat teeskentelevät pelkäävänsä, kun heidät kannetaan sisään. Peter naamioituu merirosvoksi, ja merirosvot luulevat, että ”doodle-doo” (joka on saanut nimensä siksi, että Peter varisee yhä merirosvojen tappamisen jälkeen) tappoi kaikki Pojat. Koukku uskoo, että laiva on nyt kirottu, ja kaikki luulevat, että Wendy on sen lähde. Merirosvot työntävät Wendyn lankulle. Peter riisuu valepukunsa, ja intiaanit ja eläimet hyökkäävät, samoin kuin Pojat, jotka ovat elossa ja aseistettuja. Merirosvot kukistetaan, ja Peter haastaa Koukun kaksintaisteluun ja voittaa hänet. Koukku uhkaa räjäyttää laivan pommilla, mutta törmää oikeaan krokotiiliin (jonka Peter toi myös laivaan). Peter ottaa pudonneen pommin kiinni ja heittää sen mereen sen jälkeen, kun Koukku liukuu lankkua pitkin (joka on liukumäen muotoinen) krokotiili perässään. Kun Peter laittaa sormensa korviinsa, pommi räjähtää ja Koukku joko räjähtää kappaleiksi tai krokotiili syö hänet. Kaikki ylistävät Peteriä (”Finale: I’ve Gotta Crow” ). Ennen kuin Darlingin lapset ja Kadonneet pojat lähtevät Lontooseen, Liza pyytää Peteriä opettamaan häntä varikseksi (”Finale: I’ve Gotta Crow” ).
Kotona Darlingit istuvat lastentarhan ikkunan ääressä yö toisensa jälkeen toivoen lastensa paluuta. Lapset ilmestyvät hiljaa ja laulavat äidilleen (”Tender Shepherd” ). Darlingit suostuvat iloisesti adoptoimaan kadonneet pojat (”Loppu: Me kasvamme”). Wendy lupaa odottaa Peteriä ja toivoo, että Peter jonain päivänä palaa hänen luokseen.
Vuodet kuluvat, ja Peter palaa lastentarhaan yllättäen paljon vanhemman Wendyn, joka ei enää odottanut häntä. Hän on tullut viemään Wendyn Neverlandiin kevätsiivoukseen, mutta Wendy kieltäytyy, sillä hän on nyt aikuinen, naimisissa ja hänellä on oma tytär Jane. Peter alkaa itkeä, ja Wendy poistuu huoneesta, kun hänen miehensä ääni kuuluu näyttämön ulkopuolelta. Jane herää ja kysyy äitinsä tavoin: ”Poika, miksi sinä itket?”. Peter esittäytyy, mutta Jane tietää hänestä kaiken äitinsä kertomuksista. Hän on odottanut miehen vievän hänet Neverlandiin ja opettelevan lentämään. Peter, joka on nyt taas onnellinen, heittää tytölle keijupölyä, mutta kun he ovat lähdössä, Wendy yrittää estää heitä sanomalla: ”Voi, kunpa voisin lähteä mukaasi!”. Esityksen koskettavimpana hetkenä Peter vastaa surullisesti mutta ymmärtävästi hymyillen: ”Et voi. Näetkö, Wendy … olet liian aikuinen”. Niinpä Wendy päästää Janen vastentahtoisesti menemään, ”vain kevätsiivouksen ajaksi”. Hänen tyttärensä ja ”poika, joka ei halunnut kasvaa aikuiseksi”, lentävät yöhön Wendyn katsellessa ikkunasta. (”Loppu: Ei koskaan koskaan maa”)